Name: Flujo de trabajo estandarizado SDS-PAGE para el perfilado personalizado de corona de proteínas en la detección temprana del cáncer (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-12-19T12:50:00.000+00:00
Duration: 10 min 2 s
Description: Aprende a estandarizar SDS-PAGE para perfilar coronas de proteínas en nanopartículas y detectar cáncer de páncreas precoz. Este método reproducible ofrece una alternativa económica y aplicable en entornos clínicos.

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<ol><li>Cai, R., Chen, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+crown+and+the+scepter%3A+Roles+of+the+protein+corona+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Mater%22%5BJournal%5D)">The crown and the scepter: Roles of the protein corona in nanomedicine.</a> Adv Mater. 31 (45), 1805740(2019).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanotechnology+meets+oncology%3A+A+perspective+on+the+role+of+the+personalized+nanoparticle-protein+corona+in+the+development+of+technologies+for+pancreatic+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Mol+Sci%22%5BJournal%5D)">Nanotechnology meets oncology: A perspective on the role of the personalized nanoparticle-protein corona in the development of technologies for pancreatic cancer detection.</a> Int J Mol Sci. 23 (18), 10591(2022).</li>
<li>Lundqvist, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+evolution+of+the+protein+corona+around+nanoparticles%3A+A+test+study%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nano%22%5BJournal%5D)">The evolution of the protein corona around nanoparticles: A test study.</a> ACS Nano. 5 (9), 7503-7509 (2011).</li>
<li>Hajipour, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+protein+coronas%3A+A+%26%2334%3Bkey%26%2334%3B+factor+at+the+nanobiointerface%5BTitle%5D)+AND+%22Biomater+Sci%22%5BJournal%5D)">Personalized protein coronas: A &#34;key&#34; factor at the nanobiointerface.</a> Biomater Sci. 2 (9), 1210-1221 (2014).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona-enabled+serological+tests+for+early-stage+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Sens+Int%22%5BJournal%5D)">Protein corona-enabled serological tests for early-stage cancer detection.</a> Sens Int. 1, 100025(2020).</li>
<li>Caracciolo, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Size+and+charge+of+nanoparticles+following+incubation+with+human+plasma+of+healthy+and+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Colloids+Surf+B+Biointerfaces%22%5BJournal%5D)">Size and charge of nanoparticles following incubation with human plasma of healthy and pancreatic cancer patients.</a> Colloids Surf B Biointerfaces. 123, 673-678 (2014).</li>
<li>Barrán-Berdón, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Time+evolution+of+nanoparticle-protein+corona+in+human+plasma%3A+Relevance+for+targeted+drug+delivery%5BTitle%5D)+AND+%22Langmuir%22%5BJournal%5D)">Time evolution of nanoparticle-protein corona in human plasma: Relevance for targeted drug delivery.</a> Langmuir. 29 (21), 6485-6494 (2013).</li>
<li>Yu, Y., Luan, Y., Dai, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+process%2C+mechanisms%2C+influencing+factors%2C+and+study+methods+of+protein+corona+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biol+Macromol%22%5BJournal%5D)">Dynamic process, mechanisms, influencing factors, and study methods of protein corona formation.</a> Int J Biol Macromol. 205, 731-739 (2022).</li>
<li>Hadjidemetriou, M., Kostarelos, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolution+of+the+nanoparticle+corona%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Nanotechnol%22%5BJournal%5D)">Evolution of the nanoparticle corona.</a> Nat Nanotechnol. 12 (4), 288-290 (2017).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+protein+corona-enabled+blood+test+for+early+cancer+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Nanoscale%22%5BJournal%5D)">A protein corona-enabled blood test for early cancer detection.</a> Nanoscale. 9 (1), 349-354 (2017).</li>
<li>Pozzi, D., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aPozzi%2C+D+%22Exploiting+differences+in+personal+nanoparticle+corona+profiles+for+cancer+diagnostics%22">Exploiting differences in personal nanoparticle corona profiles for cancer diagnostics</a>. , Taylor & Francis. 431-433 (2025).</li>
