Real-time Analysis of Transcription Factor Binding, Transcription, Translation, and Turnover to Display Global Events During Cellular Activation

Kathrin Davari; Johannes Lichti; Caroline C. Friedel; Elke Glasmacher

doi:10.3791/56752

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Análisis en tiempo real del Factor de transcripción vinculante, transcripción, traducción y rotación para mostrar los eventos globales durante la activación celular

Real-time Analysis of Transcription Factor Binding, Transcription, Translation, and Turnover to Display Global Events During Cellular Activation

JoVE Revista
Genética

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Real-time Analysis of Transcription Factor Binding, Transcription, Translation, and Turnover to Display Global Events During Cellular Activation

Análisis en tiempo real del Factor de transcripción vinculante, transcripción, traducción y rotación para mostrar los eventos globales durante la activación celular

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12:54 min

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March 07, 2018

DOI:

10.3791/56752-v

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10.3791/56752-v

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March 07, 2018

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Kathrin Davari*¹, Johannes Lichti*¹, Caroline C. Friedel², Elke Glasmacher^1,3

¹Institute for Diabetes and Obesity (IDO), German Center for Diabetes Research (DZD),Helmholtz Zentrum München ²Institute for Informatics,Ludwig-Maximilians-Universität München ³Roche Pharma Research and Early Development, Large Molecule Research,Roche Innovation Center Penzberg

Summary

Este protocolo describe el uso combinatorio de ChIP-seq, 4sU-seq, total RNA-seq y perfiles para las líneas celulares y células primarias del ribosoma. Permite el seguimiento de cambios en el factor de transcripción vinculante, novo de transcripción, procesamiento de RNA, rotación y traducción con el tiempo y viendo el curso general de los acontecimientos en las células activadas o cambiantes.