Une méthode générale pour la détection des Nitrosamide Formation du métabolisme In Vitro des Nitrosamines par Cytochrome P450s

Résumé

Α-hydroxylation des nitrosamines cancérogènes par le cytochrome P450s est la voie métabolique acceptée qui produit des intermédiaires endommageant l’ADN, ce qui provoquent des mutations. Toutefois, les nouvelles données indiquent encore l’oxydation en nitrosamides peut se produire. Nous décrivons un général méthode pour détecter les nitrosamides produites in vitro du cytochrome P450-catalysée métabolisme de nitrosamines.

Résumé

N-nitrosamines sont un groupe bien établi des carcinogènes environnementaux, qui exigent l’oxydation du cytochrome P450 pour montrer l’activité. Le mécanisme accepté d’activation métabolique implique la formation de α-hydroxynitrosamines qui se décomposent spontanément aux agents alkylants ADN. L’accumulation de dommages à l’ADN et les mutations qui en résulte peut finalement mener au cancer. Nouveaux éléments de preuve indiquent que α-hydroxynitrosamines peut être encore oxydé nitrosamides progressivement par le cytochrome P450s. Parce que nitrosamides sont généralement plus stables que les α-hydroxynitrosamines et pouvez également alkylat ADN, nitrosamides peut jouer un rôle dans la cancérogenèse. Dans ce rapport, nous décrivons un protocole général pour évaluer la production de nitrosamide de in vitro du cytochrome P450-catalysée du métabolisme des nitrosamines. Ce protocole utilise une approche générale de la synthèse de la nitrosamides pertinents et un essai in vitro du cytochrome P450 métabolisme avec par spectrométrie de masse en tandem par chromatographie liquide-tuyères d’ionisation-haute résolution pour la détection. Cette méthode détecté N′- nitrosonorcotinine comme un métabolite mineur de N′- nitrosonornicotine dans l’étude de l’exemple. La méthode a haute sensibilité et le dépistage de masse sélectivement due à précis. Application de cette méthode à une grande variété de systèmes de nitrosamine-cytochrome P450 aidera à déterminer la portée générale de cette transformation. Parce que le cytochrome P450s sont polymorphes et varier en activité, une meilleure compréhension de la formation de nitrosamide pourrait aider dans l’évaluation du risque individuel de cancer.

Introduction

N-nitrosamines sont une large classe de substances cancérigènes dans l’alimentation, de produits du tabac et de l’environnement en général ; ils peuvent également se former de manière endogène dans le corps humain¹. Plus de 300 N -nitroso composés ont été testés et > 90 % ont été évalués comme cancérogène chez les modèles animaux^2,3. Pour exposer leur cancérogénicité, ces composés doivent tout d’abord être activés par le cytochrome P450s^1,2,3. La recherche montre que le cytochrome P450s oxyder facilement nitrosamines de α-hydroxynitrosamines (Figure 1), qui sont des composés très réactifs ayant une demi-vie de ~ 5 s avant de se décomposer spontanément à alkyldiazohydroxides. Ce dernier peut alkylat ADN après la perte de H₂O et N₂. Adduits de l’ADN qui en résulte, si non réparé, peut causer des mutations qui, en cas de critique onco - ou les gènes suppresseurs de tumeur, mener à cancer du développement¹. Pour cette raison, beaucoup d’efforts ont été déployé afin d’acquérir une compréhension complète des voies métaboliques, adduits à l’ADN et des métabolites en aval de l’oxydation du cytochrome P450 des nitrosamines cancérigènes. Cette connaissance a application potentielle dans l’évaluation de risque de cancer individuel⁴.

Figure 1 : Général et métabolisme proposé des nitrosamines.
Nitrosamines (1) sont oxydés par P450s de α-hydroxynitrosamines (2) qui se décomposent spontanément à alkyldiazohydroxides (3). Ces composés peuvent lier à l’ADN pour former que des adduits d’ADN. On fait l’hypothèse que les 2 sont oxydés par P450s nitrosamides 4. Ceux-ci peuvent directement lier à l’ADN pour former de nouveaux ADN adduits ou être hydrolysé en 3 pour former que des adduits d’ADN connu. R₁ et R₂ représentent un groupe alkyle. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.

