14 de abril de 2014
Lesión Explorer (LE) es una tubería semi-automático, procesamiento de imágenes desarrollado para obtener tejido cerebral regional y subcorticales volumetría lesión hiperintensidad de resonancia magnética estructural de la enfermedad de Alzheimer y ancianos normal. Para asegurar un alto nivel de precisión y fiabilidad, el siguiente es un video-guiada, protocolo estandarizado para los procedimientos manuales de LE.
El objetivo general del siguiente proyecto es comprender mejor el envejecimiento y la demencia. Mediante la obtención de medidas derivadas de la resonancia magnética de la atrofia cerebral regional y biomarcadores de neuroimagen de la enfermedad de los vasos sanguíneos pequeños. Esto se logra generando primero una máscara cerebral despojada de cráneo y una segmentación básica del tejido cerebral para cuantificar con precisión los volúmenes intracraneales totales.
Como segundo paso, se completa una segmentación de lesiones TRIFE para cuantificar y clasificar los subtipos de lesiones para mediciones precisas de biomarcadores de imágenes de la enfermedad de vasos pequeños. A continuación, se realiza un marcador anatómico en cada individuo para dividir el cerebro en 26 regiones estandarizadas de interés. Se obtienen resultados que muestran patrones diferenciales de neurodegeneración regional y vasculopatía entre grupos de enfermedades basados en la atrofia del tejido cerebral, las medidas y la volumetría de la lesión obtenida de la resonancia magnética estructural.
Nuestro enfoque de análisis puede ayudar a abordar preguntas clave en las imágenes cerebrales del envejecimiento y la demencia. El proceso personalizado que hemos desarrollado permite a los investigadores y a los médicos comprender mejor el diagnóstico, la progresión y la respuesta al tratamiento en personas individuales, así como en diferentes grupos de pacientes. Es especialmente útil para las personas que tienen enfermedad de los vasos cerebrales pequeños en combinación con trastornos neurodegenerativos.
Esto es muy común en las personas mayores, especialmente en la enfermedad de Alzheimer. La tubería también se puede aplicar a personas con otros trastornos neurológicos como demencia vascular y accidente cerebrovascular, demencia temporal frontal, lesión cerebral traumática y esclerosis múltiple. La demostración visual de este método es fundamental, ya que los pasos de la intervención manual pueden ser complejos.
Esto requiere una combinación de una sólida base de conocimientos en neuroanatomía, así como una sólida competencia y habilidades informáticas. Muchos de estos pasos se comunican mejor a través de un formato. Este vídeo permitirá al usuario visualizar correctamente las estructuras anatómicas en cuestión y mostrar las intervenciones computacionales necesarias.
Para demostrar el procedimiento estarán nuestro gerente de laboratorio, Christopher Scott, y el analista de RIN Imaging, Alicia McNeely y Courtney Beek. Para comenzar, abra el software y cargue una imagen ponderada T one y la superposición automática de máscara de bóveda intracraneal total despojada de cráneo o TIV auto. A continuación, utilice la herramienta de pincel para empezar a editar el TIV automático para añadir o recuperar el cerebro que el TIV automático no ha tenido en cuenta.
Seleccione la etiqueta de dibujo activa como etiqueta uno y dibuje sobre todas las etiquetas para recuperar el color, las áreas automáticas DIV o volver a capturar cuidadosamente las áreas no coloreadas. Usa el pincel para volver a pintar la máscara automática TIV. Revise todas y cada una de las rebanadas cuidadosamente para asegurarse de que solo el tejido cerebral esté pintado de verde como etiqueta, y todo el tejido que no sea de cerebroina tenga otra etiqueta.
Si es difícil pintar, use la herramienta de polígono cerrado, vuelva a capturar el TIV automático según corresponda y elimine el TI automático según corresponda. Cuando esté satisfecho con las modificaciones de TIV, guarde la imagen como edición de TIV para comenzar la reasignación ventricular. Cargue la imagen seg sobre la imagen IHC T one y, a continuación, ajuste las etiquetas de dibujo a los colores adecuados.