<li>Vence, M. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Potential+clinical+applications+of+the+personalized%2C+disease-specific+protein+corona+on+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chim+Acta%22%5BJournal%5D)">Potential clinical applications of the personalized, disease-specific protein corona on nanoparticles.</a> Clin Chim Acta. 501, 102-111 (2020).</li>
<li>Di Domenico, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-biomolecular+corona%3A+A+new+approach+for+the+early+detection+of+non-small-cell+lung+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Physiol%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-biomolecular corona: A new approach for the early detection of non-small-cell lung cancer.</a> J Cell Physiol. 234 (6), 9378-9386 (2019).</li>
<li>Papi, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exploitation+of+nanoparticle-protein+interactions+for+early+disease+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Phys+Lett%22%5BJournal%5D)">Exploitation of nanoparticle-protein interactions for early disease detection.</a> Appl Phys Lett. 114 (16), 163702(2019).</li>
<li>Di Santo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona+profile+of+graphene+oxide+allows+detection+of+glioblastoma+multiforme+using+a+simple+one-dimensional+gel+electrophoresis+technique%3A+A+proof-of-concept+study%5BTitle%5D)+AND+%22Biomater+Sci%22%5BJournal%5D)">Protein corona profile of graphene oxide allows detection of glioblastoma multiforme using a simple one-dimensional gel electrophoresis technique: A proof-of-concept study.</a> Biomater Sci. 9 (13), 4671-4678 (2021).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synergistic+analysis+of+protein+corona+and+haemoglobin+levels+detects+pancreatic+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Synergistic analysis of protein corona and haemoglobin levels detects pancreatic cancer.</a> Cancers. 13 (1), 93(2020).</li>
<li>Colapicchioni, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+liposome-protein+corona+in+the+blood+of+breast%2C+gastric+and+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Biochem+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Personalized liposome-protein corona in the blood of breast, gastric and pancreatic cancer patients.</a> Int J Biochem Cell Biol. 75, 180-187 (2016).</li>
<li>Di Santo, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Personalized+graphene+oxide-protein+corona+in+the+human+plasma+of+pancreatic+cancer+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Bioeng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Personalized graphene oxide-protein corona in the human plasma of pancreatic cancer patients.</a> Front Bioeng Biotechnol. 8, 491(2020).</li>
<li>Digiacomo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+pancreatic+cancer+detection+through+personalized+protein+corona+of+gold+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Biointerphases%22%5BJournal%5D)">Efficient pancreatic cancer detection through personalized protein corona of gold nanoparticles.</a> Biointerphases. 16 (1), 011010(2021).</li>
<li>Caputo, D., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-enabled+blood+tests+for+early+detection+of+pancreatic+ductal+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Lett%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-enabled blood tests for early detection of pancreatic ductal adenocarcinoma.</a> Cancer Lett. 470, 191-196 (2020).</li>
<li>Caracciolo, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Challenges+in+molecular+diagnostic+research+in+cancer+nanotechnology%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">Challenges in molecular diagnostic research in cancer nanotechnology.</a> Nano Today. 27, 6-10 (2019).</li>
<li>Ashkarran, A. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measurements+of+heterogeneity+in+proteomics+analysis+of+the+nanoparticle+protein+corona+across+core+facilities%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Measurements of heterogeneity in proteomics analysis of the nanoparticle protein corona across core facilities.</a> Nat Commun. 13 (1), 6610(2022).</li>
<li>Pederzoli, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+corona+and+nanoparticles%3A+How+can+we+investigate+on%5BTitle%5D)+AND+%22Wiley+Interdiscip+Rev+Nanomed+Nanobiotechnol%22%5BJournal%5D)">Protein corona and nanoparticles: How can we investigate on.</a> Wiley Interdiscip Rev Nanomed Nanobiotechnol. 9 (6), e1467(2017).</li>
