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Research Article
Devsmita Das1,2, Cristy Phillips3, Bill Lin1, Fatemeh Mojabi1, Mehmet Akif Baktir2, Van Dang1,2, Ravikumar Ponnusamy1, Ahmad Salehi1,2
1VA Palo Alto Health Care System, 2Department of Psychiatry and Behavioral Sciences,Stanford University School of Medicine, 3Department of Physical Therapy,Arkansas State University
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Nous décrivons deux méthodes de visualisation et de quantification de l’arborisation dendritique dans l’hippocampe de modèles murins : l’imagerie en temps réel et l’imagerie en profondeur de champ étendue. Alors que la première méthode permet un traçage topographique sophistiqué et une quantification de l’étendue de la ramification, la seconde permet une visualisation rapide de l’arbre dendritique.
L’arborisation dendritique s’est avérée être un marqueur fiable pour l’examen de l’intégrité structurelle et fonctionnelle des neurones. En effet, la complexité et l’étendue de l’arborisation dendritique sont bien corrélées avec la plasticité synaptique dans ces cellules. Une méthode fiable d’évaluation de l’arborisation dendritique est nécessaire pour caractériser les effets délétères des troubles neurologiques sur ces structures et pour déterminer les effets des interventions thérapeutiques. Cependant, la quantification de ces structures s’est avérée être une tâche formidable compte tenu de leur nature complexe et dynamique. Heureusement, des techniques d’imagerie sophistiquées peuvent être associées à des méthodes de coloration conventionnelles pour évaluer l’état de l’arborisation dendritique, ce qui fournit un moyen d’évaluation plus fiable et plus rapide. Vous trouverez ci-dessous un exemple de la façon dont ces techniques d’imagerie ont été associées à des méthodes de coloration pour caractériser l’arborisation dendritique chez les souris de type sauvage. Ces méthodes d’imagerie complémentaires peuvent être utilisées pour évaluer qualitativement et quantitativement l’arborisation dendritique qui s’étend sur une zone assez large dans la région de l’hippocampe.
Modifications dynamiques dans le nombre et la structure des synapses sont les caractéristiques de développement, le vieillissement, et de nombreux troubles neurodégénératifs 1-3. La capacité des neurones à recevoir et à intégrer l'information synaptique dépend de la morphologie dendritique et modifications dynamiques dans les connexions synaptiques. En effet, une corrélation positive existe entre épines dendritiques et le nombre de synapses, qui à la fois un impact fonction cognitive 4. Ainsi, il ne est pas surprenant que les dégradations de nombre d 'épines dendritiques ont été associés à un dysfonctionnement cognitif dans un certain nombre de troubles neurologiques 5-7, incitant un grand intérêt pour la quantification des épines dendritiques. Cependant, la quantification de la densité de la colonne vertébrale reste un temps long et fastidieux qui ne parvient pas à générer des informations utiles concernant la topographie et la distribution des synapses à travers l'arbre dendritique. Heureusement, les méthodes de coloration (par exemple, l'appareil de Golgi-Cox et doublecortine (DCX)) en conjonctionavec des techniques d'imagerie sophistiquées peuvent être utilisées pour surmonter les obstacles actuels et produire des images haute résolution de l'arborisation dendritique d'une manière fiable et rapide. Alors que méthode de coloration de Golgi-Cox peut être déployée pour évaluer l'état de l'arborisation dendritique dans tous les neurones 8, DCX peut être déployé pour étiqueter neurones nouveau-nés en particulier dans le gyrus denté et la zone sous-ventriculaire 9, une considération importante étant donné que la neurogenèse se produit à la fois ces régions tout au long de la durée de vie 10,11.
