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Comience con Legionella pneumophila, un patógeno respiratorio que expresa un componente del sistema de secreción marcado con fluorescencia necesario para la infección del huésped.
Para cuantificar la polaridad de estos componentes, adquiera imágenes de fluorescencia y ajuste el contraste para distinguir las células individuales.
Coloque regiones rectangulares desde el polo celular hacia el citoplasma para medir los gradientes de fluorescencia.
Enmascare estas regiones para extraer la intensidad media y la varianza, luego calcule las puntuaciones de polaridad como relaciones de varianza a intensidad media.
Las puntuaciones de polaridad altas indican un reclutamiento dirigido de componentes en los polos bacterianos.
Para mediciones dinámicas, capture dos imágenes de lapso de tiempo y ajuste el contraste para visualizar las celdas con claridad.
Coloque regiones cuadradas en el centro de la célula para medir la fluorescencia citosólica.
Enmascare celdas enteras para corregir el fotoblanqueo y defina regiones de fondo entre celdas para la sustracción de ruido.
Exporte todas las intensidades y calcule el cambio en la fluorescencia a lo largo del tiempo.
El aumento de la intensidad indica agrupación, mientras que la disminución de la intensidad refleja la redistribución dinámica de los componentes de secreción dentro de las bacterias.
Para cuantificar la polaridad, ajuste el contraste de la imagen para que las bacterias sean claramente visibles.
Luego amplíe la región de interés y use la herramienta de región para colocar un rectángulo de 0.25 por 1.3 micrómetros comenzando en el polo y extendiéndose hacia el citoplasma, asegurándose de que el rectángulo permanezca dentro de los bordes bacterianos.
Marque al menos 200 bacterias y cree máscaras utilizando el botón región para enmascarar en el menú analizar. Haga clic en estadísticas de máscara y elija el objeto en el alcance de la máscara. Luego marque la intensidad media y la varianza en características e intensidad.
Exporte los datos como un archivo de texto y use la aplicación de hoja de cálculo para calcular los puntajes de polaridad de cada bacteria como la relación entre la varianza y la intensidad media.
Para cuantificar la dinámica de las proteínas de fusión, abra la ventana de captura de imágenes y marque el lapso de tiempo.
Escriba dos en el cuadro número de puntos de tiempo. Adquiera dos imágenes sucesivas de Legionella Pneumophila que expresan la proteína fluorescente de interés.
Ajuste el contraste de la imagen hasta que las celdas sean claramente visibles. Luego use la herramienta de región para colocar un cuadrado de 0.25 por 0.25 micrómetros en el medio de al menos 400 celdas.
A continuación, use el botón región para enmascarar en el menú analizar para crear una máscara de los cuadrados de interés. Cree una nueva máscara vacía y use la herramienta de píxeles para marcar toda el área de la celda de al menos 25 celdas aleatorias. Crea otra máscara y usa la herramienta de pincel grande para marcar áreas entre las celdas.
Finalmente, seleccione estadísticas de máscara y asegúrese de que el objeto esté seleccionado en el alcance de la máscara para la máscara uno. En características e intensidad, elija intensidad media. Exporte los datos y repita el proceso para la máscara 2. Para la máscara 3, seleccione toda la máscara y exporte la intensidad media.