$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Pendant le développement embryonnaire, le tissu et la morphogenèse d'organes ont lieu grâce à un programme précis qui peut être décrite en termes de prolifération cellulaire, la migration cellulaire et la spécification de la lignée 1-4. Ces processus biologiques sont également impliqués dans le maintien de l'homéostasie tissulaire adulte, qui nécessite endiguer la régénération cellulaire. Le traçage de Lineage, l'identification et le suivi de la descendance d'un type spécifique de la population de la cellule, fournit un outil important pour l'étude de l'embryogenèse et l'homéostasie des cellules souches. En effet, il est de plus en plus utilisé dans de nombreux domaines de la recherche. En particulier, la lignée traçage est devenu un outil essentiel dans identifier l'origine et le destin des cellules souches dans l'homéostasie et le développement du cancer. En effet, il peut fournir des informations sur la façon essentielle la cellule se comporte dans le cadre de l'organisme ou tissu intact, avec intervention minimale d'expérimentation, à la différence de l'isolement des cellules en culture et in vitro ou transplantatisur risquant d'entraîner polarisation indésirable.
Traditionnellement, les colorants tels que liposoluble carbocyanine, qui intègrent dans la membrane plasmique des cellules, ont été utilisées pour la lignée de traçage. Bien que ces types d'expériences ont conduit à des découvertes majeures avec succès et de concepts séminales façonnés dans la biologie du développement 5,6, ils présentent certaines limites, notamment la difficulté de contrôler la spécificité des cellules cibles, l'effet indésirable du colorant sur le comportement des cellules et la dilution de l'étiquette dans le temps. Nucléotidiques approches d'étiquetage analogique ont permis de documenter l'existence de slow-vélo "label conservant cellules" qui correspondent vraisemblablement à quiescent cellules souches 7,8. Toutefois, bien que cette technique pourrait démontrer la présence de cellules de cyclisme lente basé sur la cinétique de prolifération sur une période de temps limité, il ne pouvait pas fournir des indications importantes en ce qui concerne la fonctionnalité des cellules souches. Un optimale meth lignée de traçagedologie devrait minimiser l'effet de l'étiquetage sur les propriétés de la cellule marquée, ses descendants ou ses voisins. En outre, il serait bénéfique d'avoir le contrôle sur l'induction de l'étiquetage, à savoir, d'avoir la possibilité de marquer la population de cellules d'intérêt à un stade et d'une manière dépendant du temps ainsi que dans une seule cellule (clonale) manière. Procédé de marquage irréversible et stable qui est transmis à toute la descendance de la cellule fondateur est important de sorte que l'étiquette serait maintenue dans le temps, et pas transféré aux cellules voisines.
Plus récemment, des approches génétiques de marquage des cellules ont été développées. Dans ces systèmes, des promoteurs spécifiques de cellules peuvent être utilisés pour déclencher la recombinase Cre expression afin d'éliminer un barrage-loxP flanquée et permettre l'expression des gènes rapporteurs tels que la protéine fluorescente verte ou Β-galactosidase gènes rapporteurs 9-13. Cette approche permet non seulement le suivi des cellules et de leur progéniture, mais permet également de cellule estolation et caractérisation moléculaire. Suivi de cellule au niveau de la cellule unique est devenu possible grâce à l'induction de l'expression d'un seul gène rapporteur fluorescent. Une limitation importante de ce système est le fait que lorsque seulement une très faible pourcentage de cellules est marqué, il est possible de séparer et de tracer des clones individuels. Pour surmonter cette limitation reporters multicolores peuvent être utilisés. Lors de l'utilisation étiquetage multicolore, le suivi du sort différentielle des cellules voisines dans le même créneau peut être réalisé efficacement 14-17. Récemment, une variété de Brainbow (Br) allèles ont été développés pour les expériences de la lignée de traçage, ce qui permet une expression de multiples gènes stochastiques reporter fluorescentes en utilisant le / lox système Cre. Le système Cre / lox comprend la recombinase Cre enzyme, qui reconnaît et se lie à des séquences d'ADN spécifiques tels que des sites loxP. Après la liaison de la recombinase Cre, recombinaison site spécifique se produit, ce qui provoque l'élimination des séquences loxP flanquée resulting dans l'expression aléatoire des différentes protéines fluorescentes (le mécanisme est décrit ci-dessous). Une variété de lignes Br sont disponibles pour l'utilisation (voir les commentaires 16,18,19). Les principales différences entre les souches Br comprennent (i) des différences dans le nombre de gènes fluorescents inclus dans la cassette, allant de 2 (Br 2.0), 3 (Br1.0) à 4 (Br1.1, Br2.1) gènes fluorescents , (ii) la présence de sites lox réciproquement orientés pour permettre l'inversion de gène (Br2.0-2.1), (iii) le type de sites lox utilisées, et (iv) l'expression ou de silence de l'expression du gène fluorescent avant l'activation Cre. Le Br3 récemment établi propose un procédé amélioré de formation d'image multicolore des neurones. Une des principales caractéristiques de cette transcription est qu'il contient un nouvel ensemble de protéines photostables farnésylées fluorescentes, qui permettent à une coloration, même de la plus belle neuronal traite 20.