Après la coloration, deux méthodes d'imagerie ont été déployés pour évaluer les caractéristiques dendritiques: i) l'imagerie en temps réel (RTI) et ii) la profondeur de l'imagerie de champ (EDFI) étendu. La technique RTI fournit un moyen de retracer et de quantifier la longueur et l'ordre des arborisation le long des segments et des branches dendritiques individuelles. Ainsi il permet une estimation de la surface totale et le volume occupé par chaque arbre dendritique. Plus de specifically, dans le procédé RTI l'utilisateur identifie de façon continue les segments et recentre itérative comme le neurone traçage logiciel recueille les x, y et z des coordonnées de la structure dendritique et reconstitue la trajectoire de la structure dendritique en 3D. En comparaison, la méthode EDFI fournit un moyen assez simples et rapides pour évaluer la densité dendritique dans des échantillons de tissus assez épaisses en générant une image composite, fournissant des informations sur l'ensemble de l'axe z. Pour ce faire, l'utilisateur enregistre des fichiers vidéo à haute définition sur toute l'épaisseur de la section puis utilise un logiciel pour rechercher les images vidéo pour identifier les points dans lequel un pixel est entièrement mis au point. Par la suite, les pixels ciblées sont fusionnés et intégrés dans une haute résolution, image 2D composite. Cette image composite contient tous les pixels qui sont de mise au point quelle que soit leur position dans l'axe z. L'analyse qualitative et quantitative de ces images en 2D peut être utilisé par la suite pour déterminer la densitéramification dendritique de chaque zone.
Enfin, nous présentons une méthode pour générer panoramique images de très haute résolution pour l'analyse et l'évaluation des dendrites dans toute une région d'intérêt. Cette technique peut être déployé pour surmonter le manque d'accès à très haute résolution et les appareils photo numériques coûteux. En utilisant cette méthode, permet de capturer des images en série à différents endroits le long du x et y axes et ensuite automatiquement des points les ensemble en utilisant un logiciel (par exemple, Image Composite Editor). En particulier, ce procédé peut être utilisé pour l'évaluation qualitative et quantitative de l'arborisation dendritique dans un assez large domaine.
NOTE: Des expériences ont été menées en conformité avec les normes éthiques approuvés par le Comité de la recherche animale au système de soins de santé Anciens Combattants Palo Alto.
1. Golgi-Cox Coloration
2. Doublecortin coloration
3. Visualisation
4. EDFI
Remarque: cette méthode permet à l'utilisateur d'enregistrer rapidement un grand nombre d'images à travers l'axe des z de chaque champ et de générer une image 2D qui contient tous les pixels focalisés à travers l'axe z. Le résultat sera une image composite qui contient tous les pixels ciblées à partir d'images collectées.
5. Génération Résolution Images très haute
NOTE: Cette méthode permet à l'utilisateur de générer automatiquement un faible grossissement et images de très haute résolution à partir d'images à fort grossissement à haute résolution d'une manière automatisée.
L'étendue de l'arborisation résultant de cellules granulaires du dentate existants et nouveaux-nés a été analysée chez des souris de type sauvage en utilisant soit Golgi-Cox ou DCX coloration (figure 1). Segments de cellules dendritiques DCX-positifs ont été trouvés pour être de 13 à 36 microns de long. La distribution normale de longueur dendritique a été testé en utilisant le test de Kolmogorov-Smirnov (D = 0,1217, p <0,01, Liliefors p <0,001; les figures 4 et 5).
Dans l'analyse de la longueur de segments par ordre de arborisation, les segments les plus longs ont été trouvés dans le premier ordre de arborisation (38,38 + 1,45 um). Des tendances similaires ont été trouvés pour la surface (111,98 + 3,93 micron carré) et le volume (27,93 + 1,03 um cube). La corrélation linéaire entre la longueur des segments et de la surface et / ou de volume occupé par ces segments ont également été testés. Les deux surface (p = 0,001, R2 = 0,873) et le volume (p = 0,001, R2 = 0,621) correlated sensiblement avec la longueur de chaque segment dendritique.

