Name: Cromosoma Preparación de las células cultivadas (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-01-28T13:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 42 s
Description: Aprende a preparar cromosomas a partir de células cultivadas como linfocitos y fibroblastos para técnicas de citogenética molecular. Este método permite realizar bandeo G y hibridación in situ por fluorescencia (FISH) en humanos y ratones.

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Trabajo descrito en este manuscrito fue posible gracias al financiamiento de la Fundación Patrick F. Taylor.

1. Cromosoma La recolección de células adherentes <ol><li> Protocolo Estándar <ol><li> Se cultivan las células de acuerdo a condiciones específicas de cultivo celular. Cuando las células han alcanzado la fase logarítmica (80% de confluencia), añadir 10 l / ml de Colcemid al matraz de cultivo de células. Se recomienda un mínimo de 2 x 10 6 células. </li><li> Se incuban las células a 37 º C en un incubador de CO2 al 5% durante 45 min. Usando una pipeta estéril, transferir los medios de las células en un tubo cónico de 15 ml. Ponga a un lado. </li><li> Lave suavemente las células mediante la adición de 2 ml de HBSS Buffer en el matraz. Amortiguar remolino y luego retire con una pipeta. Descartar. </li><li> Añadir 1 ml de tripsina, asegurándose de que cubre toda la superficie del matraz. Sólo dejar las células en tripsina durante aproximadamente 2 min. Una vez que la mayoría de las células se han separado, pipetear los medios de comunicación en el tubo cónico de nuevo en las células. </li><li> Transferir la suspensión celular en alícuotas de 10 ml en tubos de 15 ml cónicos.Centrifugar a 200 xg durante 10 min. Aspirar el sobrenadante y resuspender el precipitado. </li><li> Añadir 10 ml de 0,075 M de KCl que ha sido precalentada a 37 º C al sedimento que queda en el tubo cónico. Tubo Vortex a velocidad media para mezclar KCl y células. </li><li> Se incuban las células a 37 ° C durante 10 min. Centrifugar a 200 xg durante 5 min a 25 ° C. Aspirar el sobrenadante (hasta unos 0,5 ml restos) y pellet se resuspende. </li><li> Añadir cuidadosamente 5 ml de fijador fresco de Carnoy (3:1 de metanol: ácido acético glacial) a las células, mientras que vórtex. Añadir a continuación 5 ml más de fijador sin agitación durante un total de 10 ml. </li><li> Centrifugar a 200 xg durante 5 min. Retire las células sobrenadante y volver a suspender. Añadir 5 ml de fijador a cada tubo. </li><li> Centrifugar a 200 xg durante 5 min. Retire las células sobrenadante y volver a suspender. Añadir 5 ml de fijador a cada tubo. Las células se pueden almacenar en 4 ° C durante hasta un año. </li></ol></li><li> Modificación al protocolo: harvesti cromosómicasng de líneas celulares linfoblastoides <ol><li> Se cultivan las células de acuerdo a condiciones específicas de cultivo celular. (Use matraz apropiado para la cantidad de células que se cultiva). Cuando las células han alcanzado la fase logarítmica (aproximadamente 2 días después de que las células se dividen), añadir 10 l / ml de Colcemid al matraz de cultivo de células. </li></ol></li><li> Modificación al protocolo: Cromosoma recolección de la sangre entera Fitohemaglutinina (PHA), una lectina derivada del frijol rojo, es un mitógeno potente para las células T humanas 16. 72 h después de la adición de PHA a la cultura, aproximadamente el 45% de las células están en la fase S. Esto representa el pico de actividad mitótica, y es el punto óptimo para la cosecha de estudios cromosómicos. Otros mitógenos tales como hierba carmín (1-10 g / ml) se pueden utilizar en el análisis de células B 17,18. <ol><li> Recoge al menos 1 ml de sangre completa en un tubo de heparina sódica superior verde. Utilice dentro de 3 días después de la recogida. Sangre tienda a temperatura ambiente sinhasta listo para usar. </li><li> Alícuota de 0,25 ml de sangre completa en 10 ml de medio RPMI completo que contiene L-glutamina (suero bovino fetal al 20%, 1% penicilina / estreptomicina, 1% de fungizona, y 1% de PHA). Cultivo a 37 ° C con 5% de CO 2. </li></ol></li><li> Modificación al protocolo: Cromosoma recolección de la médula ósea El análisis citogenético de la médula ósea es útil en muchos trastornos hematológicas malignas como la observación de un clon cromosómicamente anormal puede ser diagnóstico para un tipo específico de leucemia. También se utilizan estudios cromosómicos para evaluar la progresión de la enfermedad, tales como la aparición de crisis blástica y respuesta al tratamiento. Dado que