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L'enrichissement suffisant d'un type de cellule germinale est généralement considéré comme supérieur à 80 %6. Le protocole MDR fonctionne particulièrement bien pour enrichir les spermatides ronds. Un nombre élevé de spermatides ronds purs de 'gt;90% peut être systématiquement obtenu en utilisant cette technique. Les fractions optimales des spermatozoïdes pachytenés et des spermatides allongés sont enrichies à 75 % et 80 %, respectivement. Les spermatides allongés ont tendance à rester au-dessus du gradient et sont recueillis avec la première fraction. Dans l'exemple montré, la fraction 1 contenait 80 % des spermatides allongés (figure 2B). La plupart des spermatides allongés obtenus avec cette technique ont condensé des noyaux, tandis que les spermatides allongés précoces non condensés sont rares (Figure 2A). Les fractions suivantes contiennent des spermatides ronds enrichis. Dans l'exemple, l'enrichissement des spermatides ronds était de plus de 90 % en fractions 2, 3 et 4, et l'enrichissement supérieur à 80 % a été observé au total en sept fractions (2 à 8) (figure 2B). En raison de leur grande taille, les spermatocytes de pachytene sédimentent plus rapidement et sont recueillis en dernier. Dans l'exemple de purification, l'enrichissement était d'environ 75 % en fractions 14 et 15(figure 2B).
Tandis que la morphologie nucléaire, visualisée par la coloration de DAPI, suffit habituellement pour la reconnaissance des cellules, l'analyse d'immunofluorescence peut être exécutée pour soutenir l'analyse. PNA tache les acrosomes en développement de spermatides ronds et allongés, et l'aspect acrosomique peut être exploité pour classer davantage les spermatides ronds dans les étapes 1-8 de la différenciation10. Distinguer les spermatides allongés et ronds teintés de PNA repose sur les différences dans leur forme nucléaire(figure 2C, panneau gauche). L'anticorps anti-DDX4 est un marqueur utile pour les fractions spermatides rondes puisqu'il visualise un seul granule périnucléaire DDX4-positif, le corps chromatoïde (CB), dans le cytoplasme de chaque spermatide rond. Cette coloration spécifique au CB est facile à distinguer de la coloration cytoplasmique plus largement distribuée dans les spermatocytes(Figure 2C, panneau moyen). Les spermatocytes de pachytene peuvent être reconnus par l'anticorps anti-H2AX qui étiquette le corps sexuel nucléaire apparaissant spécifiquement à la phase de pachytene de la première division méiotique (figure 2C, panneau droit). Dans cette purification, la coloration PNA a révélé que les fractions spermatées rondes enrichies de MDR contenaient un mélange de spermatides ronds à diverses étapes de différenciation, toutes contenant leur structure de signature, le CB DDX4-positif (Figure 2D, fraction RS). Les spermatozoïdes de pachytene d'enrichissement en fraction 16(figure 2D , fraction PSpc) ont validé les spermatozoïdes de pachytene d'enrichissement en fraction 16 ( figure 2D, fraction PSpc).
Le comptage cellulaire a révélé que le nombre de cellules dans les fractions rondes de spermatocytes spermatid et pachytené s'est adapté à diverses analyses en aval. Les fractions spermatées rondes (5 à 8) contenaient chacune environ 2,5 x 106 cellules. Par conséquent, en mettant en commun ces fractions, il est possible d'obtenir plus de 10 millions de cellules. Les fractions de spermatocyte de Pachytene (14 et 15) contenaient habituellement un peu moins de cellules. Dans cet isolement, environ 1,5 à 2,0 x 106 cellules par fraction ont été comptées. La première fraction contenait 0,75 x 106 spermatides allongés.
Comme le montre la figure 3A, la quantité totale d'ARN obtenue à partir de la majorité des fractions variait de 0,5 à 2,5 g, ce qui est suffisant pour les analyses d'ARN en aval telles que la transcription inversée PCR, le séquençage de l'ARN ou la visualisation de l'ARN sur un gel. La quantité de protéines obtenues à partir de chaque fraction varie généralement de 20 à 140 g (figure 3B), ce qui est suffisant pour plusieurs taches occidentales. Des lysates entiers de cellules ont été préparés à partir des fractions rassemblées, et l'analyse occidentale de tache a été exécutée utilisant des anticorps détectant DDX4, PIWIL1, et PIWIL2, qui sont tous fortement exprimés dans les spermatocytes de pachytene et les spermatides ronds aussi bien que l'omniprésent déshydrogénase exprimée de glycéraldéhyde 3-phosphate (GAPDH).
Dans ce protocole, 10 % des lysates protéiques dérivés de fractions uniques étaient suffisants pour détecter clairement toutes ces protéines sur un réglage standard de tache occidentale(figure 3C). La quantité de protéines dans une fraction s'est également avérée suffisante pour l'immunoprécipitation à l'aide d'un anticorps contre PIWIL1, ainsi que pour la détection de PIWIL2 co-immunopicié(figure 3D). En outre, ce protocole a été utilisé avec succès pour obtenir des fractions enrichies de spermatocytes pachytenés et de spermatides ronds à partir de souris témoins et génétiquement modifiées pour des applications en aval telles que la transcription inverse quantitative PCR11 et le séquençage de l'ARN à haut débit12.

