En outre, l'analyse de réseau membrane TATS un certain nombre de techniques de biologie cellulaires couramment utilisés comme Ca2 + intracellulaire imagerie, patch-clamp électrophysiologie, ou études dose-réponse pharmacologiques dépendent essentiellement sur l'isolement de cellules primaires de haute qualité des oreillettes ou les ventricules ou sélectionnez parties de tissu cardiaque afin de permettre la caractérisation des myocytes cardiaques différenciées intactes, structurellement et physiologiques matures. Par conséquent, l'évaluation de l'isolement et de la qualité des cellules AM et VM décrites à l'article 1 sont finalement utile pour de nombreuses questions, y compris l'analyse de réseau TATS décrite ici, qui dépend essentiellement de membrane intacte et l'intégrité de la cellule.
La figure 1 présente un manuel étape par étape d'images comment procéder à la dissection du tissu cardiaque à commencer par les chambres auriculaires dans le cœur de la souris. Par la suite, les cavités ventriculaires et la cloison sont préparés uneD disséqué au besoin. Sélection et la préparation des pièces de tissus correctes précis est important d'établir de manière fiable AM et VM isolements de pureté des cellules suffisant. Après digestion à la collagénase, il peut être relativement difficile d'identifier la bonne ligne de dissection entre auriculaire et tissu ventriculaire, encore une fois les cellules AM et VM sont mélangés incontrôlée en suspension de cellules, il est impossible de renverser la population de cellules mixtes. Par conséquent, l'orientation anatomique, la visualisation d'un tissu 3D, une expérience suffisante avec la manipulation de tissu digéré, l'identification correcte des parties de tissus spécifiques et de leurs lignes de dissection tout va contribuer au succès de l'isolement des cellules.

Figure 1.Dissection de tissu auriculaire. (A) Face à la partie antérieure du cœur, deux s chirurgicalesutures fixer l'aorte proximale à l'extrémité de la souche d'une canule 21 G en acier. (B) Vue vers les spectacles de base de coeur tissu pulmonaire obstruer la vue de la chambre auriculaire lors de la dissection restants. LA, oreillette gauche; RA, l'oreillette droite. (C) lungtissue restant et des gros vaisseaux ont été retirés pour accéder aux chambres auriculaires. Rempli triangle noir, artère pulmonaire; triangle strié, veines pulmonaires; rempli triangle blanc, la veine cave supérieure; triangle coffret, veine cave inférieure. (D) Tout d'abord, la paroi de l'oreillette droite est disséqué, tandis que les pinces tiennent l'appendice auriculaire. (E) Voir dans la cavité de l'oreillette droite. Le triangle noir marque le septum interauriculaire intact. (F) La dissection est poursuivie à pénétrer dans la cavité de l'oreillette gauche de la chambre. (G) Après dissection complète des oreillettes gauche et droite, les valves auriculo-ventriculaires deviennent visibles. Dispositif de soupape fibreux est disséquée et écartée pour SUBSEQuently récolter que le tissu musculaire ventriculaire. vue (H) postérieure des oreillettes isolées gauche et droite. LA, oreillette gauche; RA, barres de droite atrium.Scale: 700 um.
Pour déterminer la qualité d'isolation de la cellule, la figure 2 présente des exemples typiques de cellules lors de l'évaluation du rendement et de la viabilité de la tige ou en forme de myocytes intacts striés brique typique, à la fois pour la MA et les machines virtuelles. Peu endommagé, visuellement discret ainsi que des cellules anormales gravement endommagés avec des morphologies trop courbées, ou des cellules en forme de sphériques anormales, peuvent être facilement identifiés, notamment l'exclusion du bleu trypan comme décrit à la section 1.11. Bien que les myocytes restent intactes lumineux et homogène strié lorsqu'elles sont exposées à trypan bleu extracellulaire, les cellules endommagées présentent généralement plusieurs vésicules membranaires et / ou s'accumulent rapidement bleu trypan dommage indiquant de manière intracellulaire de la membrane. Toutefois, bleu trypan par lui-même peut endommager les cellules par le biais de unnecessariment longue période d'incubation et une évaluation immédiate de la qualité de la cellule est donc obligatoire. Des exemples de formes les plus évidentes de dommages cellulaires comme la contracture myofilament ou à l'intégrité de la cellule brut de dommages de surface compromettre sont présentés dans les figures 4C et 4D. S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

