17 de junio de 2009
Este video documenta los métodos de recogida de muestras de agua marina costera y su procesamiento para diversas aplicaciones de aguas abajo como la concentración de biomasa, la purificación de ácidos nucleicos, la abundancia de células, los nutrientes y análisis de trazas de gas.
Hola, soy Elena Kova del Laboratorio de Stephen Hallam en el Departamento de Microbiología e Inmunología de la Universidad de Columbia Británica. Hoy les mostraremos un procedimiento para recolectar agua de mar destinada al análisis físico, químico y biológico. Utilizamos este procedimiento en nuestro laboratorio para estudiar los parámetros oceanográficos de las aguas marinas.
Entonces, comencemos. Primero, se asigna el número de lanzamientos y las profundidades en cada uno, luego se determinan las profundidades que se van a muestrear y el volumen total que se recopilará para el lanzamiento actual. Asegúrese de que los dispositivos de muestreo de flujo continuo y de agua cinética estén en posición abierta y de que todas las válvulas y grifos estén cerrados.
Sujete el CTD a la base de la línea y bájelo al agua hasta la profundidad más profunda del perfil. Coloque inmediatamente un dispositivo de muestreo en la línea, justo después del CTD. Asegúrese de que la línea esté correctamente colocada en el soporte del dispositivo y de que los tornillos estén bien apretados.
Sujete un mensajero con peso a cada dispositivo, excepto al del intervalo de muestreo más profundo, antes de introducirlo en el agua. Baje la línea hasta la distancia entre la primera profundidad especificada y la siguiente, luego prepare otro dispositivo de muestreo. Tenga en cuenta que en los intervalos de profundidad donde se recolectan muestras de agua de gran volumen, se cargan consecutivamente un total de dos botellas de 12 litros cada una, separadas aproximadamente 0,75 metros.
Una vez que todos los dispositivos estén en la línea, baje la línea hasta la profundidad máxima y espere dos minutos. Envíe un mensajero hacia abajo, accionando cada dispositivo para que pase a la posición cerrada. Espere unos minutos antes de recuperar la línea.
Para asegurarse de que todos los dispositivos estén cerrados, enrolle la cuerda y descargue cada dispositivo sobre la cubierta a medida que emerge del agua. Para profundidades que requieran grandes volúmenes de muestra para la purificación de proteínas, ADN o ARN, utilice dos dispositivos de muestreo en serie. Recolecte inmediatamente el ARN de una botella y filtrelo a bordo del barco.
Después de muestrear los productos químicos y nutrientes en la otra botella, vierta el agua restante en el carro para obtener un volumen final de 20 litros. Para muestras de bajo volumen, reserve un litro de agua para filtración en botellas estériles de Nalgene. Típicamente, las muestras de bajo volumen procedentes de 16 intervalos de profundidad se recolectan como 16 muestras de un litro y seis muestras de 20 litros se recolectan como muestras de alto volumen.
Al recoger muestras de gas, tome siempre muestras de oxígeno y de gases traza. Primero, conecte un trozo delgado de tubo al grifo del dispositivo de muestreo de agua. Coloque el otro extremo del tubo en los frascos de suero glos.
Lave el frasco de suero tres veces, pero con agua de la muestra y llénelo hasta el rebosamiento de forma que no queden burbujas de aire. Añada 50 microlitros de cloruro mercúrico al frasco de suero. Tenga cuidado de no introducir burbujas de aire en la muestra.
Cierre el frasco del suero con un tapón de goma y selle con una tapa de aluminio, luego almacénelo sobre hielo para recolectar muestras destinadas a mediciones de nutrientes, incluyendo nitrato, fosfato y silicato. En primer lugar, enjuague una jeringa de 60 cc con agua de la muestra. A continuación, conecte en línea un filtro acro disco de 0,2 micrómetros.