las células de la médula ósea se están dividiendo activamente, sin estimulación por mitógenos es necesario 9,19. Para las leucemias agudas culturas 24 y 48 h también se establezcan. <ol><li> Recoge al menos 1 ml de médula ósea en un tubo con heparina de sodio superior verde. Alícuota de 0,25 ml de médula ósea en 10 ml de medio RPMI completo que contiene L-glutamina (20% de suero fetal bovino, 1% penicilina / estreptomicina, 1% de fungizona). Cultivo a 37 ° C con 5% de CO 2. </li></ol></li></ol> 2. Slide Preparación y tinción sólida Una evaluación rápida de una diapositiva representante le proporcionará información sobre la calidad de la cosecha antes de continuar con otros procedimientos tales como bandas G, FISH, CGH, o SKY. Algunos laboratorios prefieren tinción sólida de las células para la recolección rápida y evaluación cromosoma. Alternativamente, un microscopio de contraste de fase puede ser utilizado para este análisis. Los portaobjetos se preparan mejor cuando la humedad es de aproximadamente 50% y la temperatura ambiente (20-25 ° C). <ol><li> Centrifugar las células a 200 xg durante 5 min a 25 ° C. Eliminar el sobrenadante hasta que sólo 0,3-0,5 ml restos. </li><li> Después de resuspender suavemente el sedimento, de pipeta tres gotas de la suspensión de células a partir de una distancia de aproximadamente 2 en sobre un portaobjetos que está inclinado en un ángulo de aproximadamente 45 ° y permitir que la suspensiónrodar a través de la diapositiva. Añada una gran gota de fijador de Carnoy fresco a la diapositiva. </li><li> Seque la parte posterior de la diapositiva en una toalla de papel y luego sentarse la diapositiva a secar durante al menos 10 min. La diapositiva debe estar completamente seco. </li><li> Prepare fresco tinción Giemsa solución (3:1 proporción de Gurr Buffer y Giemsa). Colocar los portaobjetos en una rejilla de tinción. Cubra toda la diapositiva en la solución de tinción Giemsa. Deje que las diapositivas permanecen en la solución de tinción durante 5 min. Enjuagar los portaobjetos con agua destilada, dejar escurrir y dejar secar al aire. </li><li> Añadir 4 gotas de Permount y una hoja de cubierta de la diapositiva. Asegúrese de que no hay burbujas bajo el cubreobjetos. El exceso Permount se puede quitar con una toalla de papel. </li><li> Analice las células con un microscopio de luz con una lupa de 10X y 100X. Si las células en metafase son abundantes y bien propagación, las diapositivas restantes pueden utilizarse para otros procedimientos experimentales. </li></ol> 3. G-Banding utilizando tripsina y Giemsa (GTG) &lt;p&gt; La tripsina es una enzima proteolítica que desnaturaliza las histonas euchromatic en regiones de ADN con una mayor actividad transcripcional resultante. Después de la tinción de Giemsa, estas regiones aparecen como bandas de luz. Cromatina altamente condensado con poca o ninguna actividad transcripcional (heterocromatina) tendrá una gran parte de sus histonas protegidas de la tripsina y por lo tanto se mancha oscura después de la tinción de Giemsa. Es esencial inicialmente G-banda una diapositiva a supervisar las condiciones y ajuste la sincronización de la tripsina en caso de necesidad para las diapositivas siguientes. <ol><li> Añadir las siguientes soluciones para 4 jarras Coplin. Tarro # 1 = 30 ml de HBSS 1X y 4 ml de 10x tripsina (0,5%) Jar # 2 = 50 ml de 1x HBSS Tarro # 3 = 45 ml de HBSS 1X y 5 ml de suero fetal bovino Jar # 4 = 50 ml de 1x HBSS </li><li> Sumerja cada diapositiva de Jar # 1 durante 5 segundos, enjuague rápido en Jar # 2, deje cada diapositiva de Jar # 3 durante al menos 30 segundos, enjuague rápido en Jar # 4 luego permitir que se sequen. </li><li> Preparar fresh Giemsa tinción Solución (relación 3:1 de Gurr Buffer y Giemsa). Colocar los portaobjetos en una rejilla de tinción. Cubra toda la diapositiva en la solución de tinción Giemsa. Deje que las diapositivas permanecen en la solución de tinción durante 5 min. </li><li> Enjuagar los portaobjetos en agua destilada en el mismo orden en que estaban manchadas. Deje que los portaobjetos se sequen durante unos 10 min. La diapositiva debe estar completamente seco. </li><li> Añadir 4 gotas de Permount y una hoja de cubierta de la diapositiva. Asegúrese de que no hay burbujas bajo el cubreobjetos. El exceso Permount se puede quitar con una toalla de papel. </li><li> Analice las células con un microscopio de luz con una lupa de 10X y 100X. Ajuste de temporización tripsina de el resto de las diapositivas en base a los resultados de la primera diapositiva. </li></ol>