Bien que l’hypothèse de le α-hydroxynitrosamine est solidement soutenue par nombreuses données, il y a quelques incohérences ; importante est la courte demi-vie des α-hydroxynitrosamines^5,6. On sait que ces composés sont produits à la membrane du réticulum endoplasmique et plus tard alkylation de l’ADN nucléaire. Compte tenu de leur durée de vie de quelques secondes, c’est curieux comment ces intermédiaires survivent le voyage requis si le cytosol. Une hypothèse est qu’une partie de le α-hydroxynitrosamines s’oxydent progressivement nitrosamides^7,8, qui sont assez stables en comparaison de⁹. Cela se produirait vraisemblablement par l’intermédiaire de rétention des α-hydroxynitrosamines dans le site actif de cytochrome P450. Précédent pour ce type d’oxydation a été constaté avec la nicotine¹⁰, alcools¹¹et simple alkylnitrosamines^12,13. En outre, nitrosamides sont action directe carcinogènes^2,3. Basé sur leur réactivité⁹, ces composés sont crus pour produire de l’ADN des adduits identiques à celles qui résultent de le α-hydroxynitrosamines ainsi que de nouveau, adduits à l’ADN inexploré (Figure 1). Ainsi, cette hypothèse explique non seulement le transport à travers le cytosol, mais également la formation de l’ADN endommager les produits.

Dans cet article, on décrit un protocole général pour évaluer in vitro du cytochrome P450 induite par la conversion des nitrosamines nitrosamides. La conversion a déjà été indiquée de N′- nitrosonornicotine (NNN) N′- nitrosonorcotinine (NNC) de 2 a 6 du cytochrome P450 est présentée comme un exemple de¹⁴. Application du présent protocole à un large éventail de systèmes de substrat-enzyme aidera à déterminer l’importance des nitrosamides dans métabolisme global de nitrosamine.

Protocole

1. matériaux et procédures générales

1. synthétisent NNN décrite précédemment ¹⁵. Obtenir norcotinine, P450 2 a 6 Baculosomes, système de régénération de NADPH, tampon de réaction x 0,5 et tous les autres produits chimiques ou des solvants de sources commerciales en réactif.
2. Des spectres de RMN de l’enregistrement sur un spectromètre 500 MHz. Déplacements chimiques en rapport en parties par million (ppm). Utiliser des pics de solvants résiduels comme références internes pour ¹ H-RMN (7,26 ppm CDCl ₃) et ¹³ C-RMN (77,2 ppm CDCl ₃).
   NOTE : Fractionnement de pointe utilisé les abréviations suivantes : s = singulet, d = doublet, dd = doublet de doublets, dt = doublet de triplets, dq = doublet des quatuors, ddd = doublet de doublet de doublets et m = multiplet.
3. Effectuer la spectrométrie de masse haute résolution (SGRH) pour certains composés sur un LTQ Orbitrap valant Velos et les données du rapport m/z.
4. Utilisation polygram pré-enrobé plaques de gel de silice TLC (40 mm x 80 mm, 0,2 mm d’épaisseur) avec indicateur fluorescent de 254 nm pour la chromatographie sur couche mince (CCM). Visualiser les plaques de CCM par l’irradiation UV lampe.
5. Exécuter flash chromatographie sur une 60 Å, gel de silice 70-150 mesh en utilisant une colonne de verre 1,5 cm x 15 cm.

