10 de noviembre de 2015
El objetivo de este manuscrito es estudiar el hipocampo y los subcampos del hipocampo utilizando resonancia magnética. El manuscrito describe un protocolo para segmentar el hipocampo y cinco subestructuras del hipocampo: cornu ammonis (CA) 1, CA2/CA3, CA4/giro dentado, estratos radiatum/lacunosum/molecular y subículo.
El objetivo general de este protocolo es proporcionar un método fiable y anatómicamente preciso para segmentar el hipocampo humano con subcampos en imágenes de resonancia magnética. Aquí, los subcampos del hipocampo se dividen en cinco etiquetas, CA uno, CA dos, ca tres, CA cuatro, giro dentado, S-R-S-L-S-M y el icm. Este método puede ayudar a responder preguntas clave en el campo de la neuroimagen, como cómo cambia la estructura del subcampo del hipocampo en estados sanos y patológicos.
La principal ventaja de esta técnica es que se adapta a imágenes de alta resolución recogidas en un escáner de tres T, e incluye definiciones de subcampos para toda la longitud anteroposterior del hipocampo. Comience ingresando la siguiente escena de comandos aquí en el terminal. Para abrir la interfaz de software en una imagen ponderada T uno, amplíe la vista coronal y acerque el hipocampo, seleccione segmentación en la ventana de navegación y, a continuación, seleccione radio XY.
Establezca el tamaño del pincel XY en 0,1. Desplácese hasta la rebanada más anterior coronal del hipocampo para obtener la rebanada a, la rebanada mott anterior. Dibuja el borde más externo de la sustancia gris del hipocampo donde se encuentra con la sustancia blanca del lóbulo temporal circundante, y usa la sustancia blanca de alta intensidad de las alvas para ayudar con el borde superior.
Utilice la tecla de relleno de etiqueta en el menú de segmentación de la ventana de navegación para rellenar la etiqueta dentro del borde. Para la rebanada B, ganó la cabeza del hipocampo. Continúa dibujando los bordes de la cabeza del hipocampo usando la sustancia blanca del lóbulo temporal y las alvas como guía.
A continuación, para la rebanada C, el hipocampo encabeza dos con daciones. Dibuja las daciones del hipocampo utilizando la sustancia blanca del alius. A continuación, utilice la vista axial para dibujar una línea horizontal desde el borde anterior del hipocampo lateral y designe todo lo que esté por debajo de esta línea como parte del hipocampo.
Ahora, para la rebanada D, la cabeza del hipocampo, tres, dibuja el borde inferior del hipocampo en la sustancia blanca del lóbulo temporal y el borde lateral en el asta inferior del ventrículo lateral. Dibuje el borde superior en la sustancia blanca del alius fibr y el borde medial en la región hipo intensa de la cisterna ambiental. Para el corte, E, dibuje los bordes inferior, lateral, superior y medial.
Al igual que antes, defina el borde medial dibujando la porción inferior del borde medial donde el hipocampo se adelgaza ligeramente y se extiende hacia la sustancia gris de la corteza interna. En estos cortes, incluya la responsabilidad en las segmentaciones del hipocampo. Luego designe el cuerpo del hipocampo en la F.As antes, no incluya el líquido cefalorraquídeo de baja intensidad del surco vestigial del hipocampo en la segmentación.
Ahora, para el segmento de corte G, la cola del hipocampo comienza a segmentar la cola. Cuando el crucero del fórnix es visible por primera vez. Excluya la circunvolución vesicular extrapolando la forma de la circunvolución vesicular a la cola del hipocampo para obtener cortes más anteriores.
Cuando ya no se pueda distinguir la circunvolución vesicular, trate toda la materia gris visible como la cola del hipocampo. Luego, para la rebanada H, el segmento de dos segmentos de la cola del hipocampo, la materia gris de baja intensidad de la cola del hipocampo posterior de la sustancia blanca circundante de alta intensidad. Finalmente, el segmento de corte más posterior, la pequeña área restante de la materia gris del hipocampo de la sustancia blanca circundante del lóbulo temporal.
Comience desplazándose hasta la corte coronal más anterior del hipocampo en una imagen ponderada T dos. Cambie el color del pincel seleccionando establecer etiqueta de pintura e ingresando un número entre uno y 255 en el terminal. Para la rebanada A, la más anterior, dibuje una línea que divida la materia gris visible del hipocampo a lo largo de su eje visible más largo en dos secciones iguales.
Use dos colores diferentes para etiquetar la superior de estas dos secciones como ca one y la sección inferior como el sulu para la rebanada B, la cabeza del hipocampo. Etiquete el área de baja intensidad en el medio de la formación del hipocampo. Como SR SLSM, defina el csum inferolateral ca un borde en la curva del hipocampo inferior.
Continúe siguiendo el eje más largo del hipocampo para dibujar el borde ca one sulu en la punta medial superior para la rebanada C, la cabeza del hipocampo. Dos con tentaciones. Etiquete la banda oscura S-R-S-L-S-M que sigue la curva de la etiqueta ca uno, cualquier materia gris de alta intensidad dentro del S-R-S-L-S-M como CA cuatro dg.
