Le système explant rat lentille a été utilisé avec succès par un certain nombre de laboratoires pour étudier la différenciation terminale des cellules épithéliales du cristallin aux fibres optique 21,3,4,5. Lorsqu'ils sont exposés à FGF-2 au 100ng/ml les explants va commencer à montrer les changements dans la signalisation dans les minutes 6, avec des changements dans la morphologie et l'expression des gènes apparaissant séquentiellement sur plusieurs jours 3,4,5. Les cultures restent viables pendant 2-3 semaines, si on prend soin d'éviter toute contamination.
Les explants centrale décrite dans ce protocole sont particulièrement utiles pour l'étude de la séquence des événements associés à la différenciation, car ils contiennent peu ou pas de cellules qui expriment des marqueurs de différenciation, avant le FGF-2 est ajouté 1,5. Les cellules se différencient ensuite synchrone, comme une cohorte, ce qui permet de suivre l'évolution temporelle de la signalisation et les événements transcriptionnels associés à la différenciation. Explants de culture différentes longueurs de temps fournit donc des informations précises sur les événements temporels séquence. Des inhibiteurs spécifiques peuvent être ajoutés au milieu de culture afin d'identifier les voies de signalisation pertinente. Explants peuvent être utilisés pour analyser l'expression des protéines par électrophorèse sur gel SDS et immunoempreinte ou pour analyser l'expression des ARNm spécifiques par RT-PCR. Protéines rendements large de 20 à 50 mg / explant et le rendement en ARN est d'environ 200 à 600 ng / explant, selon la longueur de la période de culture. En général, nous constatons que 5-6 explants par boite fournira suffisamment de protéines ou d'ARN pour des essais de plusieurs années. ARN à partir d'explants peut également être utilisé pour préparer l'ADNc pour évaluer l'expression des gènes par l'analyse des microréseaux, qui permet d'identifier de nouveaux gènes qui peuvent être cruciaux pour la différenciation. Explants peuvent également être transfectées. Bien que l'efficacité de la transfection est généralement faible, il est suffisant pour le dosage de gènes rapporteurs 4, 7, 8. Immunofluorescence des explants fournit un complément utile à des méthodes biochimiques, en déterminant la localisation subcellulaire des protéines d'intérêt. Ainsi, la préparation et à la culture d'explants lentilles rat fournit un système puissant pour l'étude de différenciation terminale optique chez les mammifères, ce qui peut compléter des techniques in vivo, comme la génération de souris transgéniques et knock-out.