Name: LabVIEW operado Novela Osmometer nanolitros de Investigaciones de hielo de fijación con proteínas (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2013-02-04T09:50:00.000+00:00
Duration: 9 min 32 s
Description: Aprende a medir la histéresis térmica de proteínas de unión al hielo (IBPs) usando un osmómetro nanolitrico controlado por LabVIEW. Este método permite analizar con precisión el crecimiento y la forma de cristales de hielo mediante microscopía de video para aplicaciones en criopreservación.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Esta investigación fue apoyada por la ISF, NSF, y ERC. Queremos reconocer la ayuda técnica con la etapa de temperaturas de Randy Milford, Michael Koren, Shafer Doug y Jeremy Dennison. Asistencia en el desarrollo de software fue proporcionado por O Chen, Xu Di, Sannareddy Rajesh, y Bhattachary Sumit. Nos gustaría agradecer a nuestros colaboradores el profesor Peter L. Davies y el Dr. Laurie A. Graham para la proteína de fusión IBP y útiles debates. También queremos agradecer a los miembros del laboratorio del Dr. Maya Bar-Dolev, Qin Yangzhong, Dr. Yeliz Celik, el Dr. Natalya Pertaya, Mizrahy Ortal, y Guy Shlomit por su retroalimentación de los usuarios.

0. Procedimientos preliminares <ol><li> Capilar de vidrio para inyección solución. Usando un extractor capilar (Narishige, Tokyo, Japón), preparar una pipeta agudo con una abertura fina de un tubo capilar de vidrio micro (Marca GMBH, Wertheim, Alemania). El tamaño de la abertura debe ser verificada haciendo pasar aire a través del capilar para obtener burbujeo fino en agua limpia. Si el capilar se cierra, entonces se puede abrir rompiendo su borde. Esto puede conseguirse pulsando o rascarse suavemente contra el agua que contiene paredes de los tubos. Preparar el capilar tal que la abertura está casi bloqueado, pero es lo suficientemente abierto para permitir la formación de burbujas de menos de un milímetro. </li><li> Limpieza Cobre disco. Sonicar los discos de cobre durante 10 minutos en 0,1% Micro-90 jabón (Cole-Parmer, Vernon Hills, Illinois, EE.UU.), luego lavar con agua doblemente destilada. Introducir los discos en una mezcla de isopropanol (técnico) y sonicar solución de nuevo durante 10 min. Aletaaliado, se secan los discos con aire filtrado. Esta etapa de limpieza es crítica para evitar la contaminación IBP entre los experimentos. </li><li> Doble capa de montaje cubreobjetos. Un conjunto de cubreobjetos se preparó para permitir la observación de la muestra sin condensación de humedad sobre la superficie de vidrio cubierta. Esto se logró mediante la colocación de un Drierite (WA Hammond Drierite, Xenia, Ohio, EE.UU.) partícula (2 mm de diámetro) entre dos cubreobjetos que fueron pegados a continuación con una pistola de pegamento caliente. Esta configuración impide la condensación que podría bloquear la vista cuando la muestra se enfrió a bajas temperaturas y elimina la necesidad para soplar aire seco a la ventana de observación. </li></ol> 1. Etapa de enfriamiento Set-up <ol><li> Conectar la entrada de flujo de agua y la salida de la etapa de enfriamiento a 4 mm de diámetro interno Tygon tubos (Saint-Gobain, París, Francia), y conecte el flujo de agua del tubo de entrada a una bomba de agua. </li><li> Conectar un tubo de 4 mm interior Tygon diámetro a la entrada de la etapa de enfriamiento to suministrar aire seco. El aire se secó usando una columna en línea de Drierite. </li><li> Operar las bombas de aire y agua. Tenga en cuenta que los elementos de refrigeración no debe funcionar sin un disipador de calor. </li><li> Encienda el controlador de temperatura, cámara, y la rutina de LabVIEW. </li></ol> 2. Preparación de la muestra <ol><li> Colocar una gota de 3-4 l de aceite de inmersión B (Cargille laboratorios, Cedar Grove, Nueva Jersey, EE.UU.) en el lado posterior de un disco de diámetro de cobre de 7 mm que tiene 500 agujeros perforados mu m a través del disco. </li><li> Colocar el disco de cobre en la etapa de enfriamiento con el lado del aceite de inmersión hacia abajo. </li><li> Conectar el tubo capilar (el borde romo) a un 0,7 mm de diámetro interior del tubo Tygon conectado en el otro extremo a una jeringa de 2 ml, de vidrio (Poulten-Graf, Wertheim, Alemania). </li><li> Antes de utilizar el tubo capilar, visita de la pequeña abertura de la capilaridad para asegurar que la abertura es un tamaño