Métodos para descubrir uso promotor alternativo y la regulación transcripcional de murino BCRP1

El objetivo general de este conjunto de protocolos es detectar primeros exones alternativos en el ARNm de un gen como Bcrp1 y establecer ensayos reporteros basados en luciferasa para los promotores putativos aguas arriba de los primeros exones alternativos identificados. Los métodos in silico utilizados pueden ayudar a responder preguntas clave en el campo de la transcripción y la regulación, como cómo se controla la expresión de ARNm en diferentes tejidos. La principal ventaja de esta técnica es que utiliza datos genéticos disponibles públicamente para identificar primeros exones alterativos en el ARNm del gen de interés, lo que implica el uso de promotores alternativos.

Este método, que prepara, construye informes y realiza ensayos reporteros, puede ayudar a responder preguntas clave en el campo de la regulación de genes, como la actividad funcional de promotores alternativos putativos. Para comenzar este procedimiento, obtenga la secuencia para el exón 2 Bcrp1 del ratón introduciendo el ID de secuencia de referencia de ARNm en la ventana de búsqueda del navegador de genomas Ensembl y haga clic en Ir.A continuación, seleccione una secuencia completa que contenga 16 exones. Haga clic en la opción Secuencia de descarga.