Il ya plusieurs variables qui affectent les résultats observés tels que l'intensité du laser se concentrer, capacités de l'équipement, l'objectif utilisé, etc photostabilité du fluorophore détermine la vitesse de la fluorescence doit être capturé avant de s'estomper.
Cette méthode de marquage des protéines est polyvalent et convient pour de nombreuses applications. Technologies de SNAP-tag et CLIP-tag pour le marquage spécifique de protéines de fusion avec des sondes synthétiques permettent divers aspects de la fonction des protéines, y compris une variété de processus dynamiques dans les cellules vivantes et dans les lysats cellulaires. SNAP-CLIP-MCP-et ACP-tag technologies offrent une polyvalence extraordinaire simplicité et à l'imagerie de protéines dans les cellules vivantes et fixes, et à l'étude des protéines in vitro. La création d'un seul gène de construire donne une protéine de fusion taggés capable de former une liaison covalente à une variété de groupes fonctionnels, y compris les fluorophores, biotine, ou des perles. La protéine d'intérêt doit être cloné et exprimé qu'une seule fois et ensuite la fusion peut être utilisé avec une variété de substrats fluorescents pour de nombreuses applications en aval tels que l'étiquetage de protéines simultanément à l'intérieur des cellules vivantes, la localisation des protéines et translocation, pulse-chase expériences, des études de l'internalisation du récepteur , sélectives étiquetage surface de la cellule, les protéines déroulant tests, la détection de protéines en SDS-PAGE, la cytométrie en flux à haut débit dans les dosages de liaison des plaques de microtitration, des expériences d'interaction biocapteur, et FRET basé dosages de liaison.