apropiado (véase los procedimientos preliminares). </li><li> Inserte lentamente la glass capilar en el tubo de muestra preparada IBP proteína (2,4 mM Mp IBP-GFP en 20 mM de CaCl 2 y 25 mM Tris-HCl a pH 8, véase la referencia 10 para los detalles de preparación) y tirar de la jeringa de vidrio hasta que el capilar de vidrio contiene 0,1 l de la solución de proteína. </li><li> Comienza la grabación de vídeo a través del software LabVIEW. </li><li> Insertar el borde afilado de la capilar de vidrio (que contiene la solución de proteína) en uno de los agujeros en el disco de cobre en la etapa de enfriamiento. </li><li> Mientras observa a través del microscopio (Olympus, Tokio, Japón, objetivo 10x), cuidadosamente penetrar en la capa de inmersión en aceite con la punta capilar de vidrio, y presione la jeringa de vidrio (muy delicadamente) para suministrar una cantidad pequeña (~ 10 nl) de la proteína solución para crear una gotita 200 micras. </li><li> Cubrir el agujero en la etapa de enfriamiento con el conjunto de capa doble cubreobjetos (véase los procedimientos preliminares). </li></ol> 3. TH de medición de actividad <ol><li> Press el botón de refrigeración y la temperatura a -40 ° C. </li><li> Inicialmente, la gota de solución será clara. A temperaturas bajas, típicamente en el rango de -30 ° C a -35 ° C, el color gotita cambios, lo que indica que la solución ha sido congelado. Inmediatamente después de la muestra se ha congelado, aumentar la temperatura lentamente hasta que la mayor parte de hielo comienza a derretirse. Un aumento gradual de la temperatura es necesario para evitar el rebasamiento de la temperatura que podría resultar en la fusión completa de la muestra. </li><li> Cambiar a un objetivo 50x y comienzan a fundir el hielo mediante el ajuste de la temperatura. Este ajuste es interactivo, y los pasos finales se realiza normalmente con pequeños pasos de temperatura de 0,002 ° C. Continúe hasta que se derrita un cristal único que queda. El tamaño final del cristal debe ser alrededor de 10 micras. La temperatura más alta a la que ha dejado de fusión se determina que el punto de fusión y se determina con precisión en la etapa de análisis de vídeo más tarde. </li> &lt;li&gt; Ajustar la temperatura a unas pocas centésimas de un grado centígrado por debajo del punto de fusión del cristal y comenzar una rampa de temperatura con un retraso de 10 min. Ajustar la velocidad de rampa según se desee. Durante este tiempo, el cristal estará expuesto a los IBP. </li><li> Al finalizar el tiempo de 10 min de exposición, la temperatura disminuirá de forma automática bajo el control de la rutina de LabVIEW. </li><li> Observar la forma de los cristales a medida que disminuye la temperatura. En algún momento, la ráfaga repentina de los cristales de hielo pueden ser observados. La temperatura a la que ocurre esto se observa como la temperatura ráfaga cristal. </li><li> El uso de análisis de vídeo para determinar el punto de fusión y la temperatura precisa de ráfaga. En primer lugar, mediante el uso de análisis de vídeo, encontrar el punto de fusión exacto. Recordemos que la temperatura más alta a la que ha dejado de fusión se determina que el punto de fusión. Documentar este punto de fusión en un programa de hoja de cálculo. Entonces, determinar la temperatura exacta cristal ráfaga, y documentar este valortambién. La diferencia entre el punto de fusión y el punto de congelación, o la temperatura ráfaga de cristal, es la actividad de histéresis térmica de la solución de IBP. </li></ol> 4. Medida de la actividad TH en función del tiempo <ol><li> Seguir el protocolo descrito en las Secciones 3.1-3.3 para preparar un solo cristal de hielo. </li><li> Después de la formación de los cristales, ajuste el tiempo de retardo de la rampa como desee y, a su vez en la rampa. </li><li> La temperatura disminuye a una tasa fija (de acuerdo con los requisitos de los operadores) de forma automática una vez que el tiempo de retardo de rampa ha pasado. </li><li> Documentar la temperatura a la que se produce la ráfaga de cristal. Calcular el tiempo de exposición (el tiempo entre la formación de cristales y la ráfaga de cristal). </li><li> Repetir el experimento para tiempos de retardo diferentes y representar gráficamente la actividad TH como una función del tiempo de exposición para evaluar la dependencia del tiempo de la actividad TH. </li></ol>