A continuación, reasigne vóxeles CSF utilizando la herramienta de relleno de inundación, alterne entre el relleno de inundación y los límites de dibujo pulsando el espacio. Los límites de barras se utilizan para evitar que el relleno de inundación llene ciertas áreas del ventrículo que se consideran agujeros negros periventriculares o parte de las hiperintensidades de la sustancia blanca. Utilice la imagen ponderada T one como guía en cuanto a qué rellenar y qué no rellenar para el lóbulo temporal.
La segmentación de los ventrículos laterales se puede activar y desactivar con la tecla S. Cuando termine, guarde la segmentación para la extracción del tronco encefálico, el cerebelo y las estructuras subtentoriales. Seleccione la herramienta polígono y, con la segmentación desactivada, desplácese hasta la primera división en la que comienza el cerebelo.
A continuación, haz clic con el botón izquierdo para dibujar un polígono sobre la duramadre que rodea el cerebelo y a lo largo de la base del tronco encefálico a través de los callos. A continuación, haga clic con el botón derecho para cerrar el polígono y haga clic en aceptar para eliminar esa área de la segmentación. El área ahora mostrará la T debajo, lo que indica que ya no está incluida en la segmentación.
Una vez que el pedúnculo cerebral se separe, comience también a extirpar el tronco encefálico y la médula espinal. Ahora desplácese hacia arriba por la imagen corte por corte para verificar que las únicas partes de la segmentación que quedan son tejido cerebral cerebral. Cuando termine, guarde la segmentación.
Para comenzar a cargar la imagen ISO y el archivo mat para una alineación CPC Primero, acérquese con la herramienta de navegación. A continuación, utilice las herramientas de paso hacia arriba, hacia abajo y hacia arriba hacia abajo para ajustar la vista axial de modo que la comisura anterior sea más gruesa y la comisura posterior sea recta. Esto debería terminar formando una bonita forma de ojo de cerradura.
Reajuste la vista para llevar los globos oculares al campo de visión. Ahora ajuste el balanceo equilibrando los globos oculares en la vista axial. Las cortes axiales deben verse uniformemente equilibradas mientras se desplaza por la imagen.
Un corte a la vez, ajústelo asegurándose de que la cruz vertical pase a través del plano sagital medio. En la vista axial, a veces puede ser difícil hacer que el avión se alinee perfectamente debido a la curvatura natural del cerebro en los polos, crear el mejor ajuste posible. Para comenzar, cargue la imagen para la identificación de puntos de referencia.
Primero, haga clic en el botón de radio CA a la izquierda para seleccionar el punto de referencia que desea definir. A continuación, haga clic en el CA en la vista axial. A continuación, haga clic en el botón de opción PC a la izquierda y, a continuación, en PC en la imagen axial.
Ahora haga clic en el botón de radio PE para definir el borde posterior del cerebro en esa rebanada, y luego haga clic en la parte más posterior del cerebro, ya sea a la izquierda o a la derecha. Esto completará los valores de un corte coronal, que se utilizará momentáneamente. Haga clic en el botón de opción ca para definir el canal central.
A continuación, desplácese hacia abajo 10 cortes desde la vista axial actual y haga clic en el centro del canal central. Esto rellena el valor del corte sagital, que se utilizará ahora como punto de partida para encontrar el plano sagital medio. A continuación, haga clic en el botón de opción M para definir el plano sagital medio.
Luego haga clic en el botón de radio LPR para definir la muesca preoccipital izquierda y en el botón de radio RPR para definir la muesca preoccipital del hemisferio derecho. Para la creación de mapas de objetos, haga clic en el botón de opción LSC para definir el surco central superior izquierdo. Haga clic con el botón izquierdo para colocar un marcador en la duramadre por encima del surco.
Haga clic en el botón de opción LOP para definir el surco parietal occipital izquierdo. Este trazado del surco se extiende desde la duramadre hasta el tentorium cere para los trazados enlucidos en la superficie. Comience a trazar la Sylvie y la fisura desde el extremo posterior hasta el anterior, comenzando en el punto en el que se bifurca en pequeñas ramas ascendentes y descendentes.
Ahora haga clic en el botón de radio lc para trazar el surco central izquierdo. Comience desde el extremo inferior en el punto de Sylvie y la fisura directamente debajo de la terminación del surco. Termina de trazar el surco en el extremo superior hasta que sea difícil seguir la curvatura del cerebro.