<li>Otoo, J. A., Schlappi, T. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((REASSURED+multiplex+diagnostics%3A+A+critical+review+and+forecast%5BTitle%5D)+AND+%22Biosensors%22%5BJournal%5D)">REASSURED multiplex diagnostics: A critical review and forecast.</a> Biosensors. 12 (2), 124(2022).</li>
<li>Papi, M., Caracciolo, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Principal+component+analysis+of+personalized+biomolecular+corona+data+for+early+disease+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">Principal component analysis of personalized biomolecular corona data for early disease detection.</a> Nano Today. 21, 14-17 (2018).</li>
<li>Giulimondi, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reproducibility+of+biomolecular+corona+experiments%3A+A+primer+for+reliable+results%5BTitle%5D)+AND+%22Part+Part+Syst+Charact%22%5BJournal%5D)">Reproducibility of biomolecular corona experiments: A primer for reliable results.</a> Part Part Syst Charact. 40 (2), 2200169(2023).</li>
<li>Renzi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structuring+lipid+nanoparticles%2C+DNA%2C+and+protein+corona+into+stealth+bionanoarchitectures+for+in+vivo+gene+delivery%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Structuring lipid nanoparticles, DNA, and protein corona into stealth bionanoarchitectures for in vivo gene delivery.</a> Nat Commun. 15 (1), 9119(2024).</li>
<li>Van Dorpe, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrating+automated+liquid+handling+in+the+separation+workflow+of+extracellular+vesicles+enhances+specificity+and+reproducibility%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">Integrating automated liquid handling in the separation workflow of extracellular vesicles enhances specificity and reproducibility.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 157(2023).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+influence+of+protein+corona+on+graphene+oxide%3A+Implications+for+biomedical+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Nanobiotechnology%22%5BJournal%5D)">The influence of protein corona on graphene oxide: Implications for biomedical theranostics.</a> J Nanobiotechnology. 21 (1), 267(2023).</li>
<li>Jiříčková, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthesis+and+applications+of+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22Materials%22%5BJournal%5D)">Synthesis and applications of graphene oxide.</a> Materials. 15 (3), 920(2022).</li>
<li>Saorin, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+redefined+protocol+for+protein+corona+analysis+on+graphene+oxide%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nanosci+Au%22%5BJournal%5D)">A redefined protocol for protein corona analysis on graphene oxide.</a> ACS Nanosci Au. , (2025).</li>
<li>Digiacomo, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-protein+corona+enhances+accuracy+of+Ca-19.9-based+pancreatic+cancer+classification%5BTitle%5D)+AND+%22Nanoscale%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-protein corona enhances accuracy of Ca-19.9-based pancreatic cancer classification.</a> Nanoscale. 17 (12), 7066-7075 (2025).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improving+the+accuracy+of+pancreatic+cancer+clinical+staging+by+exploitation+of+nanoparticle-blood+interactions%3A+A+pilot+study%5BTitle%5D)+AND+%22Pancreatology%22%5BJournal%5D)">Improving the accuracy of pancreatic cancer clinical staging by exploitation of nanoparticle-blood interactions: A pilot study.</a> Pancreatology. 18 (6), 661-665 (2018).</li>
<li>Quagliarini, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+decade+of+the+liposome-protein+corona%3A+Lessons+learned+and+future+breakthroughs+in+theranostics%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Today%22%5BJournal%5D)">A decade of the liposome-protein corona: Lessons learned and future breakthroughs in theranostics.</a> Nano Today. 47, 101657(2022).</li>
<li>Wu, S. Y., An, S. S. A., Hulme, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+applications+of+graphene+oxide+in+nanomedicine%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">Current applications of graphene oxide in nanomedicine.</a> Int J Nanomedicine. 10 Suppl 1, 9-24 (2015).</li>