A continuación, defina el borde sicm ca one utilizando la curva y el hipocampo inferior. Defina la frontera entre CA uno y ca dos, CA tres como una línea de ángulo de 45 grados, que se extiende en la dirección superolateral desde el borde más superolateral de la S-R-S-L-S-M. Extienda el ca dos CA tres medialmente a lo largo del borde superior hasta el canal entre las daciones y etiquete el resto del borde superior como ca uno para la rebanada D, la cabeza del hipocampo tres.
Etiquete el S-R-S-L-S-M CA four, DG e ICM exactamente como se acaba de describir. Para la porción C, extienda CA dos, CA tres medialmente hasta la mitad a lo largo del borde superior y etiquete la otra mitad del borde superior como CA uno. Divide la cabeza del hipocampo supermedial verticalmente por la mitad.
Etiquete la mitad medial como S-R-S-L-S-M. Luego, horizontalmente, divida la mitad lateral por la mitad. De nuevo, etiquete la parte inferior como CA dos, CA tres, y etiquete la parte superior como CA cuatro DG para la rebanada E, la cabeza del hipocampo cuatro con Angus.
Defina el borde del saeculum ca one como una línea vertical que se extiende en la dirección inferior desde el borde más medial del can four dg. Continúe definiendo los bordes CA uno, CA dos, CA tres s, RSL, SM y ca cuatro DG. Al igual que antes, etiquete la responsabilidad del hipocampo a medida que la cabeza del hipocampo pasa al cuerpo del hipocampo en la etiqueta de responsabilidad, la región de baja intensidad en el centro como SRSL sm.
Continuando en la corte E, trace una línea en el borde superior de la sección S-R-S-L-S-M a lo largo del eje supermedial inferolateral de la etiqueta UCAS. Toda la materia gris por encima de esta línea como CA dos, CA tres, etiquete cualquier materia gris no etiquetada por debajo de esta línea como CA cuatro D.Next, o corte F, el cuerpo del hipocampo. Continúe aplicando los bordes para el sulu S-R-S-L-S-M ca cuatro, DG ca dos, CA tres como se mencionó para la rebanada E en la rebanada G, la cola del hipocampo uno.
El borde ICM ca one se convierte en una línea de ángulo de 45 grados, que se extiende en la dirección inframedial desde el borde medial del CA cuatro DG para el corte H. La cola del hipocampo dos etiqueta la capa interna de baja intensidad como S-R-S-L-S-M y la capa externa de alta intensidad como CA uno. Una vez que el giro vesicular ya no se puede distinguir de la formación del hipocampo, etiquete cualquier materia gris restante en el medio como CA cuatro dg. Finalmente, para el ojo de corte, el corte más posterior deja toda la estructura como CA uno.
Una vez que el oscuro S-R-S-L-S-M ya no es visible en la formación del hipocampo, este protocolo utiliza imágenes de resonancia magnética para segmentar el hipocampo humano. Aquí, todo el hipocampo se divide en nueve cortes coronales utilizando imágenes ponderadas T uno. A continuación, se segmentan cinco subcampos del hipocampo utilizando T dos imágenes ponderadas aquí, el CA uno, el CA dos, el CA tres, el CA cuatro, el giro denato, S-R-S-L-S-M y el ICM se pueden ver dentro de este corte de cabeza del hipocampo.
Una vez dominada, esta técnica se puede completar para cada tema en 40 horas si se realiza correctamente. Es importante recordar seguir los patrones de intensidad en las imágenes tanto como sea posible y ser coherente con los límites entre los sujetos siguiendo este procedimiento. Se pueden realizar otras técnicas de segmentación automatizada para responder preguntas sobre el volumen y la forma del hipocampo en poblaciones vulnerables, como las que experimentan un envejecimiento saludable o padecen la enfermedad de Alzheimer.
Después de ver este vídeo, debería ser capaz de replicar de forma fiable este protocolo y obtener información sobre la anatomía detallada del subcampo del hipocampo de sus sujetos.
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Este manuscrito presenta un protocolo para segmentar el hipocampo humano y sus subcampos mediante resonancia magnética. Se centra en ofrecer un método anatómicamente preciso adaptado a imágenes de alta resolución.
La segmentación manual de alta resolución de subcampos del hipocampo mediante resonancia magnética de 3T permite una delimitación anatómica precisa, fundamental para el descubrimiento temprano y la investigación y desarrollo en neurociencia traslacional. Este protocolo posibilita un análisis cuantitativo robusto de la morfología hipocampal, facilitando la reducción de riesgos mecanicistas y la validación de objetivos en la investigación de enfermedades neuropsiquiátricas y neurodegenerativas. Una segmentación confiable de los subcampos mejora la confianza predictiva en el desarrollo de biomarcadores y en las decisiones de selección de carteras.
Este protocolo de segmentación se integra en la continuidad desde el descubrimiento hasta la fase preclínica, proporcionando datos anatómicos fundamentales para la comprobación de hipótesis, la identificación de compuestos activos y el desarrollo de biomarcadores traslacionales.