Figure 2 Trypan de coloration des cellules d'exclusion au bleu. Isolé (A) AM et cellules (B) VM sont mélangés en suspension avec du bleu trypan et visualisés par un microscope optique inversé montré à 40Xmagnification. Remarque thatabnormal cellules sphériques (A) et (B) en prenant en bleu trypan, qui indicatesmembrane leakage et des dommages structurels. En revanche, les cellules centralAM et VM avec membranes intactes excluent bleu trypan comme indiqué. En outre, notez que AM intact et cellules VM montrent des stries de sarcomériques au long de leur volume cellulaire, bulles de nomembrane et angles vifs, les deux côtés latéraux et les deux disques intercalés. Les barres d'échelle: 20 um.
Après le succès de rendements isolement, cellules de machines virtuelles à partir de 5 x 5 octobre au 6 octobre on peut s'attendre d'un seul digestion de cœur de souris. Le rendement en AMS est significativement plus faible dans l'ordre des cellules à l'exclusion des 3 x 10 3 à 3 x 10 4 en forme de tige, le bleu trypan. Contrairement à VM, AM isolements de temps en temps ne même entre des mains expérimentées. Étape 1.11 résume les procédures façon d'estimer le rendement des cellules saines isolés en suspension. En outre, de déterminer les dimensions de la cellule moyenne par étape 1.13 comme indiqué sur la Figure 3 AM individu ou isolats de cellules VM ou de comparer AM par rapport à des populations de cellules VM côté-à-côte (au besoin). S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

Figure 3.Bright analyse morphométrique domaine des myocytes cardiaques. L'contour VM a été détecté par les outils d'analyse d'images décrites à l'étape 1.13. Utilisez l'outil de sélection de polygone pour marquer visuellement et définir la frontière extracellulaire des cellules défini par la membrane de surface extérieure pour l'analyse. Annonce de la région sélectionnée d'intérêt (ROI) pour le gestionnaire de ROI suivie par des mesures de distance 1D. Pour les études comparatives de AM vs dimensions VM, il est utile de documenter la longueur de la cellule, la largeur et la région, et de calculer la longueur: largeur.
nt "> Pour fluorescence membranes tache de TATS soit dans les cellules AM ou VM, le colorant membranaire intégrale di-8-ANEPPS est utilisé comme décrit dans la section
2, suivi par microscopie confocale, qui a donné lieu à des images représentatives de réseaux de TATS représentées dans
les figures 4A et
4B. De plus,
la figure 4A montre l'image lumineuse correspondant transmis d'une AM intacte côte-à-côte avec l'image de TATS confocale (pour l'acquisition d'image voir section
3). Comme décrit par étape
1.12, l'intégrité de la membrane morphologique et la surface de la vie myocytes est jugé par l'intermédiaire des images de lumière transmise. La région amplifiée du signal di-8-ANEPPS met en évidence la morphologie sous-jacente du réseau TATS en MA, caractérisé par axiales abondante (longitudinaux) de tubes à membrane. En revanche, la morphologie TATS de santé des machines virtuelles comme le montre
la figure 4B est caractérisé par un nombre à peu près équivalente d'un axialed composantes transversales. En revanche,
les figures 4C et
4D montrent des exemples de myocytes cardiaques endommagés qui doivent être exclus de l'analyse. En particulier, la cellule AM sur
la figure 4C est contracté en évidence par une longueur de sarcomère anormalement court de 1,2 um et un réseau irrégulier, déformé TATS tandis que la cellule VM sur
la figure 4D présente de multiples vésicules membranaires (environ marquée par des triangles rouges) indiquant les perturbations de la membrane , qui peut se produire à la membrane de surface extérieure, mais aussi au niveau des membranes de TATS.
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Figure 4.Live coloration de membrane auriculaire et ventriculaire intact myocytes. correspondants s'allument et images confocales de vie transmis di-8-ANEPPS teinté intact (A) et AM (cellules B) VM. En revanche, une heure et partiellement contracté potentiellement endommagé ayant une longueur de sarcomère de 1,2 um est représentée en (C). Myocytes contractés généralement montrent anormalement raccourcis et les structures de TATS déformées, donc exclus de l'analyse. Un autre indicateur important pour les défauts de la membrane cellulaire sont des vésicules membranaires (triangles rouges), comme indiqué dans une machine virtuelle dans (D). Bulles membranaires représentent des structures de la membrane de surface endommagés et les cellules avec des bulles doivent être exclus de l'analyse de TATS. En outre, la machine virtuelle présente des dommages brut absence apparente toute une partie de sa partie inférieure gauche (marqué d'un astérisque). En résumé, en comparant la lumière transmise et images confocales, les cellules morphologie et intégrité de surface est documenté et combinées avec des informations de signal fluorescent. Marques 'N' nuCLEI omis de l'analyse de la tache TATS membrane. Les barres jaunes indiquent amplifiées ROI de la même image confocale présenté ci-dessus. Les barres d'échelle:. 10 pm S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Images confocales de membranes TATS avec un rapport suffisant signal-sur-bruit, comme illustré sur les figures 4A et 4B sont acceptées pour une analyse quantitative. L'analyse de la membrane TATS est basée sur des données dérivées de squelettisées des composantes de signal fluorescent rectilignes. Figure 5 montre le diagramme de flux de travail de chacune des étapes de traitement d'image qui sont décrits en détail par les étapes 4.3 à 4.5. Ces étapes produisent des images squelettisées représentant TATS rectilignes réseaux membrane comme indiqué pour chaque VM isolée (figure 5A) et AM cellules (Figure 5B).