<li>Caputo, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplexed+detection+of+pancreatic+cancer+by+combining+a+nanoparticle-enabled+blood+test+and+plasma+levels+of+acute-phase+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Cancers%22%5BJournal%5D)">Multiplexed detection of pancreatic cancer by combining a nanoparticle-enabled blood test and plasma levels of acute-phase proteins.</a> Cancers. 14 (19), 4658(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>TUBO de unión de proteínas de 1,5 ml</td><td>eppendorf</td><td>22431081</td><td></td></tr><tr><td>10x Tris/Glicina/SDS</td><td>Biorad</td><td>1610732</td><td></td></tr><tr><td>Centrifugadora</td><td>Labortechnik</td><td>Z 216 MK Hermle</td><td>Usado a 18.620 RCF durante 20 minutos a 4 °C; C</td></tr><tr><td>Sistema de imagen ChemiDoc</td><td>Bio-Rad</td><td>12003153</td><td>Utilizado para la adquisición de imágenes en gel</td></tr><tr><td>Cloroformo</td><td>Sigma Aldrich</td><td>C2432-1L</td><td>Disolvente para DOTAP</td></tr><tr><td>Corning 1-200 y micro; Puntas de pipeta empaquetadas a granel L Universal Fit</td><td>Corning</td><td>4845</td><td></td></tr><tr><td>Geles prefabricados Criterion TGX Stain-Free</td><td>Biorad</td><td>5678095</td><td></td></tr><tr><td>Agua destilada 6 x 1L</td><td>Thermo Fisher</td><td>15230001</td><td></td></tr><tr><td>DOTAP (1,2-dioleoil-3-trimetilamonio-propano)</td><td>Lípidos polares Avanti</td><td>890890P-200mg</td><td>Se utiliza para preparar liposomas catiónicos; disuelto en cloroformo, evaporado, hidratado y extruido</td></tr><tr><td>Fuente de alimentación Enduro 300V&nbsp;</td><td>Labnet&nbsp;</td><td>E0303-230V</td><td></td></tr><tr><td>Lector de microplacas GloMax Discover</td><td>Promega</td><td>GM3000</td><td></td></tr><tr><td>Nanopartículas de oro (estabilizadas con citrato)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>742031-25ML</td><td>Utilizado como nanomaterial; Usado sin purificación adicional</td></tr><tr><td>Gel de poliacrilamida degradado (4&ndash; 20% TGX)</td><td>Bio-Rad</td><td>5678095</td><td>Usado para SDS y guiño; PÁGINA</td></tr><tr><td>Grant Instrument&nbsp; Termoshaker HC24N (24 microtubos de 1,5 mL)</td><td>Fisher Scientific</td><td>PHMT-PSC24N</td><td></td></tr><tr><td>Solución de óxido de grafeno (GO)</td><td>Grafenea</td><td>GO-4-1000</td><td>Utilizado como nanomaterial; diluido a 0,25 mg/mL y sonicado</td></tr><tr><td>Plasma humano (HP)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P9523-5ML</td><td>Utilizado para la incubación de nanopartículas</td></tr><tr><td>ImageLab Software</td><td>Bio-Rad. Versión 6.1.0.07</td><td>/</td><td>Usado para exportar imágenes en gel como archivos tiff</td></tr><tr><td>Búfer de carga de Laemmli 2x</td><td>Biorad</td><td>1610737</td><td>Utilizado para resuspender pellets</td></tr><tr><td>MATLAB</td><td>MathWorks. Versión R2022a</td><td>/</td><td>Utilizado para procesamiento de imágenes, análisis de datos y cálculo de perfiles</td></tr><tr><td>Mini-extrusor</td><td>Lípidos polares Avanti</td><td>610020</td><td>Utilizado para la preparación de liposomas</td></tr><tr><td>Agente reductor de muestras NuPAGE (10X)</td><td>Termo Científica</td><td>NP004</td><td></td></tr><tr><td>Amortiguador de solución salina de fosfato</td><td>Corning&nbsp;</td><td>21-031-cm</td><td>Utilizado para muestras DOTAP-HP</td></tr><tr><td>Kit de análisis de proteínas Pierce BCA, 1 kit (1 L)</td><td>ThermoFisher</td><td>23225</td><td></td></tr><tr><td>Puntas de pipet 0,5-10ul transparentes</td><td>Axygen</td><td>T-300-STK</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN L P10L, 0,5-10 & micro; L, Metal Ejector</td><td>Gilson</td><td>FA10002M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P20, 2-20 y micro; L, Metal Ejector</td><td>Gilson</td><td>F144056M</td><td></td></tr><tr><td>PIPETMAN P200, 20-200 y micro; L, Metal Ejector</td><td>Gilson</td><td>F144058M</td><td></td></tr><tr><td>Sistema automatizado de pipeteo PIPETMAX</td><td>Gilson</td><td>GSYS0021</td><td>Utilizado para el manejo automatizado de muestras</td></tr><tr><td>Filtro de policarbonato (0.1 & micro; m)</td><td>Lípidos polares Avanti</td><td>610005-1EA</td><td>Uso para extrusión de liposomas</td></tr><tr><td>Estándares de proteína Precision Plus Protein All Blue Prestained</td><td>Biorad</td><td>1610373</td><td></td></tr><tr><td>Estándares Precision Plus Protein Unstained & nbsp;</td><td>Biorad</td><td>1610363EDU</td><td></td></tr><tr><td>Sonicador de célula vibra VC505</td><td>Sonics and Materials Inc.</td><td>VC505</td><td></td></tr><tr><td>ZetaSizer</td><td>Malvern</td><td>ZS90</td><td>Utilizado para mediciones de dispersión dinámica de luz (DLS) y microelectroforesis (ME)</td></tr></tbody></table>

