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DOI: 10.3791/53832-v
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La integración de los datos de los experimentos de secuenciación de todo el genoma y los experimentos de metabolómica es un desafío. En este trabajo reportamos, por primera vez, la generación, análisis e integración de datos de transcriptoma, cistroma y metaboloma de células de cáncer de mama tratadas con estradiol.
El objetivo general de este experimento es comprender la regulación metabólica directa del RE alfa en el cáncer de mama, utilizando datos de transcriptoma, systroma y metaboloma de todo el genoma. Este método puede ayudar a responder preguntas clave en los campos de los nucleorreceptores y la biología del cáncer, como el papel de ciertos factores de transcripción en la regulación del metabolismo para contribuir a la agresividad celular. La principal ventaja de esta técnica es que proporciona una imagen global del gen y los matices de la regulación metabólica resultante.
La demostración del procedimiento estará a cargo de Yiru Chen, becario postdoctoral de mi laboratorio. Después de cultivar las células MCF7 de acuerdo con el protocolo de texto, coseche las células agregando un mililitro de reactivo de aislamiento de ARN a cada pocillo e incube a temperatura ambiente durante cinco minutos. Utilice una pipeta para recoger el lisado celular y transferirlo a tubos de 1,5 mililitros.
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