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</ol>

Hemos utilizado el presente procedimiento para el cromosoma aislamiento a partir de células de diversos organismos, incluyendo diversos tipos de células obtenidos a partir de humano, macacos Rhesus, ratas, y ratones 11,20-22. Se proporciona el protocolo estándar, pero ciertos pasos clave y variables puede ser necesario ajustar para estos diversos tipos de células. Varios pasos específicos son cruciales tanto en la preparación cromosómica y bandas G para asegurar la mejor calidad posible de los resultados. Una...

El análisis cromosómico es una técnica convencional utilizada en todo el mundo para el diagnóstico de la inestabilidad cromosómica y reordenamientos que conducen a trastornos genéticos y 1,2,8,9 malignidad. Además, una resolución más alta para el diagnóstico y la investigación de anomalías genéticas constitucionales y el cáncer adquirida se puede lograr con la combinación de los procedimientos citogenéticos clásicos y metodologías de citogenética molecular, tales como hibridación in situ fluorescente (FISH), hibridación genómica comparativa (CGH) y cariotipo espectral (SKY) 14,15. Más recientemente, estas técnicas se han utilizado para la evaluación de la inestabilidad cromosómica asociada con la investigación de células madre. Anomalías del cariotipo como aneuploidía de células a largo plazo cultivadas embrionarias (ES) y las células madre adultas de diversos organismos han sido reportados por varios laboratorios. Evidencia reciente apoya que algunas líneas celulares son inherentemente más inclinados al cromosoma instabilidad, independientemente de las condiciones de cultivo. Por esta razón, cuando el establecimiento y / o mantenimiento de líneas de células madre rhesus humanos, de ratón, o bien, se recomienda el análisis de cromosomas, como parte del proceso de control de calidad. Muchos informes describen el creciente interés en el uso de la citogenética de rutina y moleculares para vigilar la estabilidad cromosómica de las células madre y células malignas o varios organismos en cultivo 10-13. Estos protocolos son cada vez más utilizados por los laboratorios no genéticos para la evaluación cromosómica rápida de sus células cultivadas 13. Presentamos nuestros procedimientos básicos para la preparación de cromosomas de diversos tipos de células, que se pueden aplicar para ambos propósitos y células clínicos y de investigación derivadas de diversos organismos.

<table><tbody><tr><td>KaryoMAX Colcemid</td><td>Gibco</td><td>15212-012</td><td></td></tr><tr><td>HBSS Tampón</td><td>Gibco</td><td>24020-117</td><td></td></tr><tr><td>0.5% Tripsina EDTA 10x</td><td>Gibco</td><td>15400-054</td><td></td></tr><tr><td>Permount</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-100</td><td></td></tr><tr><td>Tabletas tampón "GURR"</td><td>Gibco</td><td>10580-013</td><td></td></tr><tr><td>Geimsa Stain</td><td>Ricca Chemical Company</td><td>3250-16</td><td></td></tr><tr><td>Centrífuga 5810</td><td>Eppendorf</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Metanol</td><td>Caledon Productos químicos de laboratorio</td><td>6700130</td><td></td></tr><tr><td>ácido acético glacial</td><td>Krackeler Scientific Inc.</td><td>11-9508-05</td><td></td></tr></tbody></table>