Figure 1:. Voici schéma Fan a été utilisé pour évaluer la longueur dendritique de cellules granulaires denté de l'hippocampe Cet outil de visualisation peut être utilisé pour comparer les effets de différentes interventions thérapeutiques ou des génotypes sur la longueur dendritique. L'unité de mesure est um.

Figure 2: Visualisation de l'arborisation dendritique sans (A) et (B) EDFI méthodes. La méthode traditionnelle de trouver le meilleur plan de mise au point a été comparée à EDFI (données non présentées) et ont trouvé des valeurs significativement plus élevés de la zone dendritique selon la méthode EDFI (p = 0,02). La barre d'échelle= 100 um.

Figure 3:. Une image à haute résolution de la région de l'hippocampe dans une souris Cette image de très haute résolution est automatiquement construit à partir de la couture 10 (4076 x 3116) -pixel images. Échelle nue = 100 um.

Figure 4:. La quantification de la longueur et le volume occupé par les dendrites dans des ordres différents de ramification La longueur et le volume maximal a été atteint dans l'ordre 1.

Figure 5:. Histogramme de la longueur dendritique de cellules granulaires dentées La majorité des segments dendritiques de DDendrites CX-colorées étaient 13-26 en longueur. La ligne pointillée rouge représente la distribution normale des données présentées.
Publication frais pour cet article sont parrainés par MBF Bioscience.
Nous décrivons deux méthodes de visualisation et de quantification de l’arborisation dendritique dans l’hippocampe de modèles murins : l’imagerie en temps réel et l’imagerie en profondeur de champ étendue. Alors que la première méthode permet un traçage topographique sophistiqué et une quantification de l’étendue de la ramification, la seconde permet une visualisation rapide de l’arbre dendritique.
Cette recherche a été soutenue par des subventions de la Fondation LuMind, de Research Down Syndrome et de l’Alzheimer’s Association (AS). Le CP a été partiellement soutenu par une subvention de développement du corps professoral du College of Nursing and Health Professions de l’Université d’État de l’Arkansas.
| Solution de coloration Golgi-cox modifiée  ; | Magasin Weill Cornell Medical College | NA | à 4° ; C jusqu’à l’utilisation |
| 1x Solution de développement (Stock 10x) | Weill Cornell Medical College | NA | magasin à 4° ; C jusqu’à ce qu’il utilise |
| 30 % de saccharose,Sigma | CAS # 57-50-1 | faire frais   ; en ddH2O | |
| 0,3 % Gélatine | Sigma | CAS # 9000-70-8 | |
| NA Solutions d’éthanol classées (20 %, 30 %, 40 %, 50 %, 80 %, 90 %, 95 %. 100 %) | Sigma | CAS 603-003-00-5 | |
| NA Xylène | Sigma | CAS # 1330-20-7 | NA |
| DPX Medium | EMS  ; | #13510 | NA |
| Superfrost (+) blanc | Microscopie électronique Sciences | 71869-10 | NA |
| Coverslip 22x50mm (VWR #48393-059) | VWR  ; | #4811-703 | NA |
| DCX Anticorps | Santa Cruz Biotechnology | sc-8066 | 4 C |
| DAB | Sigma | Numéro CAS 91-95-2   ; | -20 |
| OCT | Tissue-tek | 4583 | NA |
| Tris | Sigma | Numéro CAS 77-86-1 | Na |
| Microscope ABC Lite | Vector | PK4000 | NA |
| Appareil | photo numériqueNikon | Eclipse 80i | |
| Appareil photo numérique | Nikon | DS-Ri1 | |
| 12 bits  ; | QImaging  ; | 01 MBF2000RF-CLR-12 | |
| Neurolucida System | MBF Bioscience | V.10 | |
| Image Composite Editor | Microsoft | 1.4.4.0 | |
| NIS Elements | Nikon | F 3.0 | |
| Image Pro Plus | Mediacy | Versin 7.00 |