2. Préparation du contrôle positif de nitrosamide (N ′-nitrosonorcotinine, CNN)

1. sec, dans un four toute la nuit (16 h, ~ 140 ° C), un 25 mL, ballon contenant une barre d’agitation magnétique. Le matin, cool le ballon sous un flux de N ₂, tout en utilisant un barboteur d’huile pour maintenir le flux de ₂ N taux sous une bulle par seconde.
   Nota : Après refroidissement, aucune précaution pour garder le ballon sous N ₂ n’est nécessaires.
2. Sous une hotte, ajouter norcotinine (31,8 mg, 0,196 mmol), l’anhydride acétique (5 mL) et l’acide acétique (1 mL) dans le ballon refroidi. Incorporer ce mélange en continu en refroidissant à 0 ° C avec un bain de glace d’eau.
   Mise en garde : L’anhydride acétique et l’acide acétique sont corrosifs.
3. Ajouter NaNO ₂ (33,3 mg, 0,483 mmol) dans une portion et agiter continuellement le mélange pour 2,5 h. suivre les progrès de réaction par TLC (100 % EtOAc, R _f = 0,19, reportez-vous à l’étape 1.4).
   Remarque : Pendant cette période, le mélange va devenir plus en plus jaune avec bulles occasionnels.
4. Étancher la réaction en versant le mélange en glacee H ₂ O (18 mL). L’extrait immédiatement la solution aqueuse avec 18 mL de CH ₂ Cl ₂ dans une ampoule à décanter de 100 mL. Extraire la phase aqueuse au moins 2 fois avec CH ₂ Cl ₂ (9 mL chacune).
5. Sécher les matières organiques regroupées plus de ~ 100 mg de MgSO ₄ pendant 2 min. filtre et concentrer la solution par évaporateur rotatif pour produire une huile brute, jaune. Faire chauffer le bain d’eau à 30 ° C au cours de l’évaporation à éliminer l’acide acétique résiduel.
   Remarque : Le protocole peut être suspendu ici si le composé est dissous dans la CH ₂ Cl ₂ et la solution conservés dans l’obscurité à 2-8 ° C.
6. Purifier le brut composé par chromatographie sur colonne (Voir l’étape 1.5) avec gel de silice comme phase stationnaire et 100 % EtOAc comme l' éluant ¹⁶.
   Mise en garde : CNN et nitrosamides connexes doivent être manipulés avec précaution car ils sont supposés pour être cancérogènes pour les humains.
7. Dissoudre le composé pur dans CDCl ₃ et utilisent la RMN (Voir l’étape 1.2) pour confirmer la structure et déterminer la molarité de cette solution ¹⁷. Conserver cette solution dans l’obscurité entre 2 et 8 ° C jusqu'à ce que nécessaire.
   NOTE : Cette solution servira comme contrôle positif dans l’essai in vitro avec (étape 3.5). Les spectres RMN et les déplacements chimiques sont disponibles dans l’Information à l’appui.
8. Avec une solution pure de CNN, confirmer la précision masse de parent et de déterminer les masses des ions produit par perfusion directe sur un spectromètre de masse à haute résolution (SGRH) sous paramètres décrits aux points 1.3 et 4.3.
   Remarque : Les masses produit seront utilisés pour détecter ce composé dans le dosage de métabolisme in vitro (étape 4.3).

3. Une nitrosamine-P450 in vitro incubation de l’exemple

1. supprimer P450 2 a 6 Baculosomes, Vivid-NADPH-régénération système et 10 mM NADP ⁺ Solution-mère d’un congélateur à-80 ° C et laissez-les décongeler sur la glace. Une fois décongelé, diluer le Baculosomes et le NADPH-régénération système 1:10 et 01:50, respectivement, dans un tube unique 1 mL avec réaction de X 0,5 tampon. De même, ajoutez 3 μL du NADP ⁺ Solution-mère à 97 μL de 0,5 X réaction Buffer.
   Remarque : Le NADP ⁺ est sensible à la lumière. Conserver cette solution protégée en l’enveloppant de son conteneur en aluminium. Les solutions enzymatiques sont sensibles aux cycles de gel-dégel ; Cela se limite à pas plus de 2 cycles. Préparer des aliquotes nécessaires pour de futures expériences.
2. Pour chaque incubation, ajouter 50 μL de solution d’enzyme (contenant 5 pmol P450) à un 1 mL tube contenant 40 μL de solution NNN μM 4 faite avec tampon de réaction. Incuber avant ce nouveau mélange pendant 2 min à 37 ° C à l’aide d’un bain d’eau et puis ajouter 10 μL de la solution diluée de NADP ⁺. Incuber le système complet pour 1-30 min à 37 ° C.
   Remarque : L’utilisation des intervalles de 5 min pour le temps d’incubation (par exemple 5, 10, 15 min, etc.) donnera un cours de temps de formation nitrosamide suffisants.
3. Après l’heure souhaitée d’incubation, étancher par première ajouter 10 μl de 3,0 ZnSO N ₄ et ensuite 10 μL de 3,0 N Ba(OH) _2. Vortex, cette solution et un précipité blanc seront forme. Centrifuger l’échantillon à 8000 x g pendant 4 min granuler le précipité.
   Remarque : La procédure doit arrête pas à cette étape que les nitrosamides formés ont peu de stabilité en solution aqueuse. Faux négatifs peuvent entraîner de longues pauses.
4. Immédiatement Pipeter le surnageant et analyser 2 μL par spectrométrie de masse en tandem haute résolution SPECTROMETRIE-ionisation positive par chromatographie liquide (LC-NSI ⁺-HRMS/MS, étapes de 4,1 à 4,3).
5. Pour des incubations de contrôle positif, s’évaporer une partie aliquote contenant 100 fmol de solution de CNN synthétisée dans un tube de 1 mL dans un flux de N ₂. Ce flacon, ajouter le système enzymatique complet de l’étape 3.2 et procédez comme pour les étapes 3.3-3.4.
6. Pour des incubations de contrôle négatif, réaliser l’expérience comme décrits (étapes 3.2-3.4) sauf remplacer le 50 μL enzyme solution avec 0,5 X tampon de réaction.