<ol><li>DeVries, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glycoproteins+as+biological+antifreeze+agents+in+antarctic+fishes%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Glycoproteins as biological antifreeze agents in antarctic fishes.</a> Science. 172, 1152-1155 (1971).</li>
<li>Worrall, D., Elias, L., Ashford, D., Smallwood, M., Sidebottom, C., Lillford, P., Telford, J., Holt, C., Bowles, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+carrot+leucine-rich-repeat+protein+that+inhibits+ice+recrystallization%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">A carrot leucine-rich-repeat protein that inhibits ice recrystallization.</a> Science. 282, 115-117 (1998).</li>
<li>Raymond, J. A., Knight, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ice+binding%2C+recrystallization+inhibition%2C+and+cryoprotective+properties+of+ice-active+substances+associated+with+Antarctic+sea+ice+diatoms%5BTitle%5D)+AND+%22Cryobiology%22%5BJournal%5D)">Ice binding, recrystallization inhibition, and cryoprotective properties of ice-active substances associated with Antarctic sea ice diatoms.</a> Cryobiology. 46, 174-181 (2003).</li>
<li>Tomchaney, A. P., Morris, J. P., Kang, S. H., Duman, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Purification%2C+composition%2C+and+physical+properties+of+a+thermal+hysteresis+%22antifreeze%22+protein+from+larvae+of+the+beetle%2C+Tenebrio+molitor%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Purification, composition, and physical properties of a thermal hysteresis "antifreeze" protein from larvae of the beetle, Tenebrio molitor.</a> Biochemistry. 21, 716-721 (1982).</li>
<li>Kiko, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acquisition+of+freeze+protection+in+a+sea-ice+crustacean+through+horizontal+gene+transfer%5BTitle%5D)+AND+%22Polar+Biology%22%5BJournal%5D)">Acquisition of freeze protection in a sea-ice crustacean through horizontal gene transfer.</a> Polar Biology. 33, 543-556 (2010).</li>
<li>Robinson, C. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cold+adaptation+in+Arctic+and+Antarctic+fungi%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytol%22%5BJournal%5D)">Cold adaptation in Arctic and Antarctic fungi.</a> New Phytol. 151, 341-353 (2001).</li>
<li>Gilbert, J. A., Hill, P. J., Dodd, C. E., Laybourn-Parry, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Demonstration+of+antifreeze+protein+activity+in+Antarctic+lake+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Demonstration of antifreeze protein activity in Antarctic lake bacteria.</a> Microbiology. 150, 171-180 (2004).</li>
<li>Raymond, J. A., DeVries, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Adsorption+inhibition+as+a+mechanism+of+freezing+resistance+in+polar+fishes%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Adsorption inhibition as a mechanism of freezing resistance in polar fishes.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74, 2589-2593 (1977).</li>
<li>Pertaya, N., Marshall, C. B., DiPrinzio, C. L., Wilen, L., Thomson, E. S., Wettlaufer, J. S., Davies, P. L., Braslavsky, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+microscopy+evidence+for+quasi-permanent+attachment+of+antifreeze+proteins+to+ice+surfaces%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys.+J%22%5BJournal%5D)">Fluorescence microscopy evidence for quasi-permanent attachment of antifreeze proteins to ice surfaces.</a> Biophys. J. 92, 3663-3673 (2007).</li>
<li>Celik, Y., Graham, L. A., Mok, Y. F., Bar, M., Davies, P. L., Braslavsky, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Superheating+of+ice+crystals+in+antifreeze+protein+solutions%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Superheating of ice crystals in antifreeze protein solutions.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107, 5423-5428 (2010).</li>
<li>Gilbard, J. P., Farris, R. L., Santamaria, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Osmolarity+of+tear+microvolumes+in+keratoconjunctivitis+sicca%5BTitle%5D)+AND+%22Arch.+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Osmolarity of tear microvolumes in keratoconjunctivitis sicca.</a> Arch. Ophthalmol. 96, 677-681 (1978).</li>
<li>Gilbert, J. A., Davies, P. L., Laybourn-Parry, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+hyperactive%2C+Ca2%2B-dependent+antifreeze+protein+in+an+Antarctic+bacterium%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol.+Lett%22%5BJournal%5D)">A hyperactive, Ca2+-dependent antifreeze protein in an Antarctic bacterium.</a> FEMS Microbiol. Lett. 245, 67-72 (2005).</li>
<li>Soriano, J., Braslavsky, I., Xu, D., Krichevsky, O., Stavans, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Universality+of+persistence+exponents+in+two-dimensional+ostwald+ripening%5BTitle%5D)+AND+%22Phys.+Rev.+Lett%22%5BJournal%5D)">Universality of persistence exponents in two-dimensional ostwald ripening.</a> Phys. Rev. Lett. 103, (2009).</li>
<li>Tomczak, M. M., Marshall, C. B., Gilbert, J. A., Davies, P. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+facile+method+for+determining+ice+recrystallization+inhibition+by+antifreeze+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem.+Bioph.+Res.+Co%22%5BJournal%5D)">A facile method for determining ice recrystallization inhibition by antifreeze proteins.</a> Biochem. Bioph. Res. Co. 311, 1041-1046 (2003).</li>
<li>Knight, C. A., Hallett, J., Devries, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Solute+Effects+on+Ice+Recrystallization+-+an+Assessment+Technique%5BTitle%5D)+AND+%22Cryobiology%22%5BJournal%5D)">Solute Effects on Ice Recrystallization - an Assessment Technique.</a> Cryobiology. 25, 55-60 (1988).</li>
<li>Celik, Y., Drori, R., Pertaya-Braun, N., Altan, A., Barton, T., Bar-Dolev, M., Groisman, A., Davies, P. L., Braslavsky, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microfluidic+experiments+reveal+that+antifreeze+proteins+bound+to+ice+crystals+suffice+to+prevent+their+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Microfluidic experiments reveal that antifreeze proteins bound to ice crystals suffice to prevent their growth.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110, 1309-1314 (2013).</li>
<li>Middleton, A. J., Marshall, C. B., Faucher, F., Bar-Dolev, M., Braslavsky, I., Campbell, R. L., Walker, V. K., Davies, P. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antifreeze+protein+from+freeze-tolerant+grass+has+a+beta-roll+fold+with+an+irregularly+structured+ice-binding+site%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Mol.+Biol%22%5BJournal%5D)">Antifreeze protein from freeze-tolerant grass has a beta-roll fold with an irregularly structured ice-binding site.</a> J. Mol. Biol. 416, 713-724 (2012).</li>
</ol>