cromosoma preparación de las células cultivadas

Chromosome Preparation From Cultured Cells

Cromosoma (citogenética) análisis se utiliza ampliamente para la detección de la inestabilidad cromosómica. Cuando se sigue por bandeo G y las técnicas moleculares como la hibridación in situ fluorescente (FISH), este ensayo tiene la extraordinaria capacidad de analizar las células individuales de las aberraciones que implican ganancias o pérdidas de partes del genoma y reordenamientos que afecte a uno o más cromosomas. En los seres humanos, las anomalías cromosómicas ocurren en aproximadamente 1 de cada 160 nacidos vivos a 1,2, el 60-80% de todos los abortos involuntarios 3,4, 10% de los mortinatos 2,5, 13% de los individuos con enfermedad cardíaca congénita 6, 3-6% de los casos de infertilidad 2, y en muchos pacientes con retraso en el desarrollo y defectos de nacimiento 7. El análisis citogenético de malignidad se utiliza de forma rutinaria por los investigadores y los clínicos, ya que se ha demostrado que las observaciones de anomalías cromosómicas clonales tener tanto significado diagnóstico y pronóstico 8,9.60, el aislamiento del cromosoma tiene un valor incalculable para la terapia génica y la investigación con células madre de organismos incluyendo primates no humanos y roedores 10-13. Los cromosomas se pueden aislar a partir de células de tejidos vivos, incluyendo linfocitos de sangre, fibroblastos de la piel, amniocitos, placenta, médula ósea, y las muestras de tumor. Los cromosomas son analizados en la etapa de metafase de la mitosis, cuando más se condensan y por lo tanto más claramente visible. El primer paso de la técnica cromosoma aislamiento implica la interrupción de las fibras del huso por incubación con Colcemid, para evitar que las células de proceder a la etapa de la anafase posterior. Las células se trataron luego con una solución hipotónica y se conservan en su estado hinchado con fijador de Carnoy. Las células son luego caer sobre portaobjetos y luego se pueden utilizar para una variedad de procedimientos. Bandeo G consiste en el tratamiento de tripsina seguido de tinción con Giemsa para crear la luz característica y bandas oscuras. Lo mismo procedure para aislar cromosomas se puede utilizar para la preparación de células para los procedimientos tales como la hibridación in situ fluorescente (FISH), hibridación genómica comparativa (CGH), y cariotipo espectral (SKY) 14,15.

Metafase para untar de alta calidad son esenciales para el análisis cromosómico. Un ensayo exitoso produce cromosomas que están bien repartidas y de la morfología cromosómica adecuada. Cromosomas correctamente bandas-G contienen la luz característica y los patrones de bandas oscuras. <img alt="Figura 1" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/50203/50203fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50203/50203fig1.jpg" /> Figura 1. Una ex...

Los cromosomas se pueden aislar de las células vivas, tales como linfocitos o fibroblastos de la piel, y a partir de organismos, incluyendo seres humanos o ratones. Estas preparaciones cromosómicas se pueden utilizar más de rutina bandeo G y procedimientos citogenéticos moleculares como la hibridación fluorescente in situ (FISH), la hibridación genómica comparada (CGH) y cariotipo espectral (SKY).

Cromosoma Preparación de las células cultivadas

Chromosome (cytogenetic) analysis is widely used for the detection of chromosome instability. When followed by G-banding and molecular techniques such as ...

El objetivo general de este procedimiento es obtener y preparar cromosomas para la tinción G y pruebas citogenéticas moleculares. Primero, cultive las células hasta la fase logarítmica. Luego, coseche los cromosomas con smid, un hipotónico y un fijador.Deposite la suspensión celular sobre portaobjetos. Tiña un portaobjeto. Como control de la preparación cromosómica, realice bandeo GB o técnicas moleculares en los portaobjetos restantes.Como paso final en la bandeo GB, analice los cromosomas mediante microscopía óptica y cariotipificación. En última instancia, los cromosomas y núcleos estarán disponibles para cariotipificación o FISH. Tuve por primera vez la idea de publicar este método debido a la alta demanda de otros investigadores que solicitaban ayuda en la detección de inestabilidad cromosómica en diferentes tipos de células de diversos organismos y para pruebas citogenéticas moleculares posteriores.Esta técnica es esencial en el diagnóstico y, en última instancia, en el pronóstico de muchos trastornos genéticos congénitos, incluido el cáncer, porque permite la visualización de reordenamientos cromosómicos, que son diagnósticos. Para estos trastornos, aunque este método puede

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Investigación

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Biology

Biología

El cariotipo es una técnica sencilla y útil ampliamente utilizado para la detección de alteraciones genéticas. A continuación se describe paso a paso el protocolo para la preparación de los cromosomas propagación de células madre embrionarias humanas para controlar el estado cromosómico de estas células se mantienen en cultivo.