Figure 1 : Préparation d'un gradient BSA discontinu. (A) Une pointe de pipette sérologique de 5 ml pour la préparation du gradient. (B) Une pointe de pipette de 1 ml pour la préparation du gradient et de la collecte des fractions des cellules germinales après la sédimentation. (C) L'équipement nécessaire à la préparation du gradient. (D) Vue latérale du gradient de densité BSA discontinu du 5 % (en bas) à la solution BSA de 1 % (en haut) ; les 2% et 4% BSA solutions sont de couleur bleue pour une meilleure visualisation. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 2 : Images représentatives des fractions cellulaires collectées et de l'analyse de l'enrichissement. (A) Cellules testiculaires tachées de DAPI. La rangée supérieure montre les cellules testiculaires dans l'épithélium séminifère intact d'une section de testis fixée par la paraffine (à gauche) ou en suspension (à droite). La rangée inférieure montre des fractions de spermatides allongés enrichis (ES), de spermatides ronds (RS) ou de spermatocytes pachytenés (PSpc). Barres d'échelle de 20 m pour la rangée supérieure et de 10 m pour les en-ttes de la rangée inférieure. (B) Quantification relative des différents types de cellules germinales dans chaque fraction. Les cellules ont été comptées manuellement à l'aide du logiciel ImageJ et classées en cellules RS, ES, PSpc, Sertoli et autres. Les nombres de fractions et les pourcentages respectifs de BSA dans le gradient sont indiqués sur l'axe X. (C) Analyse d'immunofluorescence des cellules testiculaires. Panneau gauche : PNA étiqueté rhodamine tache l'acrosome dans les deux ES (flèche jaune) et RS (flèche blanche). Panneau moyen : L'anticorps DDX4 tache un seul granule périnucléaire en RS, ce qui est facile à distinguer du signal cytoplasmique plus diffus dans les spermatocytes (flèche bleue). Aucun signal DDX4 n'est détecté dans ES (flèche orange). Panneau droit : L'anticorps H2AX reconnaît le corps sexuel nucléaire caractéristique présent uniquement dans les spermatocytes de pachytene (cellules négatives de H2AX marquées par un astérisque blanc). Des barres d'échelle de 10 m. (D) fractions de cellules enrichies mDR ont été étiquetées avec PNA (fraction RS), anti-DDX4 (fraction RS) et anti-H2AX (fraction PSpc) pour valider davantage l'enrichissement cellulaire dans chaque fraction. Barres d'échelle de 10 m. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 3 : Analyses en aval après enrichissement cellulaire MDR. (A) l'ARN a été extrait de chaque fraction après un enrichissement représentatif de cellules de MDR et quantifié. Les nombres de fractions et les pourcentages respectifs de BSA dans le gradient sont indiqués sur l'axe X. (B) Les protéines ont été extraites de chaque fraction en lysant la pastille cellulaire dans le tampon d'analyse de radioimmunoprécipitation (RIPA) puis quantifiées. (C) Des extraits entiers de protéine de cellules ont été préparés et analysés par le ballonnement occidental utilisant des anticorps contre DDX4, PIWIL1, PIWIL2, et GAPDH. 10 % du lysate était chargé à partir de chaque fraction indiquée. (D) L'immunoprécipitation a été effectuée à partir de fractions indiquées à l'aide d'anticorps anti-PIWIL1, suivis de ballonnements occidentaux avec des anticorps anti-PIWIL1 et anti-PIWIL2. L'échantillon d'entrée comprend un mélange de lysates protéiques provenant de différentes fractions, et l'immunoprécipitation de contrôle (IP) à l'aide du lapin IgG a également été effectuée à partir d'un lysate mixte. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 4 : Représentation schématique du protocole MDR et temps requis pour terminer chaque étape. Le matériel de départ est composé de deux testicules d'une souris adulte. Le nombre moyen de cellules et la quantité d'ARN et de protéines obtenues à partir d'une fraction sont indiqués. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
| tampon | Réactifs | préparation | espace de stockage |
| Krebs tampon (10x) | 3,26 g KH2PO4
| Porter à 2 L avec H2O, filtrer 0,22 m et autoclave. | Peut être stocké à 4 oC pendant plusieurs mois |
| 139,5 g NaCl |
| 5,89 g MgSO4 '7H2O |
| 50 g de dextrose |
| 3,78 g CaCl2-2H2O |
| 7,12 g KCl |
| Krebs tampon (1x) | 4,24 g NaHCO3
| Dissoudre NaHCO3 à 100 ml de H2O, ajouter 200 ml de tampon De 10x Krebs et porter à 2 L avec H2O. | Pour être préparé frais |
| 200 mL 10x Krebs tampon |
Tableau 1 : Préparation du tampon Krebs.
| Concentration BSA (w/v) | 10% solution BSA | 1x Tampon Krebs |
| 0.50% | 0,5 ml | 9,5 ml |
| 1% | 1 mL | 9 mL |
| 2% | 2 mL | 8 mL |
| 3% | 3 mL | 7 mL |
| 4% | 4 mL | 6 mL |
| 5% | 5 mL | 5 mL |
Tableau 2 : Préparation des solutions BSA.
| Solution de digestion | Concentration de travail | Réactifs | préparation |
| Collagènase | 1 mg/ml | Collagène IV | Peser 2 mg de collagène IV à un tube conique de 50 ml, et ajouter 2 ml de tampon chaud de 1x Krebs juste avant la digestion (étape 2.3). |
| Trypsine | 0,6 mg/mL | Trypsine | Peser 15 mg de trypsine à un tube conique de 50 ml, et ajouter 25 ml de tampon chaud 1x KREBS et 40 oL de DNase I juste avant la digestion (étape 2.6). |
| 3,2 ku/mL | DNase I |
Tableau 3 : Préparation des enzymes de digestion.