No hay conflictos de interés declarado.

Este trabajo demuestra el funcionamiento de un osmómetro de nanolitros controlado por computadora que permite mediciones precisas de la actividad TH con control de temperatura extraordinaria. En cualquier sistema sensible a la temperatura, gradientes de temperatura no deseados deben ser evitados. Para evitar gradientes de temperatura en el aparato que aquí se presenta, la gota de solución de ensayo debe ser posicionado en el centro de un agujero en la etapa de refrigeración de cobre del disco (paso 2,7). Adicionalmente, el monocristal debe estar en el centro de la gotita en lugar de cerca de los bordes (en la mayoría de los casos, esto sucederá de forma espontánea). La dependencia del tiempo descrito indica que la velocidad de enfriamiento puede influir en las lecturas de TH. Por lo tanto, se sugiere incluir un informe del tiempo durante el cual el cristal fue expuesta a la solución antes de la refrigeración, así como la velocidad de enfriamiento. Normalmente nos esperó 10 min antes de la rampa descendente de la temperatura a 0,01 ° C pasos cada sec 4. Los co-LabVIEW controladosetapa Oling fue adaptado para uso con un microscopio invertido en el que los dispositivos de microfluidos podría ser térmicamente manipulado. Este sistema facilita la realización de experimentos de intercambio de soluciones que implican cristales de hielo y IBPS etiquetados con eGFP 9, 10, 16. El sistema LabVIEW controlado puede ser adaptado a una etapa Clifton conectando el controlador de temperatura 3040 a través de un circuito de adaptación designado eléctrica. Tal sistema es operado en el laboratorio Davies 17. El software LabVIEW y el diseño de la adaptación designado circuito eléctrico para la etapa de Clifton están disponibles bajo petición. En conclusión, se describe un osmómetro de nanolitros que facilita el control sensible y manipulación de la temperatura y la tasa de aumento de la temperatura y disminución (con 0,002 ° C sensibilidad), coordinado con un interfaz de vídeo a través de una rutina de LabVIEW para análisis en tiempo real. Este sistema puede realizar reproducibles de velocidad controlada experimentos que son Important para investigar la cinética de la interacción IBP con hielo. Tales experimentos pueden abordar varios largamente debatido cuestiones relacionadas con el mecanismo de acción de los IBP.

<table border="1"><tbody><tr><td> Nombre </td><td> Empresa </td><td> Número de catálogo / modelo </td><td> Comentarios </td></tr><tr><td> Aceite de inmersión tipo B </td><td> Cargille Laboratorios </td><td> 16484 </td><td></td></tr><tr><td> Drierite </td><td> WA Hammond Drierite </td><td> 043063 2270g </td><td></td></tr><tr><td> Micro 90 solución de limpieza </td><td> Cole-Parmer </td><td> <a href="http://www.coleparmer.com/Product/Cole_Parmer_small_sup_reg_sup_small_Micro_90_small_sup_reg_sup_small_cleaning_solution_case_of_four_4_Liter_bottles/EW-18100-11" target="_blank">EW-18100-11</a> </td><td></td></tr><tr><td> Capilar extractor </td><td> Narishige </td><td> PB-7 </td><td></td></tr><tr><td> Tubos capilares de cristal </td><td> Marca GnbH Persona </td><td> 7493 21 </td><td> 75 mm de largo, 1,15 de diámetro </td></tr><tr><td> Temperaturacontrolador </td><td> Newport, Irvine, California, Estados Unidos </td><td> Modelo 3040 </td><td> Modelo 3040 </td></tr><tr><td> Microscopio de luz </td><td> Olimpo </td><td> Modelo BH2 </td><td></td></tr><tr><td> Objetivo de 10x </td><td> Olimpo </td><td></td><td> S Plan 10, 0,3, 160/0.17 </td></tr><tr><td> Objetivo 50x </td><td> Nikon </td><td></td><td> CF plan, 50X/0.55 EPI ELWD </td></tr><tr><td> Cámara CCD </td><td> Provideo </td><td> CVC-140 </td><td></td></tr><tr><td> Tubos Tygon </td><td> Saint-Gobain, París, Francia </td><td></td><td> Formulación Tygon S-50-HL Tubería </td></tr><tr><td> Vidrio de la jeringa (2 ml) </td><td> Poulten-Graf, Wertheim, Alemania </td><td> 7 10227 </td><td></td></tr><tr><td> Tarjeta PCI GPIB- </td><td> National Instruments, Austin, Texas, EE.UU. </td><td> 778032-01 </td><td></td></tr><tr><td> Vídeo marco grabBER IMAQ PCI-1407 </td><td> National Instruments, Austin, Texas, EE.UU. </td><td> 322156B-01 </td><td></td></tr><tr><td> LabVIEW System Software Design </td><td> National Instruments, Austin, Texas, EE.UU. </td><td> Versión 8 </td><td></td></tr><tr><td> Software DivX Author </td><td> DiVx LLC, San Diego, CA, EE.UU. </td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

labview operado novela osmometer nanolitros de investigaciones de hielo de fijación con proteínas

LabVIEW-operated Novel Nanoliter Osmometer for Ice Binding Protein Investigations