flujo de trabajo estandarizado sds-page para el perfilado personalizado de corona de proteínas en la detección temprana del cáncer

Standardized SDS-PAGE Workflow for Personalized Protein Corona Profiling in Early Cancer Detection

Flujo de trabajo estandarizado SDS-PAGE para el perfilado personalizado de corona de proteínas en la detección temprana del cáncer

The formation of a personalized protein corona (PC) on nanoparticles (NPs) upon exposure to biological fluids has emerged as a promising, minimally ...

standardized-sds-page-workflow-for-personalized-protein-corona

Research

Investigación

JoVE Journal

Cancer Research

Investigación del cáncer

Se describe un procedimiento para la desagregación de cáncer colorrectal (CCR) para producir células viables único, que son capturados en microarrays de anticuerpos a medida el reconocimiento de los antígenos de superficie (CRC DotScan microarrays). Subpoblaciones de células obligado a los microarrays pueden ser perfiladas por multiplexación de fluorescencia utilizando anticuerpos monoclonales marcados con colorantes fluorescentes.

Celular del cáncer colorrectal superficie de la proteína perfiles con un microarray de anticuerpos y la multiplexación de fluorescencia

RPPA permite la expresión de la proteína de cientos de muestras, impresos en portaobjetos de nitrocelulosa para ser interrogado simultáneamente, usando anticuerpos marcados con fluorescencia. Esta técnica se ha aplicado para estudiar el efecto de la heterogeneidad de tratamiento de drogas dentro de células claras carcinoma renal.

El uso de matrices inversas de proteínas de fase (RPPA) para explorar la variación de expresión de proteínas individuales dentro de cánceres de células renales

Los análisis en profundidad de los proteomas de las células cancerosas facilitan la identificación de nuevas dianas farmacológicas y biomarcadores de diagnóstico. Describimos un flujo de trabajo experimental para el análisis cuantitativo de (fosfo-)proteomas en subpoblaciones de células cancerosas derivadas de tumores líquidos y sólidos. Esto se logra combinando estrategias de enriquecimiento celular con espectrometría de masas cuantitativa basada en Super-SILAC.

