Name: Gradiente desnaturalizante electroforesis en gel (DGGE) (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-02-25T00:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 52 s
Description: Aprende a perfilar comunidades bacterianas en biofilms mediante electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE). Este método analiza secuencias de 16S rRNA para estudiar la dinámica microbiana en el tiempo y el espacio.

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Los autores no tienen nada que revelar.

gradiente desnaturalizante electroforesis en gel (dgge)

Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)

Gradiente desnaturalizante electroforesis en gel (DGGE)

Vale. Hola, mi nombre es Celeste Peterson y soy investigadora en la Universidad de Harvard, estudiando comunidades microbianas de biopelículas. Estoy caracterizando las comunidades bacterianas analizando su secuencia de 16S y cómo esta secuencia cambia en el tiempo y en el espacio. Para ello, estoy utilizando DGGE.Esta no es una electroforesis normal de mi pozo, debe mantenerse a 60 grados durante su ejecución y el tampón debe bombearse continuamente. Así que vamos a calentar el tampón durante aproximadamente una hora hasta que alcance los 60 grados, y luego podremos realizar la corrida. Ahora voy a lavar esta placa con una solución diluida de uc, eliminando las impurezas, y uno, encender eso.Algo así puede provocar irregularidades. Es importante eliminar toda el agua. Por lo tanto, cuando monte el gel, colocaré ese chip en la parte exterior del gel.Entonces, el gel quedará entre estas dos piezas de vidrio y el chip estará en el exterior y no afectará al gel que está en el interior. Ahora voy a ensamblar el gel en estas pinzas y luego las apretaré juntas y ajustaré girando hacia la derecha. Como con cualquier gel, es importante asegurarse de que la base esté alineada.Para evitar la

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Research

Investigación

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Biology

Biología

Poliacrilamida electroforesis en gel de urea se utiliza para separar una sola cadena de ADN o ARN, hasta un límite de 500 nucleótidos. Urea en combinación con el calor desnaturaliza las muestras y no estructurados cadenas simples migrar dentro de la matriz de gel de acuerdo a su peso molecular.

Poliacrilamida electroforesis en gel de urea (urea PÁGINA)

Un protocolo básico para la separación de fragmentos de ADN usando electroforesis en gel de agarosa se describe.

Electroforesis en gel de agarosa para la separación de los fragmentos de ADN

Este video muestra la separación bidimensional de fibras amiloides basada en electroforesis con gel de agarosa y detergente semidesnaturalizante. La técnica separa los agregados polimórficos de amiloide en función de su tamaño heterogéneo.

Electroforesis bidimensional semidesnaturalizante en gel de agarosa: una técnica para separar fibras de amiloide polimórficas en función de la heterogeneidad de tamaño

En este video, demostramos un método de electroforesis en gel bidimensional que separa proteínas individuales de una mezcla compleja de proteínas obtenidas de tejidos tumorales de adenoma hipofisario humano no funcional (NFPA). Las proteínas se separan en función de su carga eléctrica en la primera dimensión y se separan aún más en función de los pesos moleculares en la segunda dimensión.

Electroforesis bidimensional en gel de poliacrilamida: una técnica de separación para el análisis de proteínas en mezclas complejas de proteínas basada en la carga y el peso molecular

La detección rápida y la cuantificación confiable de los eventos de edición de ARN a escala genómica siguen siendo un desafío y actualmente dependen de métodos de secuenciación directa de ARN. El protocolo descrito aquí utiliza la electroforesis en gel de gradiente de microtemperatura (μTGGE) como un método simple, rápido y portátil para detectar la edición de ARN.

Un enfoque no secuenciador para la detección rápida de la edición de ARN

Este video muestra el protocolo de un ensayo de angiogénesis in vitro que recapitula varias etapas de la angiogénesis. Time-lapse imágenes de germinación, la formación del lumen, ramas y anastomosis - las características clave de la angiogénesis - se muestran.

Optimizado de gel de fibrina bolas de ensayo para el Estudio de la angiogénesis

Se describe un protocolo para la microfabricación del dispositivo de generación de gradiente de microfluidos que puede generar gradientes espaciales y temporales bien definidos microambiente. En este enfoque, el dispositivo de microfluidos gradiente de generación se pueden utilizar para estudiar la migración celular dirigida, la embriogénesis, la cicatrización de heridas y la metástasis del cáncer.

Un dispositivo de microfluidos gradiente de generación de Biología Celular

SDD-AGE es una técnica útil para la detección y caracterización de polímeros como el amiloide en las células. Aquí se demuestra una adaptación que hace que esta técnica susceptible de aplicaciones a gran escala.

La detección de la agregación amiloide de Semi-desnaturalización electroforesis en gel de agarosa-detergente

Se describe un método para la extracción de ADN de alto peso molecular genómico a partir de biomasa planctónica se concentró en 0,22 micras filtros Sterivex, seguido por centrifugación en gradiente de densidad de cloruro de cesio para la purificación.

Extracción de ADN de 0,22 M Filtros Sterivex y centrifugación de densidad de cloruro de cesio Gradient

En este video, se describe la caracterización de los complejos multiproteicos (PSM) por el azul electroforesis nativa en gel de poliacrilamida (BN-PAGE). En una primera dimensión, se dializan lisados ​​celulares están separados por BN-PAGE para identificar PSM individual. En una segunda dimensión SDS-PAGE, PSM de interés se subdividen para analizar sus componentes por inmunotransferencia.

Azul nativos electroforesis en gel de poliacrilamida (BN-PAGE) para el análisis de los complejos Multiproteinas de lisados ​​celulares

Aprende a perfilar comunidades bacterianas en biofilms mediante electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE). Este método analiza secuencias de 16S rRNA para estudiar la dinámica microbiana en el tiempo y el espacio.

Gradiente desnaturalizante electroforesis en gel (DGGE)

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