Las proteínas de unión al hielo (IBPs), incluyendo las proteínas anticongelantes, proteínas estructurantes del hielo, proteínas de histéresis térmica y proteínas inhibidoras de la recristalización del hielo, se encuentran en organismos adaptados al frío y los protegen de lesiones por congelación mediante la interacción con cristales de hielo. Las IBPs se hallan en una variedad de organismos, incluyendo peces1, plantas2, 3, artrópodos4, 5, hongos6 y bacterias7. Las IBPs se adsorben a las superficies de los cristales de hielo y evitan que las moléculas de agua se incorporen a la red cristalina del hielo en los lugares donde se han adsorbido las IBPs. El hielo que crece sobre la superficie del cristal entre las IBPs adsorbidas desarrolla una alta curvatura que reduce la temperatura a la cual crecen los cristales de hielo, un fenómeno conocido como efecto Gibbs-Thomson. Esta depresión crea una brecha (histéresis térmica, TH) entre el punto de fusión y el punto de congelación fuera del equilibrio, dentro de la cual el crecimiento del hielo se detiene8-10, véase Figura 1. Una de las herramientas principales utilizadas en la investigación de IBPs es el osmómetro de nanolitros, que facilita la medición de la actividad de TH en soluciones de IBPs. Los osmómetros de nanolitros, como el instrumento Clifton (Clifton Technical Physics, Hartford, NY) y el instrumento Otago (Otago Osmometers, Dunedin, Nueva Zelanda), fueron diseñados para medir la osmolaridad de una solución midiendo la depresión del punto de fusión de gotas con volúmenes del orden de los nanolitros. Estos dispositivos se utilizaron para medir las osmolaridades de muestras biológicas, como las lágrimas11, y se descubrió que eran útiles en la investigación de IBPs. El control manual de estos osmómetros de nanolitros limitaba las posibilidades experimentales. No era posible controlar de forma fiable los cambios en la velocidad de temperatura, el rango térmico del instrumento Clifton estaba limitado a 4.000 mOsmol (aproximadamente -7,5 °C), y la grabación de la temperatura en función del tiempo no era una opción disponible en estos instrumentos.
Diseñamos un sistema personalizado de osmómetro de nanolitros controlado por computadora utilizando una plataforma LabVIEW (National Instruments). La platina fría, descrita previamente9, 10, contiene un bloque metálico a través del cual circula agua, actuando así como un disipador de calor, véase Figura 2. A este bloque van fijados enfriadores termoeléctricos que pueden ser accionados mediante un controlador de temperatura comercial que se puede manejar a través de módulos LabVIEW, véase Figura 3. Se proporcionan más detalles a continuación. La principal ventaja de este sistema es su control de temperatura sensible, véase Figura 4. El control automatizado de la temperatura permite coordinar una rampa de temperatura fija con una salida de microscopía de video que contiene detalles experimentales adicionales.
Para estudiar la dependencia temporal de la actividad TH, probamos una IBP hipercativa de 58 kDa procedente de la bacteria antártica Marinomonas primoryensis (MpIBP)12. Esta proteína fue marcada con proteínas fluorescentes verdes mejoradas (eGFP) en un constructo desarrollado por el grupo de Peter Davies (Universidad de Queens)10. Demostramos que el perfil de cambio de temperatura afectaba la actividad TH. Un excelente control sobre el perfil de temperatura en estos experimentos mejoró significativamente las mediciones TH. El osmómetro de nanolitros además nos permitió evaluar la inhibición de recristalización de las IBP5, 13. En general, la recristalización es un fenómeno en el cual los cristales grandes crecen a expensas de los cristales más pequeños. Las IBP inhiben eficazmente la recristalización, incluso a bajas concentraciones14, 15. Utilizamos nuestro osmómetro controlado mediante LabVIEW para seguir cuantitativamente la recristalización del hielo y para mantener una fracción constante de hielo mediante un análisis en tiempo real simultáneo de las imágenes y retroalimentación de temperatura procedente de la cámara de muestra13. Los cálculos en tiempo real ofrecen opciones adicionales de control durante un procedimiento experimental. Se desarrolló una platina para microscopio invertido para acomodar dispositivos microfluídicos con control de temperatura, los cuales serán descritos en otro lugar16.
El sistema de platina fría
El conjunto del platillo frío (Figura 2) consta de un conjunto de enfriadores termoeléctricos que enfrían una placa de cobre. El calor se elimina del platillo haciendo circular agua fría a través de un compartimento cerrado situado debajo de los enfriadores termoeléctricos. Un orificio de 4 mm de diámetro en el centro de la placa de cobre sirve como ventana de observación. Se perforó un orificio plano de 1 mm de diámetro para alojar el termistor. Un disco de cobre fabricado a medida (7 mm de diámetro) con varios orificios (500 μm de diámetro) se colocó sobre la placa de cobre y se alineó con la ventana de observación. Se bombeó aire a un caudal de 35 ml/seg y se secó utilizando Drierite (W.A. Hammond). El aire seco se utilizó para garantizar un ambiente seco en el platillo de enfriamiento. El platillo se conectó mediante un conector de 9 pines a un controlador de temperatura (Modelo 3040 o 3150, Newport Corporation, Irvine, California, EE. UU.). El controlador de temperatura se conectó mediante un cable a una tarjeta GPIB-PCI de computadora (National Instruments, Austin, Texas, EE. UU.).