Misa cuantitativa espectrometría de perfiles de los proteomas de células del cáncer derivados de líquidos y tumores sólidos

El objetivo de este video es demostrar cómo llevar a cabo la extracción de ADN automatizado de parafina embebido (FFPE) referencia las líneas celulares estándar fijado en formol y gotita digital de PCR (ddPCR) análisis para detectar mutaciones raras en un entorno clínico. La detección de mutaciones en muestras de FFPE demuestra la utilidad clínica de ddPCR en muestras FFPE.

El empleo de la gotita de PCR digital para detectar mutaciones BRAF V600E en embebidos en parafina líneas celulares de referencia estándar fijos-formalina

El uso de un enfoque basado en ARN para determinar los perfiles inmunitarios cuantitativos de los tejidos tumorales sólidos y aprovechar las cohortes clínicas para el descubrimiento de biomarcadores de oncitología se describe a través de protocolos moleculares e informáticos.

Modelado inmune predictivo de tumores sólidos

Aquí, describimos un protocolo para ajustar las regiones de interés (ROI) para las tecnologías de Spatial Omics para caracterizar mejor el microambiente tumoral e identificar poblaciones celulares específicas. Para los ensayos proteómicos, los protocolos personalizados automatizados pueden guiar la selección del ROI, mientras que los ensayos transcriptómicos se pueden ajustar utilizando ROI tan pequeños como 50 μm.

Perfil espacial de la expresión de proteínas y ARN en tejidos: un enfoque para ajustar la microdisección virtual

La desregulación proteómica juega un papel importante en la propagación de gliomas infiltrantes difusos, pero varias proteínas relevantes permanecen sin identificar. El procesamiento espacial digital (DSP) ofrece un enfoque eficiente y de alto rendimiento para caracterizar la expresión diferencial de proteínas candidatas que pueden contribuir a la invasión y migración de gliomas infiltrativos.

Perfil espacial digital para la caracterización del microambiente en glioma infiltrante difuso de tipo adulto

Aquí, establecemos un método proteómico basado en espectrometría de masas utilizando regiones aisladas de interés en secciones de tejido fijadas en formol e incluidas en parafina. Este protocolo se utiliza para analizar el proteoma de áreas específicas de tejido en secciones de tejido archivadas fijadas en formol e incluidas en parafina.

Un enfoque simplificado para la proteómica basada en espectrometría de masas utilizando regiones de tejido seleccionadas

Aquí, presentamos un protocolo para permitir la captura e identificación de interacciones proteína-proteína específicas de la enfermedad de células y tejidos nativos utilizando sondas químicas y espectrometría de masas. Los conjuntos de datos de interacción resultantes se analizan a través de una plataforma web dedicada para revelar disfunciones dinámicas de la red y alteraciones de la vía relacionadas con la enfermedad.

Mapeo de interacciones proteína-proteína disfuncionales en la enfermedad

Este protocolo fue diseñado para entrenar un algoritmo de aprendizaje automático para utilizar una combinación de parámetros de imagen derivados de la resonancia magnética (RM) y la tomografía por emisión de positrones/tomografía computarizada (PET/CT) en un modelo de rata de metástasis óseas de cáncer de mama para detectar enfermedades metastásicas tempranas y predecir la progresión posterior a macrometastasas.

Algoritmos de aprendizaje automático para la detección temprana de metástasis óseas en un modelo experimental de rata

Aprende a estandarizar SDS-PAGE para perfilar coronas de proteínas en nanopartículas y detectar cáncer de páncreas precoz. Este método reproducible ofrece una alternativa económica y aplicable en entornos clínicos.

Flujo de trabajo estandarizado SDS-PAGE para el perfilado personalizado de corona de proteínas en la detección temprana del cáncer (Video) | JoVE Journal

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