Empuje aproximadamente dos ml de agua a través de la jeringa para purgar el filtro. Enjuague un frasco de polietileno con aproximadamente 10 ml de agua filtrada tres veces.
Agite la botella al enjuagarla, luego agregue agua de la muestra filtrada hasta llenar aproximadamente tres cuartas partes de las botellas. Almacene la muestra sobre hielo. Vacíe los tubos de recolección con agua distal para recolectar muestras destinadas a mediciones de amoníaco.
En primer lugar, enjuague los tubos de recolección, pero elimine completamente el agua de la muestra. Llene un cilindro graduado de 10 ml con agua de la muestra y vierta cinco ml del agua de la muestra fuera del cilindro graduado, vaciando el resto del cilindro. A continuación, agregue nuevamente los cinco ml al cilindro vacío.
Una vez que se hayan recolectado muestras de todas las profundidades, añada 7,5 ml del reactivo de trabajo de amonio a cada tubo. Para recolectar muestras para el recuento celular, llene un tubo Falcon de 50 ml previamente etiquetado que contenga 5,4 ml de formaldehído al 37 % hasta la marca de 50 ml, para obtener una concentración final del 4 %. Tenga cuidado de no rebosar el tubo. Almacene la muestra sobre hielo durante la recolección de muestras.
Para mediciones de sulfuro de hidrógeno. Llene hasta arriba un tubo Falcon de 50 ml preetiquetado que contiene tres ml de acetato de zinc al 20 %. Tenga cuidado de no derramar el contenido del tubo.
Guarde la muestra en hielo para recolectar volúmenes pequeños. Para la concentración de biomasa. Llene hasta el tope botellas Nalgene de un litro para recolectar grandes volúmenes destinados a la concentración de biomasa.
Llene garrafas de 20 litros hasta arriba. El resultado final del muestreo de agua de mar arroja aproximadamente entre 32 y 48 muestras de gas y 32 muestras de amonio.
16 muestras de sulfuro de hidrógeno. 16 muestras para recuentos celulares. Seis botellas de 20 litros, 16 botellas de un litro y cuatro sterex.
Los filtros de 2,2 µm que contienen biomasa microbiana se conservan para un posterior aislamiento de ARN. Acabamos de demostrar cómo recolectar diferentes tipos de muestras de agua para análisis bioquímico.
Esto requiere una gran cantidad de preparación y planificación. Por lo tanto, presupueste dos días antes del viaje para organizar las cosas y un día después para la limpieza; no permita que el agua salada entre en contacto con una bomba peralt ni con la caja de aluminio zago utilizada para transportar el equipo de campo. Trate el equipo con respeto y le servirá bien durante mucho tiempo.
Así que eso es todo. Gracias por ver este video y buena suerte con sus experimentos.
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Este video documenta los métodos para recolectar muestras de agua marina costera y procesarlas para diversas aplicaciones posteriores, incluyendo la concentración de biomasa, la purificación de ácidos nucleicos, la abundancia celular, y los análisis de nutrientes y gases traza.
Protocolos sólidos de muestreo y recolección de agua de mar son fundamentales para generar conjuntos de datos de alta calidad en el descubrimiento de biofármacos marinos, permitiendo una evaluación precisa de variables ambientales y materiales biológicos. Estos métodos sustentan análisis posteriores, como la purificación de ácidos nucleicos, la cuantificación de la abundancia celular y el perfilado de nutrientes, que son cruciales para la validación de objetivos y la reducción de riesgos mecanicistas en el descubrimiento de fármacos derivados del medio marino. La recolección estandarizada garantiza la reproducibilidad y comparabilidad entre programas de descubrimiento, apoyando la toma de decisiones a nivel de cartera.
Los métodos de muestreo y recolección de agua de mar se sitúan al principio del continuo de descubrimiento de biofármacos marinos, proporcionando material fundamental para flujos de trabajo que abarcan la validación de objetivos, el cribado y la investigación traslacional.