La medición de la dependencia del tiempo TH El osmómetro LabVIEW operado nanolitros facilita la realización de mediciones precisas de la actividad TH. La tasa de reducción de temperatura constante permite la medición de la dependencia del tiempo TH. El control preciso de la temperatura activado por el osmómetro de nanolitros era crucial para estos experimentos. El tiempo de exposición de un cristal de hielo a los IBP en solución se define como el periodo de tiempo desde la formación del cristal (el final del proceso de fusión) hasta que el crecimiento repentino de hielo alrededor del cristal (cristal ráfaga). Se encontró que el tiempo de exposición de los cristales de hielo a los IBPs afectado de forma crucial la actividad TH. Los períodos cortos de exposición a IBP (unos pocos segundos) produjo una actividad TH baja en el Mp IBP-GFP solución (2,4 mM) (Figura 5). La actividad TH aumentó con el tiempo de exposición IBP hasta que alcanzó una meseta a 4 min de exposición IBP. A concentraciones más altas de IBP, la placaau se alcanzó a los tiempos más cortos. <img alt="Figura 1" src="/files/ftp_upload/4189/4189fig1.jpg" /> Figura 1. IBPs diagrama esquemático que ilustra adsorbido en hielo. Aprobada con permiso de 10. <img alt="Figura 2" fo:src="/files/ftp_upload/4189/4189fig2highres.jpg" src="/files/ftp_upload/4189/4189fig2.jpg" /> Figura 2. La etapa de enfriamiento. A) conectado a los tubos en el microscopio. B) Sin el liderazgo superior. C) Diagrama esquemático. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/4189/4189fig2large.jpg" target="_blank"> </a><img alt="Figura 3" src="/files/ftp_upload/4189/4189fig3.jpg" /> Figura 3. Captura de pantalla de la interfaz de LabVIEW. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/4189/4189fig3large.jpg" target="_blank">Cl</a>ick aquí para ampliar la figura. <img alt="Figura 4" fo:src="/files/ftp_upload/4189/4189fig4highres.jpg" src="/files/ftp_upload/4189/4189fig4.jpg" /> Figura 4. Gráfico de temperatura estabilidad. El controlador de temperatura se ajustó a bajar la temperatura de 0,01 ° C cada 15 seg. <img alt="Figura 5" fo:src="/files/ftp_upload/4189/4189fig5highres.jpg" src="/files/ftp_upload/4189/4189fig5.jpg" /> Figura 5. Mp actividad TH IBP como una función del tiempo de exposición de cristales de hielo a los IBP. Cada punto de tiempo es la media de 3-6 experimentos.

Proteínas de unión de hielo (IBP), también conocidas como proteínas anticongelantes, inhibir el crecimiento del hielo y son un aditivo prometedor para su uso en la crioconservación de tejidos. La principal herramienta utilizada para investigar los IBP es el osmómetro nanolitros. Hemos desarrollado un hogar diseñado etapa de enfriamiento montado en un microscopio óptico y se controla utilizando una rutina de costumbre-construido LabVIEW. El osmómetro nanoliter descrito aquí manipulado la temperatura de la muestra de una manera ultra-sensible.

LabVIEW operado Novela Osmometer nanolitros de Investigaciones de hielo de fijación con proteínas

Las proteínas de unión al hielo (IBP, por sus siglas en inglés), que incluyen las proteínas anticongelantes, las proteínas de estructuración del hielo, las proteínas de histéresis térmica y las de inhibición de la recristalización del hielo...

