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Article de méthode

Les analyses microscopiques de Criblage à haut débit des facteurs de l'hôte impliqués dans

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DOI :

10.3791/54263

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5 août 2016

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* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Deux tests de dépistage à haut débit par microscopie des facteurs de l’hôte impliqués dans l’infection à Brucella sont décrits. Le test d’entrée détecte les facteurs de l’hôte nécessaires à l’entrée de Brucella et le test final ceux nécessaires à la réplication intracellulaire. Bien qu’il soit applicable à d’autres approches, le criblage de siRNA dans les cellules HeLa est utilisé pour illustrer les protocoles.

Résumé

Espèces de Brucella sont des agents pathogènes intracellulaires facultatifs qui infectent les animaux comme leurs hôtes naturels. La transmission aux humains est le plus souvent causée par un contact direct avec des animaux infectés ou par ingestion d'aliments contaminés et peut conduire à des infections chroniques graves.

Brucella peut envahir les cellules phagocytaires professionnels et non-professionnels et réplique au sein du réticulum endoplasmique (RE) de vacuoles -derived. Les facteurs de l' hôte requis pour l' entrée Brucella dans des cellules hôtes, éviter la dégradation lysosomale, et la réplication dans le compartiment ER-like demeurent largement inconnus. Nous décrivons ici deux essais pour identifier les facteurs de l' hôte impliqués dans Brucella l' entrée et la réplication dans les cellules HeLa. Les protocoles décrivent l'utilisation de l'interférence ARN, alors que les méthodes de criblage alternatives pourraient être appliquées. Les essais sont basés sur la détection de bactéries marquées par fluorescence dans les cellules hôtes marquées par fluorescence en utilisant automatiséla microscopie à champ large. Les images fluorescentes sont analysées à l'aide d'un pipeline d'analyse d'image normalisée dans CellProfiler qui permet l'infection par simple pointage à base de cellules.

Dans l'essai de point final, la réplication intracellulaire est mesurée deux jours après l'infection. Cela permet aux bactéries de trafic vers leur niche réplicative où la prolifération est lancé autour de 12 heures après l' entrée bactérienne. Brucella qui ont établi avec succès une niche intracellulaire aura ainsi fortement proliféré à l' intérieur des cellules hôtes. Comme les bactéries intracellulaires grandement plus nombreux que les bactéries non réplicatifs extracellulaires ou intracellulaires individuels, une souche exprimant constitutivement GFP peut être utilisé. Le signal de la GFP solide est ensuite utilisé pour identifier les cellules infectées.

En revanche, pour le dosage d'entrée, il est essentiel de faire la distinction entre les bactéries intracellulaires et extracellulaires. Ici, un codage de déformation pour une GFP inductible par la tétracycline est utilisée. Inductionde la GFP avec l'inactivation simultanée des bactéries extracellulaires par la gentamicine permet la différenciation entre intracellulaire et extracellulaire des bactéries en fonction du signal de la GFP, seules les bactéries intracellulaires étant capable d'exprimer la GFP. Ceci permet la détection des bactéries intracellulaires robuste unique avant la prolifération intracellulaire est initiée.

Introduction

Espèces de Brucella sont, les agents pathogènes intracellulaires facultatifs Gram négatif appartenant à la classe des α-protéobactéries. Ils provoquent des avortements et l'infertilité chez leurs hôtes naturels tels que les bovins, les chèvres, les moutons ou entraînant des pertes économiques sévères dans les zones endémiques. La brucellose est l' une des maladies zoonotiques les plus importants dans le monde entier causant plus d' un demi - million de nouvelles infections humaines par an 1. La transmission à l'homme est le plus souvent causée par un contact direct avec des animaux infectés ou par ingestion d'aliments contaminé....

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Protocole

Note: Tous les travaux avec en direct des souches de Brucella abortus doit être effectuée à l' intérieur d' un niveau de biosécurité 3 (BSL3) laboratoire compte tenu de tous les règlements nécessaires et les précautions de sécurité.

1. Préparation du dépistage Plaques et culture des bactéries et des cellules

  1. Préparation de Brucella abortus Cultures de démarrage
    1. Streak Brucella abortus 2308 (B. abortus) de -80 ° C le lait disponible sur une plaque CASO Agar (TSA) contenant 50 pg / ml de kanamycine (TSA / Km). Incuber la plaque pendant 3-4 jours à 37 ° C. Utilisez la souche

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Résultats

La figure 1A représente un exemple d'analyse d'image utilisé pour identifier automatiquement les cellules infectées dans l'essai de point final. Les noyaux des cellules HeLa colorées avec du DAPI ont été identifiées, une péri-noyau d'une largeur de 8 pixels entourant le noyau et un corps de cellule de Voronoi par extension du noyau par 25 pixels ont été calculés. Etant donné que les bactéries prolifèrent principalement dans l'espace péri-nucléaire, l&.......

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Discussion

Les pathogènes bactériens ont développé de nombreuses stratégies pour manipuler les cellules hôtes eucaryotes à leur avantage. Les agents pathogènes à l’origine d’infections aiguës présentent souvent une prolifération rapide qui s’accompagne d’une alarme importante du système immunitaire et d’une perte de viabilité des cellules infectées. En revanche, Brucella et d’autres agents pathogènes qui causent des infections chroniques parviennent à établir des interactions durables au sein des cellules hôtes. Par conséq.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêts.

