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Los anticuerpos neutralizantes, o NAb, son secretados por las células para protegerlas contra los virus invasores.
Para estudiar las interacciones de los NAb con los virus, utilice partículas similares a virus modificadas o VLP. Estas estructuras de tamaño nanométrico contienen un conjunto de proteínas derivadas de virus sin material genético viral, lo que las hace no infecciosas. Las VLP están rodeadas por una bicapa lipídica incrustada con glicoproteínas de envoltura antigénicas, que presentan un epítopo neutralizante, una región especializada a la que se unen los NAb.
Agregue las VLP a un tubo que contenga anticuerpos neutralizantes unidos a perlas magnéticas conjugadas con proteínas. Incube bajo agitación para evitar que las perlas se asienten. Durante la incubación, la región del epítopo de las VLP reconoce el paratopo complementario en la región Fab de los NAb, lo que da como resultado complejos antígeno-anticuerpo. Esto, a su vez, ayuda a las perlas magnéticas a capturar las VLP.
Coloque el tubo en una rejilla de separación equipada con un imán fuerte. Bajo la influencia de un campo magnético, las perlas complejadas con VLP se mueven hacia el imán sin perturbar la interacción antígeno-anticuerpo. Este paso captura las VLP unidas, mientras que las que carecen de antígenos específicos permanecen en el sobrenadante.
Deseche el sobrenadante y lave el sedimento con tampón de lavado para eliminar las VLP no unidas. Vuelva a suspender los complejos VLP-perlas en un tampón de elución, lo que hace que las VLP se desenganchen de las perlas y aparezcan en el sobrenadante.
Aspire las VLP aisladas que muestran antígenos en un tubo nuevo y guárdelas en refrigeración para su posterior análisis.
Comience resuspendiendo las perlas magnéticas pipeteando hacia arriba y hacia abajo o mezclando en un rotador a 50 RPM durante al menos 5 minutos.
Mientras tanto, prepare la solución de anticuerpos que contiene los bNAb. Use 10 microgramos de cada bNAb y 200 microlitros de tampón de lavado y unión de anticuerpos por reacción. Para cada reacción, transfiera 50 microlitros de la solución de perlas magnéticas a un tubo de reacción de 1,5 mililitros, luego, coloque los tubos en la rejilla de separación magnética.
Espere hasta que las cuentas se junten en la pared del tubo para asegurarse de que se recolecten todas las cuentas, luego, retire el sobrenadante. Retire el imán y suspenda las perlas en 200 microlitros de la solución de bNAb previamente preparada.
Incube durante 30 minutos a 3 horas, mientras mezcla en un rotador a 50 RPM a temperatura ambiente. Después de la incubación, coloque los tubos de reacción en la rejilla de separación magnética, espere y retire el sobrenadante.
Retire los tubos del imán y lave las perlas resuspendiendo en 200 microlitros de tampón de lavado y unión de anticuerpos. Repita el lavado con la unión de anticuerpos y el tampón de lavado, eliminando la mayor cantidad posible de tampón de lavado cuando termine.
Agregue las muestras a los bNAb unidos a cuentas. Si el volumen de muestra agregado es inferior a 1 mililitro, agregue PBS para ajustar el volumen de muestra a 1 mililitro, luego, vuelva a suspender las perlas pipeteando suavemente. Incube las muestras y las perlas durante 2,5 horas en un rotador a temperatura ambiente, asegurándose de que las perlas permanezcan en suspensión y que la solución se mezcle bien durante la incubación.
Coloque los tubos en el imán y retire el sobrenadante. Luego, lave las perlas magnéticas suspendiéndolas en 200 microlitros de tampón de lavado. Suspenda las perlas en 100 mililitros de tampón de lavado y transfiera la suspensión a un tubo de reacción limpio y resistente al calor. Coloque el tubo en la rejilla de separación magnética y retire el sobrenadante por completo.
Para preparar muestras SDS-PAGE desnaturalizadas, suspenda las perlas en 20 a 80 microlitros de tampón Laemmli e incube a 95 grados centígrados durante 5 minutos. Proceda directamente con SDS-PAGE, colocando los tubos en una rejilla magnética para separar las perlas de la solución. Alternativamente, almacene las muestras a -20 grados centígrados.