Surtout, les différentes versions de cassettes Br peuvent contenir spécifique neuronale Thy1 promoter ou exprimée de manière ubiquitaire CAG (CMV). Enfin, alors que certains des souris transgéniques Br peut contenir un seul transgène Br, d'autres peuvent consister en de multiples copies du transgène, ce qui permet la production d'un nombre immense de possibilités de combinaisons de couleurs pour être exprimé dans chaque cellule (voir par exemple 16).
Dans notre étude, nous avons utilisé la souris R26R-Confetti qui contient la cassette de 21 Br 2.1. Br2.1 est spécialement conçu pour permettre à des inversions de l'ADN Cre-médiation et non seulement des excisions en raison de l'orientation réciproque des sites loxP (Figure 1). Ainsi, ces événements inversion / excision qui conduisent à changement de couleur peuvent continuer aussi longtemps que Cre est présente 16. Pour cette raison, un système d'expression inductible Cre temporelle est essentielle pour le suivi cellulaire fiable à l'aide Br2.1. Comme le montre la Figure. 1, le Br2.1 contient un promoteur CAG omniprésente suivie par loxP flanquée Neo R -casseTTE, qui agit comme un barrage routier de la transcription, qui est suivie par 4 gènes rapporteurs fluorescents, l'encodage pour verte (GFP), jaune (YFP), rouge (RFP) et cyan (CFP) des protéines fluorescentes, positionnés dans deux tandems. Pas de fluorescence est exprimé avant l'activation Cre. L'induction de la recombinase Cre provoque le retrait de la cassette néo-R permettant l'expression statistique de l'une des protéines fluorescentes 4 dans une cellule donnée. Le premier segment contient GFP-loxP flanquée et une YFP inversée, tandis que le second segment contient DP-loxP flanquée et un PCP inversée. Ces segments d'ADN peuvent être inversés en continu (en utilisant loxP qui est en orientation inverse), ou excisés, aussi longtemps que la recombinase Cre est présente. Par conséquent, un transgène Cre transitoire et contrôlée doit être utilisé. La cassette Br2.1 fournit un excellent système pour distinguer entre les émissions se chevauchent sur l'emplacement de signal: l'expression de la YFP et RFP est cytoplasmique, la GFP est nucléaire et la PCP est lié à la membrane cellulaire. GFPet les émissions DP sont facilement séparés par microscopie à fluorescence conventionnelle. Afin de séparer les émissions YFP / GFP / PCP, un système d'imagerie confocale spectrale est nécessaire. Au total, la cassette Br2.1 permet l'expression spécifique aléatoire, inductible, et le tissu d'un sur quatre gènes fluorescents distincts dans chaque cellule ciblée. En fait, quand un plus grand nombre de combinaisons de couleurs est nécessaire, on peut générer des souris homozygotes contenant 2 allèles de Br2.1, conduisant ainsi à l'expression de 2 étiquettes de couleur pour chaque cellule et dans l'augmentation du nombre de combinaisons possibles de couleurs à 10 22. Certaines des souches de souris Br permettre l'expression d'un plus grand nombre de combinaisons possibles de couleurs depuis de multiples copies de la cassette ont été intégrées dans leur génome 16. Cependant, dans la plupart des cas, les quatre combinaisons de couleurs fournis par un seul allèle Br2.1 sont suffisantes. Après le protocole fourni ici, on peut établir cette méthode en utilisant une configuration relativement simple de spectral microscopie avec peu ou pas de nécessité d'un étalonnage.
Ici, nous fournissons un protocole adaptable pour l'utilisation de la souris R26R-confettis qui contiennent un seul allèle Br2.1, de la lignée de traçage expériences de l'épithélium cornéen. Cette souche de souris transgénique a été utilisé pour étudier l'origine et le devenir du côlon 21,23 et des cellules souches epitheliales cornéennes 22,24, la présence d'une activité de cellules souches dans le cancer intestinal 25, et pour la caractérisation de rein podocytes dans glomérulosclérose segmentaire et focale (FSGS) 17.