Remerciements

Ce travail a été soutenu par les subventions 51RT 0_126008 et 51RTP0_151029 pour le projet de recherche et de développement technologique (RTD) InfectX et TargetInfectX, respectivement, dans le cadre de SystemsX.ch, l’Initiative suisse pour la biologie des systèmes. Nous reconnaissons les subventions 310030B_149886 du Fonds national suisse de la recherche scientifique (FNS). Les travaux de S.H.L et A.C. ont été soutenus par le programme international de doctorat « Fellowships for Excellence » du Biozentrum. Simone Muntwiler est récompensée pour son assistance technique. Nous tenons à remercier Dirk Bumann pour la fourniture du pNF106 et Jean Celli pour le pJC43 et le ....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Gélose de soja tryptique (TSA)BD236950
Bouillon de soja tryptique (TSB)Fluka22092
Sulfate de kanamycineSigma-Aldrich60615
Lait
250 ml Flacon à bouchon à visCorning8396
DMEMSigma-AldrichD5796
Fœtal Sérum de veau (FCS)Gibco10270
Trypsine-EDTA inactivée par la chaleur (0,5 %)Gibco15400-054Solution mère 10x, diluée 1:10 dans PBS
Scepte 2.0 Compteur de cellulesMerck MiliporePHCC20060Des dispositifs de comptage de cellules alternatifs peuvent être utilisés
Greiner CELLSTAR Plaque à 384 puitsSigma-AldrichM2062
Feuille d’aluminium pelableCostar6570
Distributeur de réactifs : « Multidrop 384 Reactive Dispenser"ThermoScientific5840150Distributeur de réactifs alternatif peut être utilisé.
Réactif de transfection : « Lipofectamine RNAiMAXInvitrogen13778-150
Laveur de plaques automatisé : « Laveur de plaques ELx50-16"BioTekELX5016Ce laveur de plaques contient un collecteur à 16 canaux adapté aux plaques à 384 puits. Il s’insère dans une armoire de biosécurité et dispose d’un couvercle recouvrant la plaque pendant le lavage, ce qui réduit le risque de production d’aérosols. D’autres rondelles de plaques avec des caractéristiques similaires pourraient être utilisées.
gentamicineSigma-AldrichG1397
Chlorhydrate d’anhydrotétracyclineSigma-Aldrich37919100 μ ; g/ml de solution dans de l’éthanol à 100 % est maintenue à -20 & ° C protégé de la lumière dans une feuille d’aluminium
PBSGibco20012
ParaformaldéhydeSigma-AldrichP6148Dissoudre dans 0,2 M Tampon HEPES, pH 7,4. Conserver à -20 ° ; C et décongeler fraîchement la veille de l’utilisation. Attention, le PFA est toxique par inhalation, en contact avec la peau et en cas d’ingestion.
HEPESSigma-AldrichH3375
Triton X-100Sigma-AldrichT9284
DAPIRoche10236276001
SiRNA brouilléDharmaconD-001810-10
Kif11 siRNADharmaconL-003317-00
ARPC3 siRNADharmaconL-005284-00
Brucella abortus 2308
pJC43 (apHT ::GFP)Celli et al.12
pAC042.08 (apht ::d sRed, tetO ::tetR-GFP)Construction : pJC44 4 a été digéré avec EcoRI suivi de la génération d’extrémités émoussées avec l’enzyme Klenov et d’une digestion ultérieure avec SalI. TetR-GFP a été amplifié à partir de pNF106 à l’aide des amorces prAC090 et prAC092. Après digestion avec SalI, le produit TetR-GFP a été ligaturé au vecteur pJC44 digéré.
Primer prAC090Sigma-AldrichTTT TTG AAT TCT GGC AAT TCC GAC GTC TAA GAA ACC
Primer prAC092Sigma-AldrichTTT TTG TCG ACT TTG TCC TAC TCA GGA GAG CGT
TC HeLa CCL-2ATCCCCL-2
ImageXpress MicroMolecular Devices  ;IXM IMAGING MSCOPEMicroscope d’imagerie cellulaire automatisé équipé d’une platine Z motorisée de précision. D’autres systèmes pour la microscopie automatisée et d’autres composants pour le matériel et les logiciels spécifiés ci-dessous peuvent être utilisés.
laser à mise au point automatique à grande vitesse  ;1-2300-1037
Objectif CFI Super Fluor 10XNikon·MRF00100N.A 0.50, L.D 1.20 mm, Prisme DIC : 10X,
Photométrie à ressort CoolSNAP HQ Caméra CCD monochromeDispositifs moléculaires1-2300-10601 392 x 1 040 pixels d’imagerie, 6,45 x 6,45 et micro ; m pixels, 12 bits numérisation
Logiciel MetaXpressMolecular Devices  ;9500-0100
LUI-Spectra-X-7LumencorSPECTRA X V-XXX-YZMoteur d’éclairage. Les sources lumineuses suivantes sont utilisées : violet (DAPI), cyan (GFP), vert/jaune (RFP)
Excitateur monobande pour DAPISemrockFF01-377/50-25
Émetteur monobande pour DAPISemrockFF02-447/60-25
Dichroïque monobande pour DAPISemrockFF409-Di03-25x36
Excitateur monobande pour GFPSemrockFF02-472/30-25
Émetteur monobande pour GFPSemrockFF01-520/35-25
Dichroïque monobande pour GFPSemrockFF495-Di03-25x36
Excitateur monobande pour RFPSemrockFF01-562/40-25
Émetteur monobande pour RFPSemrockFF01-624/40-25
Dichroïque monobande pour RFPSemrockFF593-Di03-25x36
écréméDispositifs moléculaires

Références

  1. Pappas, G., Papadimitriou, P., Akritidis, N., Christou, L., Tsianos, E. V. The new global map of human brucellosis. Lancet Infect Dis. 6, 91-99 (2006).
  2. Atluri, V. L., Xavier, M. N., de Jong, M. F., den Hartigh, A. B., Tsolis, R. E. Interactions of the human pathogenic Brucella species with their ....

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