July 3rd, 2020
Los modelos de efectos mixtos son herramientas flexibles y útiles para analizar datos con una estructura estocástica jerárquica en la silvicultura y también podrían utilizarse para mejorar significativamente el rendimiento de los modelos de crecimiento forestal. Aquí se presenta un protocolo que sintetiza información relacionada con modelos lineales de efectos mixtos.
Este protocolo proporciona los procedimientos clave para desarrollar un modelo de incremento de área basal de árbol individual utilizando un enfoque lineal de efectos mixtos. La característica principal de esta técnica es que puede analizar datos con estructuras complejas en silvicultura y mejorar significativamente el rendimiento de los modelos de crecimiento forestal. Comience leyendo el conjunto de datos de desarrollo del modelo y cargando el paquete nlme" en el software R.
Seleccione gráficos de muestra como efectos aleatorios para desarrollar el modelo de efectos mixtos. Ajuste todas las combinaciones posibles de efectos aleatorios con el método de máxima verosimilitud y genere los resultados. Establezca la intersección en parámetros aleatorios y, a continuación, cambie las instrucciones aleatorias hasta que se ajusten todas las combinaciones.
En el proceso de ajuste, los códigos pueden informar de errores debidos a la falta de convergencia del modelo montado. Seleccione el mejor modelo según el criterio de información de Akaike, el criterio de información bayesiano, la verosimilitud logarítmica y la prueba de razón de verosimilitud. Observe si los residuos tienen heterocedasticidad de la parcela residual.
Si hay heterocedasticidad, introduzca la función de potencia constante plus, la función de potencia y la función exponencial para modelar la estructura de varianza de los errores. Determine la mejor función de varianza para el modelo de acuerdo con el criterio de información de Akaike, el criterio de información bayesiano, la verosimilitud logarítmica y la prueba de razón de verosimilitud. A continuación, presente la estructura de simetría compuesta, la estructura autorregresiva de primer orden y una combinación de estructuras autorregresivas y de medias móviles de primer orden para tener en cuenta la autocorrelación.
Determine la mejor estructura de autocorrelación de acuerdo con el criterio de información de Akaike, el criterio de información bayesiano, la verosimilitud logarítmica y la prueba de razón de verosimilitud. Genere los resultados finales del modelo de efectos mixtos utilizando el método de máxima verosimilitud restringida. Con esta ecuación se expresa el modelo básico de incremento de área basal para P. asperata.
Aquí se muestran las estimaciones de los parámetros, sus correspondientes errores estándar y los estadísticos de falta de ajuste. Se observó una pronunciada heterocedasticidad de los residuos. Hubo 31 combinaciones posibles de parámetros de efectos aleatorios para el modelo básico de incremento de área basal.
Después del ajuste, 300 combinaciones alcanzaron la convergencia. Entre estas 30 combinaciones, se seleccionó el Modelo 30 porque producía el AIC más bajo, el BIC más bajo y el Loglik más grande. Además, el LRT fue significativamente diferente en comparación con los otros modelos.
Aquí se muestra el modelo lineal de efectos mixtos con funciones de varianza y estructuras de correlación. De acuerdo con el AIC, BIC, Loglik y LRT, la función exponencial y AR(1) fueron seleccionadas como la mejor función de varianza y estructura de autocorrelación, respectivamente. El modelo lineal final de incremento de área basal de árbol individual de efectos mixtos se propuso utilizando el método REML.
Aquí se muestran los parámetros fijos estimados, sus correspondientes errores estándar y las estadísticas de falta de ajuste. Se observó una mejora significativa en los residuos. Las estadísticas de predicción de los dos modelos muestran que el rendimiento del modelo lineal de efectos mixtos mejoró significativamente en comparación con el modelo básico.
Cuando se completen las comparaciones de modelos, recuerde utilizar el método de máxima verosimilitud restringida para generar los resultados finales.
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Este estudio presenta un protocolo para desarrollar un modelo de incremento de área basal de árboles individuales utilizando modelado de efectos mixtos lineales. Emplea técnicas estadísticas complejas para analizar estructuras de datos jerárquicas encontradas en silvicultura, con el objetivo de mejorar las predicciones del crecimiento forestal.
This protocol demonstrates how advanced statistical modeling of hierarchical biological data can improve predictive accuracy in complex natural systems. By accounting for within-group variability and residual structures, the approach enhances confidence in extrapolating individual-level responses to population-level outcomes. Such methodological rigor supports de-risking in early-stage biological hypothesis testing where variability across experimental units obscures signal detection.
The method fits within the discovery continuum from target hypothesis screening to lead optimization, where robust statistical modeling is essential for interpreting noisy biological data.