4. Exemple de paramètres pour la détection de nitrosamide par LC-NSI ⁺-HRMS/MS

1. pour le LC composant, appliquer le dégradé de plusieurs étape suivant à l’étape 4.2 vers un système UPLC à l’aide d’un commercial, emballées à la main ¹⁸ C18 (5 μm), 100 mm x 75 μm, colonne capillaire en 15 μm orifice.
2. à l’aide de 5 mM NH ₄ OAc comme solvant A et MeCN comme solvant B, charger l’échantillon sur la colonne en exécutant à 5 % B à 1 μL/min de 0 - 5 min et puis ralentir la vitesse d’écoulement à 0,3 μL/min par la suite. Ensuite, exécutez un gradient de 5 à 20 % B pendant 4 min, suivie d’une rampe à 55 % B pendant 10 min, puis ré-équilibration à 5 % B.
3. Effectuer le LC-NSI ⁺-HRMS/MS sur une LTQ Orbitrap valant. Moniteur pour CNN par balayage complet et fragmentation de ² MS. Exécuter une analyse complète avec une résolution de 60 000 et extraire la masse exacte parent (192.07670) avec une tolérance de masse de 5 ppm. Utilisation MS ² fragmentation isoler parent ions (2,0 UMA) et fragment de collision dissociation induite (CID) avec une énergie de collision de 25 eV, résolution de 15 000, et l’analyse des temps de Mme 30 extraire les masses exactes des ions produits de CNN (m/z 192 m/z 134.04739 et 162.07874) avec une tolérance de masse de 5 ppm.

Résultats

Basé sur le travail de blanc et al. ¹⁹, norcotinine était nitrosés à NNC proprement et avec un rendement élevé (80 à 92 %) de produire une norme pour l’expérience in vitro . Preuves de structure pour une réaction réussie a été obtenus par analyse spectroscopique dont ¹H-RMN, ¹³C-RMN, COSY et HSQC (renseignements à l’appui) ainsi que SGRH qui a confirmé la masse parent [M + H]⁺ au sein de 5 ppm de la valeur théoriqu...

Discussion

Élucider le métabolisme des nitrosamines est un élément essentiel à la compréhension de leur cancérogénicité. Étant donné que la cause du cytochrome P450s et autres enzymes métaboliques sont polymorphes, d’application de cette connaissance pourrait potentiellement identifier plus précisément haut risque particuliers^1,4. Nouvelles données indiquent que l’oxydation supplémentaire des α-hydroxynitrosamines, les principaux métabolites présumées des nitrosamines impli...

Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article

Nom	Entreprise	Numéro de catalogue	Commentaires
Norcotinine	AKoS GmbH (Steinen, Allemagne)	CAS 17708-87-1, AKoS AK0S006278969
Acide acétique	Sigma-Aldrich	695092
Anhydride acétique	Sigma-Aldrich	Acétate d’ammonium 242845
	Sigma-Aldrich	431311
Hydroxyde de baryum	Sigma-Aldrich	433373
D-Chloroforme	Sigma-Aldrich	151823
HPLC Acétonitrile	Sigma-Aldrich	34998
Sulfate de magnésium	Sigma-Aldrich	M7506
Chlorure de méthylène	Sigma-Aldrich	34856
Nitrite de sodium	Sigma-Aldrich	237213
ViVid CYP2A6 Blue Kit de dépistage	Life Technologies	PV6140
Sulfate	de zinc Sigma-Aldrich	221376
tubes de 0,5 mL	Fisher	AB0533
Fiole à fond rond de 100 mL	Erlenmeyer Sigma-Aldrich	Z510424
125 mL	Sigma-Aldrich	CLS4980125
125 mL Entonnoir séparateur	Sigma-Aldrich	Z261017
25 mL rond fiole inférieure	Sigma-Aldrich	Z278262
Spectromètre RMN 500 MHz	Centrifugeuse Bruker
Allegra X-22R	Beckman-Coulter
LC	ChromTech	CTC&ndash ; 0957&ndash ; BOND
LTQ Orbitrap Velos Thermo	Scientific
Barre d’agitation magnétique	Sigma-Aldrich	Z127035
tube RMN	Sigma-Aldrich	Z274682
pipettes P1000, P200 et P10	Eppendorf
Évaporateur rotatif	Sigma-Aldrich	Z691410
système	RSLCnano UPLCThermo Scientific
Bain-marie à secouer	Fisher	FSSWB15
Plaque	d’agitation Sigma-Aldrich	CLS6795420
PicoFrit	Colonne New Objective	PF3607515N5
Luna C18, 5 um	Phenomenex	535913-1