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Las vesículas extracelulares o EV son vesículas de tamaño nanométrico, heterogéneas y unidas a la membrana secretadas por varias células, incluidas las células tumorales cerebrales. Las VE pequeñas son una subpoblación que comprende VE derivadas de endosómicos y de membrana.
Para purificar los vehículos eléctricos pequeños, comience tomando vehículos eléctricos preextraídos suspendidos en un tampón suplementado con sacarosa que mantiene una solución homogénea y preserva la integridad estructural de los vehículos eléctricos.
A esta solución, entonces, agregue un volumen apropiado de yodixanol, un medio de gradiente de densidad inerte y no tóxico, para lograr la densidad deseada.
El yodixanol solubiliza las proteínas contaminantes para eliminarlas posteriormente.
A continuación, agregue capas de soluciones de yodixanol de densidades sucesivamente decrecientes para crear un gradiente de densidad discontinuo.
Centrifugar el tubo a alta velocidad.
Dependiendo de sus tasas de flotación, los vehículos eléctricos más densos migran a una capa igualmente densa de medio de gradiente, mientras que los vehículos eléctricos menos densos migran más a una capa más liviana, y los contaminantes más densos forman un gránulo en el fondo del tubo.
Ahora, transfiera pequeñas fracciones de las capas de gradiente en tubos nuevos que contengan un tampón adecuado.
A continuación, centrifugar los tubos a ultra alta velocidad en condiciones de refrigeración.
Durante la centrifugación, la baja temperatura evita que los vehículos eléctricos sufran daños por calor inducido por alta velocidad.
Después de que los EV puros se despaguen, retire el sobrenadante. Vuelva a suspender los EV en un tampón apropiado y proceda a la caracterización y el análisis proteómico.
Primero, agregue 1,5 mililitros de yodixanol al 60% a los 1,5 mililitros del tampón sacarosa / Tris que contiene los EV para crear una solución final que contenga yodixanol al 30%. Pipetea hacia arriba y hacia abajo varias veces para mezclar bien la solución.
Transfiera esta solución al fondo de un tubo de ultracentrifugación de 5,5 mililitros. A continuación, mezcle el caldo de yodixanol al 60% con agua ultrapura para preparar al menos 1,5 mililitros de una solución de yodixanol al 20% y al 10%.
Con una jeringa y una aguja de 18G, mida 1,3 mililitros de la solución de yodixanol al 20% y colóquela cuidadosamente sobre el gradiente inferior.
Mantenga el bisel de la aguja en contacto con el interior del tubo justo encima del menisco y agregue la solución gota a gota para evitar mezclar las capas en la interfaz de densidad.
Luego, coloque una capa de 1,2 mililitros de la solución de yodixanol al 10% sobre la capa al 20% utilizando la misma técnica. Equilibre y cargue cuidadosamente los tubos de ultracentrifugación en cubos de rotor.
Ajuste las velocidades de aceleración y desaceleración de un rotor de cubeta oscilante a las velocidades mínimas y centrifugue a 268.000 x g y a 4 grados centígrados durante 50 minutos.
Mientras se centrifuga la muestra, etiquete diez tubos de microcentrífuga de 1,5 mililitros para cada muestra que correspondan con las fracciones 1 a 10 del gradiente de densidad.
Una vez completada la centrifugación, retire suavemente los tubos de los cubos del rotor y colóquelos en un soporte estable. Pipetear 10 fracciones seriadas de 490 microlitros desde la parte superior del gradiente en los tubos correspondientes.
Con un refractómetro, mida los índices de refracción de las fracciones. Luego, transfiera cada fracción a un tubo de ultracentrifugación limpio de 12 mililitros.
Agregue 5 mililitros de 1x PBS a cada tubo y pipetee hacia arriba y hacia abajo lentamente para mezclar. Agregue 6 mililitros adicionales de 1x PBS en la parte superior del tubo y mezcle cuidadosamente nuevamente.
Ultracentrifugar los tubos a 100.000 x g y a 4 grados centígrados para volver a granular las vesículas pequeñas. Decantar el sobrenadante y secar los tubos antes de lisar las vesículas para el análisis de proteínas o volver a suspender las VE para el análisis morfológico.