El objetivo de este procedimiento es medir la histéresis térmica de proteínas que se unen al hielo y de otros materiales que influyen en el crecimiento del hielo. Esto se logra primero creando un tubo capilar con una abertura estrecha y aspirando una gota de solución de proteína. Luego, el tubo capilar con la muestra se coloca sobre una platina con temperatura controlada.El segundo paso consiste en congelar la solución enfriándola a bajas temperaturas para introducir hielo en la gota. A continuación, se calienta la gota para fundir la mayor parte del hielo. Con el fin de mantener un cristal único en la gota.El paso final consiste en enfriar nuevamente el hielo hasta que comience a crecer rápidamente. En última instancia, se utiliza el análisis por microscopía de video para calcular la diferencia entre la temperatura de fusión y la temperatura de congelación con el fin de determinar la histéresis térmica, así como para evaluar la morfología de los cristales de hielo y medir la velocidad de crecimiento del hielo. La principal ventaja del sistema de control de laboratorio Nanoliter SM que hemos desarrollado frente a los métodos existentes es que permite realizar mediciones muy largas o muy rápidas de forma precisa y repetitiva.Este método puede ayudar a responder preguntas clave en el campo de las proteínas de unión al hielo, como la dependencia temporal de ter. Para comenzar, prepare un capilar de vidrio para la inyección de solución. Utilice un tirador de capilares para preparar una pipeta afilada con una abertura fina a partir de un microtubo capilar de vidrio.El tamaño de la abertura debe verificarse haciendo pasar aire a través del capilar para obtener burbujas finas en el agua. Prepare el capilar de manera que la abertura quede casi obstruida, pero suficientemente abierta para permitir la formación de burbujas de submilímetro. Si el capilar está cerrado, ábralo rompiendo su borde al presionarlo o rayarlo suavemente contra las paredes del tubo que contiene agua.Ensamble el vidrio de cubierta de doble capa Fabricator colocando partículas desecantes secas correctamente entre dos cubreobjetos. Péguelos juntos con una pistola de pegamento caliente. El vidrio de cubierta de doble capa permite la observación de la muestra sin que se condense humedad sobre la superficie del cubreobjetos.Para preparar la etapa de enfriamiento, conecte la entrada y salida de flujo de agua de la etapa de enfriamiento a tubos de cuatro milímetros de diámetro. Los tubos Gon conectan el tubo de entrada de flujo de agua a una bomba de agua. Conecte un tubo Tigon de cuatro milímetros de diámetro a la entrada de la etapa de enfriamiento para suministrar aire seco que ha sido desecado.Utilizando una columna de hielo seco en línea, accione las bombas de aire y de agua. Tenga en cuenta que los elementos de enfriamiento no deben funcionar sin un disipador de calor. Encienda el controlador de temperatura, la cámara y la rutina de vista de laboratorio.Para comenzar la preparación de la muestra, coloque una gota de tres a cuatro microlitros de aceite de inmersión B en la parte posterior de un disco de cobre de siete milímetros de diámetro, que tenga orificios de 500 micrones perforados a través del disco. Coloque el disco de cobre sobre la etapa de enfriamiento con el lado del aceite de inmersión hacia abajo. Conecte el extremo romo del tubo capilar a un tubo tigón de 0,7 milímetros de diámetro.Conectado por el otro extremo a una jeringa de vidrio de dos mililitros. Inserte lentamente el capilar de vidrio en el tubo de muestra preparado de proteína de unión al hielo o IBP y tire de la jeringa de vidrio hasta que el capilar de vidrio contenga 0,1 microlitro de la solución proteica. Inicie la grabación de video mediante el software LabVIEW.Introduzca el borde afilado de la micropipeta de vidrio llena en uno de los orificios del disco de cobre sobre la platina de enfriamiento. Mientras observa a través del microscopio, penetre cuidadosamente la capa de aceite de inmersión con la punta de la micropipeta de vidrio, con mucha delicadeza. Presione la jeringa de vidrio para liberar una pequeña cantidad de la solución proteica y formar una gota de 200 micrones.Cubra el orificio en la etapa de enfriamiento con el ensamblaje de cubreobjetos de doble capa. Presione el botón de enfriamiento y ajuste la temperatura a menos 40 grados Celsius. Inicialmente, la gota de solución será transparente a bajas temperaturas, generalmente en un rango de temperatura de menos 30 grados Celsius a menos 35 grados Celsius.La gota cambia de color, lo que indica que la solución se ha congelado inmediatamente después de que la muestra se haya congelado. Aumente lentamente la temperatura hasta que el hielo en masa comience a derretirse. Es necesario un aumento gradual de la temperatura para evitar sobrepasarla, lo que podría provocar el derretimiento completo de la muestra. Cambie a un objetivo de 50 aumentos y comience a derretir el hielo ajustando la temperatura.Este ajuste es interactivo y los pasos finales se realizan típicamente utilizando pequeños incrementos de temperatura de 0,002 grados Celsius hasta continuar derritiendo hasta que quede un solo cristal. El tamaño final del cristal debe ser de aproximadamente 10 micrones. La temperatura más alta a la que ha cesado la fusión se determina como el punto de fusión y se determina con precisión en la etapa posterior de análisis de video.A continuación, ajuste la temperatura a unas pocas centésimas de grado Celsius por debajo del punto de fusión del cristal e inicie una rampa de temperatura con un retraso de 10 minutos, ajustando la velocidad de rampa según se desee. Durante este tiempo, el cristal estará expuesto a los ips; al completarse el tiempo de exposición de 10 minutos, la temperatura disminuirá automáticamente bajo el control de la rutina de LabVIEW. Observe la forma del cristal conforme la temperatura disminuye.En algún momento, puede observarse la repentina formación de cristales de hielo. La temperatura a la que ocurre este fenómeno se registra como la temperatura de formación de cristales. Utilice el análisis de video para determinar con precisión el punto de fusión y la temperatura de formación de cristales.Primero, mediante el análisis de video, determine el punto de fusión exacto. Recuerde que se considera punto de fusión la temperatura más alta a la cual ha finalizado la fusión. Documente este punto de fusión en un programa de hojas de cálculo.Luego determine la temperatura exacta de ruptura del cristal y documente también esta. La diferencia entre el punto de fusión y el punto de congelación o temperatura de ruptura del cristal es la actividad de histéresis térmica de la solución de IBP. Para comenzar la medición de la actividad de HT dependiente del tiempo, derrita el hielo hasta que quede un solo cristal, como se hizo anteriormente tras la formación del cristal.Establezca el tiempo de retardo de la rampa según desee y active la rampa. Aquí, por ejemplo, el tiempo de retardo se estableció en un minuto. La temperatura disminuirá a una velocidad fija automáticamente. Una vez transcurrido el tiempo de retardo de la rampa, registre la temperatura a la cual ocurre la ruptura del cristal.Calcule el tiempo de exposición, que es el tiempo entre la formación del cristal y la ruptura del cristal. Repita el experimento para diversos tiempos de retardo y represente gráficamente la actividad de TH en función de la exposición. Tiempo para evaluar la dependencia temporal de la actividad de TH.El control preciso de la temperatura permitido por el monitor OSM de nanolitros fue crucial para proporcionar una medición exacta de la actividad de TH y su dependencia temporal. El tiempo de exposición de un cristal de hielo al IPS en solución se define como el período de tiempo desde la formación del cristal hasta el crecimiento repentino del hielo alrededor del cristal. El tiempo de exposición de los cristales de ICE al IPS afectó crucialmente la actividad de TH.Períodos cortos de exposición al IBP produjeron una baja actividad de TH en la solución MP I-B-P-G-F-P. La actividad de TH aumentó con el tiempo de exposición al IBP hasta alcanzar una meseta a los cuatro minutos de exposición al IBP a concentraciones más altas de IBP. La meseta se alcanzó en tiempos más cortos. La microscopía fluorescente combinada con dispositivos de microfluídica que utilizan una etapa de control de vista de amor similar puede utilizarse para responder preguntas adicionales, como la acumulación de proteínas de unión al hielo en la superficie de los cristales de hielo.Después de ver este video, deberíamos tener una buena comprensión de cómo realizar una medición térmica de STERIS que evalúe la actividad de las proteínas de unión al hielo.