Por último, haga clic en el botón derecho debajo del punto de vista 3D y repita los pasos para la Sylvie y la fisura correctas y el surco central derecho para la segmentación de la lesión con DP o T dos exploraciones. En primer lugar, revise todas las imágenes disponibles, incluidas las T, PD y T dos, para tomar una decisión informada sobre qué capturar como lesión cerebral. A continuación, utilice la herramienta de pincel para pintar la etiqueta dos sobre la etiqueta uno para indicar las áreas con la lesión.
La segmentación se puede activar y desactivar con la tecla S. Además, pinte la etiqueta uno sobre la etiqueta dos para indicar cualquier falso positivo o error en las exploraciones con imágenes de destello. Una vez más, use todas las imágenes disponibles según sea necesario para informar la decisión sobre qué áreas constituyen la lesión.
A continuación, utilice el pincel para cambiar las etiquetas para indicar la lesión y los falsos positivos. Cuando esté satisfecho con las modificaciones en la segmentación de la lesión, guarde la imagen editada final. Aquí podemos ver dos ejemplos que muestran los procedimientos de marcado de SABRE.
El corte axial de la izquierda muestra el A CPC alineado con el T uno con el ac, el PC y las ubicaciones de los puntos de referencia del borde posterior. La superficie 3D renderizada T one tiene una fisura de Sian y una delineación del surco central. Esta DP axial tiene una superposición de lesiones generada automáticamente y una superposición de lesiones editada manualmente.
Este es un ejemplo del procedimiento de reetiquetado manual que se completa como parte del proceso del explorador de lesiones, y aquí podemos ver un ejemplo del procedimiento de reetiquetado manual que se completa como parte del proceso de flexión. El ensanchamiento axial tiene una superposición de lesión generada automáticamente y una superposición de lesión editada manualmente. Consulte el manuscrito que acompaña a este video para conocer los métodos para evaluar la confiabilidad de los procedimientos de extracción de cerebro.
Al intentar este procedimiento, es importante recordar que existe una variación anatómica de un sujeto a otro, y aunque este protocolo proporciona pautas a seguir, la experiencia y el conocimiento anatómico son cruciales para garantizar el éxito una vez dominado, esta técnica se puede realizar en una hora a una hora y media por sujeto después de este procedimiento. Se pueden realizar otros métodos como la segmentación de las hiperintensidades colinérgicas básicas de Rika Robins y los trazados de trazos. Esto permite a los investigadores responder a preguntas adicionales, como la contribución de la lesión vascular específica en el estudio de la demencia.
Después de ver este video, debe tener una buena comprensión de cómo implementar de manera precisa y confiable la línea de procesamiento de resonancia magnética Explorador de lesiones para el análisis volumétrico como parte de las herramientas Sabre Brain. Este software está disponible de forma gratuita. Descargar online@sabrebrainlab.ca.
Lesion Explorer (LE) es una tubería semiautomática de procesamiento de imágenes diseñada para analizar tejido cerebral y lesiones de hiperintensidad en la enfermedad de Alzheimer y el envejecimiento normal. Este protocolo tiene como objetivo mejorar la precisión de las mediciones volumétricas derivadas de resonancia magnética.
Las mediciones volumétricas precisas derivadas de la resonancia magnética son fundamentales para reducir los riesgos en la validación de dianas neurodegenerativas y permitir una cuantificación confiable de biomarcadores en la investigación del Alzheimer y del envejecimiento. La canalización Lesion Explorer aborda la variabilidad técnica provocada por la atrofia y los cambios en la sustancia blanca, favoreciendo lecturas neuroimagenológicas consistentes en estudios preclínicos y traslacionales. Esta estandarización mejora la confianza predictiva en la prueba de hipótesis terapéuticas y en la selección de carteras para programas de desarrollo de fármacos del sistema nervioso central.
La tubería Lesion Explorer se integra en el continuo de descubrimiento desde la validación temprana de objetivos hasta el desarrollo preclínico, proporcionando biomarcadores neuroimagenológicos cuantitativos estandarizados que respaldan la selección basada en hipótesis y la reducción de riesgos mecanicistas.