Siembra de ARNi para la alimentación de C. elegans: una técnica para inducir la expresión de dsRNA diana en E. coli

0 vistas3:24 min • April 30th, 2023

- En C. elegans, el ARNi puede ser inducido alimentando a los gusanos con bacterias que expresan ARN bicatenario o dsRNA a partir de un plásmido de ADN recombinante.

Para empezar, cultive E. coli HT115 resistente a la tetraciclina transfectada con plásmido L4440 durante la noche en placas de agar LB selectivas que contengan tetraciclina y ampicilina, o su análogo funcional carbenicilina. Además del ADN diana, el plásmido contiene un gen para la resistencia a la ampicilina. Solo las colonias de bacterias que heredan el plásmido pueden crecer en presencia de estos antibióticos.

A continuación, coseche las colonias de bacterias y expándalas en medio LB líquido hasta la concentración deseada. Para inducir la expresión de dsRNA, transfiera la solución de bacterias a un medio de crecimiento de nematodos preparado, o NGM, placas de agar que contengan IPTG.

En este sistema de expresión, IPTG imita a la lactosa para inactivar el represor de lac, lo que permite la expresión de la ARN polimerasa T7. En el plásmido, la expresión del ADN diana está regulada por dos promotores T7 convergentes. En consecuencia, se transcriben secuencias sensoriales y antisentido que conducen a la expresión de dsRNA.

Por último, el gusano utiliza la información de la secuencia del dsRNA ingerido para regular a la baja los ARNm endógenos con secuencias complementarias. En este experimento, prepararemos placas de ARNi con E. coli transgénica para la alimentación de C. elegans.

- Para las placas de ARNi, cargue placas de 6 centímetros con agar NGM que contenga IPTG y carbenicilina. Déjalos secar de 24 a 48 horas a temperatura ambiente en la oscuridad. Luego, transfiéralos a 4 grados centígrados durante un máximo de 14 días.

A continuación, placas selectivas de rayas que contienen carbenicilina y tetraciclina con clones de bacterias RNAi con plásmido L4440 portadores del gen lin-53. Utilice un patrón de rayas trifásico y asegúrese de colocar un control vectorial vacío. Luego, cultive las placas durante la noche a 37 grados centígrados.

Al día siguiente, elija al menos tres colonias individuales e inocule cada una de ellas en un tubo de cultivo separado con 2 mililitros de LB suplementado con carbenicilina, pero no con tetraciclina. Planee tener tres cultivos saludables por afección.

A continuación, cultive los cultivos durante la noche a 37 grados centígrados hasta que alcancen una densidad óptica a 600 nanómetros de 0,6 a 0,8. A continuación, añada 500 microlitros de cada cultivo bacteriano a una placa de ARNi de agar NGM de 6 centímetros. Incube las placas durante la noche a temperatura ambiente en la oscuridad.

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Última actualización: 22 agosto 2026