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1. Mesure de l’adhésion à l’aide de décomptes cellulaires viables
- Déterminer le nombre de bactéries viables liées aux plantes cultivées dans le sable
- Retirez la plante du contenant et poncez. Pour retirer les plantes des contenants, retirez d’abord le matériau d’étanchéité sur le dessus et le dessous du contenant. Placez le récipient sur une feuille de papier stérile et retirez doucement tout le sable ou la terre et plantez en un grand cylindre effilé en frappant doucement le contenant contre une surface pour desserrer le matériau.
1. Si nécessaire, utilisez une spatule ou une tige pour desserrer le matériau autour des bords qui pénètrent par le fond du récipient.
- Lorsque le cylindre de sable ou de terre contenant la plante est libre sur le papier, fendez-le en deux pour révéler la racine de la plante. Si désiré, prélevez des échantillons de sable près du bord du contenant ainsi que près de la racine. Cela peut être utile pour déterminer la propagation (ainsi que l’accumulation et la croissance) de la bactérie.
- Mesurez la longueur de la racine. Ramassez la racine et enlevez le sable et les bactéries qui adhèrent mollement à la racine (le matériau rhizosphère) en trempant la racine dans un volume mesuré d’eau ou de tampon et en la secouant doucement. Déterminez le nombre de cellules viables des bactéries dans la suspension résultante en plaquant sur un milieu approprié tel que Luria agar. Cela représente le nombre de bactéries faiblement associées à la racine.
- Éliminez les bactéries étroitement liées par sonication et déterminez leur nombre.