labview-operated-novel-nanoliter-osmometer-for-ice-binding-protein

Research

Investigación

JoVE Journal

Chemistry

Química

ITC es una herramienta poderosa para el estudio de la unión de un ligando a su anfitrión. En los sistemas complejos sin embargo, varios modelos pueden adaptarse bien a los datos. El método descrito aquí proporciona un medio para dilucidar el modelo de encuadernación adecuado para los sistemas complejos y extraer los parámetros termodinámicos correspondientes.

Recogida de concentración variable conjuntos de datos calorimetría de titulación isotérmica para determinar los mecanismos de enlace

Nanopartículas fluorescentes producidos en nuestro laboratorio se utilizan para las concentraciones de iones de imágenes y los flujos de iones en los sistemas biológicos, como las células en el líquido intersticial y la señalización en la homeostasis fisiológica.

Las nanopartículas fluorescentes para la Medición de la concentración de iones en sistemas biológicos

En este video, demostramos la tecnología de interferometría de biocapas (BLI) para detectar las interacciones intermoleculares entre ligandos y analitos objetivo en tiempo real. BLI mide los cambios en el patrón de interferencia de la luz blanca reflejada por una capa de ligandos inmovilizados en la superficie de un biosensor a medida que interactúan con los analitos en solución.

Tecnología de interferometría de biocapas para detectar interacciones entre ligando y analito

Este video muestra un método para estudiar las interacciones proteína-medicamento utilizando el biopaneo basado en biosensores QCM de la biblioteca de péptidos mostrados por el fago T7. El biopaneo de fagos que muestran un péptido específico en el biosensor QCM permite el aislamiento específico de péptidos de alta afinidad, seguido de la secuenciación de aminoácidos, lo que ayuda a identificar sitios de interacción específicos en la proteína objetivo.

Biopaneo basado en biosensores de microbalanza de cristal de cuarzo para estudiar las interacciones proteína-fármaco

Los protocolos siguientes describen ensayos cinéticos de las interacciones proteína-proteína con Interferometría Bio-capa. F-tipo ATP sintasa, que está implicado en el metabolismo de la energía celular, puede ser inhibida por su subunidad ε en bacterias. Hemos adaptado Interferometría Bio-capa para estudiar las interacciones del complejo catalítico con el dominio del ε inhibidora C-terminal.

Interferometría Bio-capa para Cinética de interacciones proteína-proteína y alostéricos Efectos ligando medición

Este trabajo presenta un protocolo para el manejo de líquidos y de introducción de muestra a un microcanal para in situ de iones secundarios análisis de espectrometría de masas de tiempo de vuelo de biomoléculas de proteínas en una solución acuosa.

In Situ caracterización de proteínas hidratadas en agua por Salvi y TOF-SIMS

Se describe aquí protocolos para la medición de antígeno-anticuerpo de afinidad y la cinética utilizando cuatro plataformas de biosensores de uso común vinculante.

Determinación de alta afinidad anticuerpo-antígeno Cinética de unión usando cuatro plataformas Biosensor

Aquí presentamos una bicapa lipídica soportada en el contexto de una plataforma microfluídica para estudiar las interacciones proteína-fosfoinositido utilizando un método libre de etiquetas basado en la modulación del pH.

PIP-on-a-chip: un estudio sin etiquetas de las interacciones proteína-fosfoinositida

Este protocolo describe cómo realizar ensayos rápidos de luciferasa de bajo costo a rendimiento medio utilizando una Gaussia luciferase ligada a la insulina como un proxy para la secreción de insulina de células beta. El ensayo se puede realizar con la mayoría de los lectores de placas de luminiscencia y pipetas multicanal.

Medición de la secreción relativa de insulina mediante un sustituto de la Luciferase co-secretada

El presente protocolo describe nuevas herramientas para ensayos de unión a SPR para examinar la unión CV-N a HA, glicoproteína S, glicanos de tipo híbrido relacionados y oligosacáridos con alto contenido de manosa. SPR se utiliza para determinar el KD para la unión de CV-N dimérico o monomérico a estos glicanos.

Ingeniería de agentes antivirales a través de la resonancia de plasmones de superficie

Aprende a medir la histéresis térmica de proteínas de unión al hielo (IBPs) usando un osmómetro nanolitrico controlado por LabVIEW. Este método permite analizar con precisión el crecimiento y la forma de cristales de hielo mediante microscopía de video para aplicaciones en criopreservación.

LabVIEW operado Novela Osmometer nanolitros de Investigaciones de hielo de fijación con proteínas

Explorar más videos