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DOI: 10.3791/59712-v
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Diagnostic fragmentation filtering is a method for detecting structurally-related natural products within complex mixtures. Implemented in MZmine, this approach enables the exploration of mass spectrometry datasets for new compounds that may otherwise be overlooked.
El filtrado de fragmentación de diagnóstico, implementado en MZmine, es un enfoque elegante de postadquisición para la pantalla de datasets LC-MS/MS para clases enteras de productos naturales conocidos y desconocidos. Esta herramienta busca espectros MS/MS para los iones de producto y/o pérdidas neutrales que el analista ha definido como diagnóstico para toda la clase de compuestos.
Los productos naturales a menudo se biosintetizan como una clase de compuestos, y no como un solo producto. El filtrado de fragmentación de diagnóstico es un enfoque sencillo para detectar todos los compuestos relacionados estructuralmente dentro de una mezcla compleja. El filtrado de fragmentación de diagnóstico, implementado en el software MZmine, permite al analista explorar conjuntos de datos de espectrometría de masas para nuevos productos naturales que de otro modo se perderían.
Esto incluye nuevos bioproductos, y también nuevas toxinas. El filtrado de fragmentación diagnóstica, aplicado a las clases de toxinas que contaminan los alimentos y el agua, puede informar las evaluaciones de la exposición. Cuando se aplica a extractos microbianos y vegetales, puede resultar en el descubrimiento de nuevos compuestos.
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