Pour calculer la diversité de Shannon-Weiner pour chacun des sites observés, ouvrez d’abord une nouvelle feuille de calcul Excel.
Étiquetez la cellule A1 'nom de l’espèce', et la cellule B1 'nombre total'.
À partir de la deuxième ligne et dans la colonne A, remplissez la fiche pour chaque espèce trouvée dans le premier site, en utilisant les données enregistrées dans le tableau 1.
Calculez le nombre total de chaque espèce trouvée dans l’ensemble de l’effort d’échantillonnage et notez-le dans la colonne B de la feuille de calcul Excel.
Maintenant, étiquetez la cellule G1 'comptage total de toutes les espèces', et dans la cellule H1, écrivez une formule, ou mettez en surbrillance les cellules appropriées pour additionner toutes les valeurs de comptage saisies dans la colonne B : = SUM(B2 : BX)
Étiquetez la cellule C1 'proportion de chaque espèce' et dans la cellule C2, tapez la formule pour la proportion du total de chaque espèce sur le site. = B2/H$1
Faites glisser cette formule vers le bas pour chaque ligne de données représentée dans la colonne B.
Étiquetez la cellule D1 'proportion logarithmique naturelle des espèces' et dans la cellule D2, tapez la formule pour le logarithme naturel de la proportion d’espèces sur le site. =LN(C2)
Faites glisser cette formule vers le bas pour chaque ligne de données représentée dans la colonne C.
Ajouter la formule dans la cellule E1 pour la proportion d’espèces multipliée par le logarithme naturel de la proportion d’espèces : ps* ln ps
Dans la cellule E2, tapez la formule multipliant la proportion d’espèces par le logarithme népérien de la proportion d’espèces sur chaque site, puis faites glisser cette formule vers le bas pour chaque ligne de données représentée dans la colonne D. = C2 * D2
Étiquetez la cellule G2 comme 'somme de ps * ln ps', puis, dans la cellule H2, tapez une formule additionnant toutes les valeurs de la colonne E. = SOMME(E3 - EX)
Étiquetez la cellule G3 'Indice de Shannon-Weiner', et dans la cellule H3, entrez la formule de l’indice de diversité de Shannon-Weiner. = (EXP - 1 * H2) REMARQUE : Il s’agit de l’indice de diversité de Shannon-Weiner calculé pour le premier site échantillonné, et il sera utilisé pour la comparaison entre les deux sites.
Répétez l’analyse des données dans une nouvelle feuille en utilisant les données collectées pour le deuxième site, qui ont été enregistrées dans le tableau 2. REMARQUE : Les zones où les valeurs de l’indice sont plus élevées sont considérées comme ayant une plus grande diversité d’espèces. Notez si vous voyez des différences entre vos sites.
Répétez les calculs de la diversité de Shannon-Weiner en utilisant un dénombrement total de toutes les espèces à chaque distance le long du transect, puis créez un tableau de toutes ces valeurs dans une nouvelle feuille Excel.
Cliquez sur l’onglet Données dans Excel, puis sur le bouton 'Analyse des données'.
Sélectionnez 'Régression' et cliquez sur 'OK'.
Pour la plage Y d’entrée, mettez en surbrillance les valeurs de diversité de Shannon-Weiner, et pour la plage X d’entrée, mettez en surbrillance les valeurs de distance.
Sélectionnez un emplacement de sortie pour les résultats de la régression et cliquez sur 'OK'.
Cochez la case Valeur P dans la ligne d’interception pour voir s’il existe une corrélation significative entre la distance entre le bord et l’habitat principal et la biodiversité. REMARQUE : Une valeur inférieure à 0,05 rejette l’hypothèse nulle d’absence de changement de diversité le long du transect, tandis qu’une valeur supérieure à 0,05 ne rejette pas l’hypothèse nulle.
Ensuite, pour effectuer des tests t afin de déterminer les différences de composition du sol entre les sites, ouvrez une nouvelle feuille de calcul Excel.
Dans la cellule A1, tapez 'Site 1 :pH', et dans la cellule B1, tapez 'Site 2 :pH'.
Remplissez les cellules A2 à A6 et les cellules B2 à B6 avec le pH du sol collecté dans les sites perturbés et non perturbés, respectivement.
Cliquez sur l’onglet Données dans Excel, puis sélectionnez « Analyse des données ».
Maintenant, faites défiler vers le bas et sélectionnez 't-Test : Two-Sample Assumption Equal Variances' et sélectionnez 'Okay'.
Cliquez sur le menu déroulant à côté de Plage de la variable 1 et mettez en surbrillance les cellules A2 à A6 dans la feuille de calcul, puis cliquez sur la liste déroulante à côté de Plage de la variable 2 et mettez en surbrillance les cellules B2 à B6 dans la feuille de calcul.
Dans la case de la différence moyenne hypothétique, tapez zéro comme hypothèse nulle. Cela signifie qu’il n’y a pas de différence entre les deux régimes de perturbation.
Laissez la case Étiquettes décochée et réglez la valeur alpha sur 0,05.
Sélectionnez 'Plage de sortie' et, dans la case, cliquez sur un espace vide dans la feuille de calcul.
Cliquez sur 'OK'. Un tableau des résultats du t-Test doit être publié dans la feuille de calcul.
Les données pertinentes sont les moyennes pour chacun des sites et la valeur alpha. Si cette deuxième valeur est inférieure à notre valeur alpha de 0,05, nous pouvons rejeter l’hypothèse nulle selon laquelle il n’y a pas de différence de pH entre les deux sites, et l’hypothèse selon laquelle les sites perturbés et non perturbés diffèrent dans leur valeur de pH gagnerait en soutien. Cependant, si cette valeur est supérieure à 0,05, nous ne pouvons pas rejeter notre hypothèse nulle.
Répétez cette analyse pour chacune des trois autres variables du sol, en créant une nouvelle feuille de calcul pour chacun des éléments phosphore, potassium et azote.
Notez si vos résultats de pH et de niveau de nutriments étaient différents dans chaque condition, et discutez avec votre groupe de la manière dont cela pourrait affecter la communauté et la diversité dans les différents sites.