Figure 5.Workflow pour squelettisation d'images de TATS fluorescentes. Étapes de traitement d'image qui conduisent à une image squelette du réseau TATS sont représentés par différents exemples étape par étape l'image à la fois pour une di-8-ANEPPS colorées VM (A) et AM (B). Pour l'étape individuelle de traitement d'image, s'il vous plaît se référer au chapitre 4. Noter les différences dans les barres d'échelle:. 20 pm (A) et 10 microns (B) S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Une étape essentielle lors du traitement d'image, de déterminer le seuil approprié pour la binarisation des données comme décrit dans la section 4.5.6. L'image binaire résultant ne doit inclure que les vrais signaux de la membrane du réseau TATS mais pas de fausses structures dérivées par seuillage erronée du bruit du signal de fond. Pourtant, il est important que le seuil est assez bas pour détecter tous les vrais structures de TATS tels que les véritables composants de TATS ne sont pas à tort perdu lors de l'analyse d'image. Figure 6 illustre la marche à suivre pour sélectionner le seuil pendant binarisation des données. Bien que d'un seuil de 40, comme le montrent les figures 6B et 6C semble approprié pour détecter tous les vrais structures de TATS individuellement, le choix d'un seuil plus élevé, par exemple, de 60, comme le montre la figure 6A ne détecte pas les structures de la membrane plus faible axiales (ATS) comme indiqué par des triangles jaunes . En revanche, le choix d'un seuil inférieur, par exemple, de 20, comme le montre la figure 6D conduit à une détection erronée de bruit de fond en tant que structures de TATS faux-positifs, comme indiqué partriangles jaunes.

Figure 6.How pour déterminer le seuil de signal au cours de squelettisation TATS données d'image. Ces exemples montrent squelettes TATS chaque générées pour différents seuils de binarisation en données décrites dans l'étape (4.5). Images supérieures montrent: les ajustements de seuil en utilisant Fidji. Les images à basse: superposition d'images décharnées avec l'image de fluorescence d'entrée correspondant et les régions agrandies comme indiqué. Un seuil par exemple élevé, 60 appliquée dans (A) n'est apparemment pas approprié pour détecter tous les vrais structures de TATS comme indiqué par des triangles jaunes dans la section agrandie. Un seuil de 40 appliqué dans (B) et (C) détecte les structures TATS correctement et ne détecte pas le bruit de fond, alors que par exemple un seuil bas., 20 (D) identifie à tort le bruit de fond que les structures de TATS et produit des signaux faux positifs de structures membranaires non-existants ainsi. Signaux faux positifs sont indiqués par des triangles jaunes dans l'encart agrandie. S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Le "Analyser Skeleton (2D / 3D)" plug-in prend en charge l'analyse détaillée des structures de TATS décharnées. Une fois exécuté, le plugin de produire un tableau de données avec les paramètres suivants du squelette: #branches, #junctions, # point final voxels, la durée moyenne de la branche, les points #triple, les points #quadruple, et la longueur maximale de la branche. Pour une description détaillée de tous les paramètres de sortie s'il vous plaît se référer à http: //fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton et articles connexes 29-31. Une sortie typique de la table de données est représenté sur la figure 7A.
La longueur totale du squelette par un retour sur investissement:
Σ (#branches x longueur de la branche moyenne) = 5155 px = 515,5 pm
La longueur totale du squelette peuvent être normalisées par rapport à la zone d'image. Pour l'exemple représenté sur la figure 7, la longueur normalisée de squelette de 0.64μm / um 2 et la somme de toutes les jonctions sont calculés comme indiqué ci-dessous:
Longueur normalisée de squelette:
515,5 um / 803,6 um 2 = 0,64 um / um 2
Nombre normalisé de jonctions:
155 jonctions 803,6 um / 2 2 pm

