El uso de ARN de secuenciación para detectar novela de empalme variantes relacionadas con la resistencia de drogas en

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9 de diciembre de 2016

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Rocco Sciarrillo¹^,²^,³ , Anna Wojtuszkiewicz¹ , Irsan E. Kooi⁴ , Valentina E. Gómez³ , Ugo Boggi⁵ , Gerrit Jansen⁶ , Gert-Jan Kaspers¹^,⁷ , Jacqueline Cloos^*¹ , Elisa Giovannetti^*³^,⁸^,⁹

¹Department of Pediatric Oncology/Hematology, VU University Medical Center, ²Department of Hematology, VU University Medical Center, ³Department of Medical Oncology, VU University Medical Center, ⁴Department of Clinical Genetics, VU University Medical Center, ⁵Division of General and Transplant Surgery, Azienda Ospedaliera Universitaria Pisana, Universita’ di Pisa, ⁶Amsterdam Immunology and Rheumatology Center, VU University Medical Center, ⁷Princess Máxima Center for Pediatric Oncology, ⁸Cancer Pharmacology Lab, AIRC Start-Up Unit, University of Pisa, ⁹Institute of Nanoscience and Nanotechnology, CNR-Nano

^* These authors contributed equally

Aquí se describe un protocolo destinado a investigar el impacto de corte y empalme aberrante de resistencia a fármacos en tumores sólidos y neoplasias hematológicas. Para este objetivo, se analizaron los perfiles de transcriptómica de modelos parentales y resistentes in vitro a través de RNA-seq y establecimos un método basado QRT-PCR para validar los genes candidatos.