Preparación Extienda los cromosomas de las células estaminales embrionarias para cariotipo

Un método cuantitativo para el análisis de sincronización cromosoma replicación se describe. El método utiliza la incorporación de BrdU en combinación con...

Replicación del cromosoma Timing Combinado con fluorescente<em&gt; In situ</em&gt; La hibridación

Vías de reparación del ADN son esenciales para el mantenimiento de la integridad genómica y la prevención de la mutación y el cáncer. El objetivo de este protocolo es cuantificar la inestabilidad genómica mediante la observación directa de las aberraciones cromosómicas en metafase se propaga a partir de células B de ratón utilizando hibridación in situ fluorescente (FISH) para las repeticiones teloméricas de ADN.

Análisis rápido de aberraciones cromosómicas en linfocitos B de ratón por PNA-FISH

Los mecanismos moleculares de la descondensación de la cromatina mitótica altamente compactada están mal definidos. Presentamos un ensayo libre de células basado en clústeres de cromatina mitótica aislados de células HeLa y extracto de huevo de Xenopus laevis que reconstituye fielmente el proceso de descondensación in vitro.

Una célula de ensayo libre para el Estudio de la cromatina descondensación en la final de la mitosis

Se describe un protocolo para la preparación de distribuciones de cromosomas de plantas mitóticas de alta calidad mediante un método rápido de secado al aire adecuado para la detección FISH de sondas de ADN de copia única y alta.

Una caída Cromosoma Aire seco Rápido Método de preparación adecuados para FISH en Plantas

Este protocolo describe las técnicas para la cuantificación y caracterización de aberraciones cromosómicas in vitro en macrófagos de ratón RAW264.7 después del tratamiento con la materia en partículas del aire ambiente.

El análisis de la inducida por la materia particulada ambiental aberraciones cromosómicas El uso de una<em&gt; In Vitro</em&gt; Sistema

Presentamos un protocolo basado en la filtración para aislar núcleos de alta calidad a partir de músculo esquelético de ratón reticulado en el que eliminamos la necesidad de ultracentrifugación, haciéndolo fácilmente aplicable. Mostramos que la cromatina preparada a partir de los núcleos es adecuada para la inmunoprecipitación de la cromatina y probables estudios de secuenciación con inmunoprecipitación de la cromatina.

Un método basado en la filtración para preparar núcleos de alta calidad a partir de músculo esquelético reticulado para inmunoprecipitación de cromatina

Se trata de un método para identificar nuevas proteínas DNA-que obran recíprocamente en lugares geométricos específicos, basándose en la captura de la secuencia específica de cromatina reticular para análisis proteómicos posteriormente. No se requiere ningún conocimiento previo sobre posibles proteínas, ni modificaciones de la célula. Inicialmente desarrollado para la levadura, la tecnología ahora se ha adaptado para células de mamífero.

Adaptación de la hibridación de captura de las proteínas asociadas a cromatina para proteómica a células de mamíferos

La combinación de preparaciones de halo de ADN con hibridación fluorescente in situ permite el análisis de alta resolución de las interacciones genómicas con el nucleoesqueleto. El genoma unido conduce a señales fluorescentes hibridadas ubicadas dentro de los núcleos extraídos residuales, mientras que el genoma no unido está en el halo de ADN que rodea los núcleos residuales.

Hibridación fluorescente in situ en preparaciones de halo de ADN para revelar cromosomas completos, telómeros y loci de genes

Hi-C 3.0 es un protocolo Hi-C mejorado que combina reticulantes de formaldehído y glutarato de disuccinimidil con un cóctel de enzimas de restricción DpnII y DdeI para aumentar la relación señal-ruido y la resolución de la detección de interacción de cromatina.

Captura de la conformación cromosómica a través de escalas de longitud

Informamos de un protocolo de propagación metafásica DNA-FISH que detecta visualmente el número de copias locus y la ubicación dentro del genoma. Este enfoque permite la resolución unicelular de los estados de amplificación, específicamente en líneas celulares cancerosas que contienen ADN extracromosómico y regiones de tinción homogénea.

La metafase ADN-FISH se extiende para distinguir el ADN extracromosómico de regiones que tiñen homogéneamente en líneas celulares de cáncer humano

Aprende a preparar cromosomas a partir de células cultivadas como linfocitos y fibroblastos para técnicas de citogenética molecular. Este método permite realizar bandeo G y hibridación in situ por fluorescencia (FISH) en humanos y ratones.

Cromosoma Preparación de las células cultivadas

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