Figure sortie de données 7.Automated à partir d'images décharnées. (A) Un tableur type de données généré par le «Analyser Skeleton (2D / 3D) 'plug-in de l'image squelette montré dans (B). Pour une description détaillée des paramètres de sortie possibles s'il vous plaît se référer à http://fiji.sc/wiki/index.php/AnalyzeSkeleton . S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Les étapes de traitement d'image décrits à la rubrique 4.5 et illustrés à la figure 5 peuvent être automatisées à l'aide d'une macro Fidji fourni comme code supplémentaire Fichier 4.3 et 4.4. La macro peut être avantageux pour l'analyse des groupes d'ensembles de données complets, par exemple en préparant individuels des piles d'images d'entrée pour chaque groupe de traitement indépendant pour analyse automatisée en utilisant les macro-commandes.
La stratégie du logiciel décrit permet en outre à l'analyse de l'orientation du réseau TATS pour tous les composants. Pour cela, utilisez la "directionnalité" plugin (http://fiji.sc/Directionality) 29,31 qui produit des données de l'histogramme montre la distribution de l'orientation de tous les TATS des orientations composants. Si l'axe des x de l'image d'entrée correspond à l'axe principal d'une cellule AM ou VM donné, la axial (longitudinaux) des composants de TATS sera représentée par le bac de 0 °, que les éléments transversaux sont représentés par la 90 &# 176; bin. Figure 8 montre la directivité exemplaire des histogrammes à partir d'images TATS squelettisées pour une VM (8A) par rapport à un AM (8B) cellule. Bien que l'histogramme de la directivité d'une machine virtuelle typique présente une distribution double crête à 0 ° et 90 °, l'histogramme h montre un seul pic dominant à 0 °. Ces exemples sont en accord avec les observations antérieures que les composants individuels de TATS machines virtuelles sont presque également répartis entre les tubules T et A-tubules, alors que les composants de TATS AMS peuvent être principalement composé d'un tubules.

Figure 8.Representative directionnalité histogramme de TATS réseaux de cellules individuelles. Histogrammes de directivité ont été générées à partir d'images de VM squelettisées individuel (A) par rapport à AM (B S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
| tampon de perfusion | mM |
| NaCl | 120,4 |
| KCl | 14,7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO 3 | 4.6 |
| Taurine | 30 |
| 2,3-butanedione monoxime | 10 |
| Glucose | 5.5 |
| pH 7,4 |
| un tampon de digestion | mM (si non spécifié) |
| NaCl | 120,4 |
| KCl | 14,7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO 3 | 4.6 |
| Taurine | 30 |
| 2,3-butanedione monoxime | 10 |
| Glucose | 5.5 |
| collagénase de type II | 600 U / ml |
| pH 7,4 |
| Tampon d'arrêt | mM (si non spécifié) |
| NaCl | 120,4 |
| KCl | 14,7 |
| KH 2 PO 4 | 0,6 |
| Na 2 HPO 4 | 0,6 |
| MgSO4 | 1.2 |
| HEPES | 10 |
| NaHCO 3 | 4.6 |
| Taurine | 30 |
| 2,3-butanedione monoxime | 10 |
| Glucose | 5.5 |
| CaCl2 | 0,0125 |
| de sérum de veau bovin | 10% |
| pH 7,4 |
Tableau 1.Buffer solutions. Le contenu de trois solutions tampons physiologiques différentes pour l'isolement cellulaire et l'imagerie sont résumées.