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Une illustration schématique des stimulations cytokine utilisées pour la polarisation des cellules dérivées des monocytes à M0 (cellules m2), M1 (cellules M1 entièrement polarisées) et M2 (cellules M2 entièrement polarisées) est présentée à la figure 1A,tandis que des images représentatives des cultures cellulaires M0, M1 et M2 ainsi que des cultures M1 aux jours 0, 3 et 7, sont présentées à la figure 1B. Des cellules M0 non infectées ont été utilisées pour démontrer la stratégie de base de gating (figure 2A). Initialement, les cellules myéloïdes (~85%) ont été fermés en fonction de leurs propriétés de dispersion vers l’avant (FSC) et de dispersion latérale (SSC), y compris les plus grandes cellules à haute granularité et à l’exclusion des débris de petite taille avec un faible SSC et FSC qui se trouvent dans le coin inférieur gauche de la parcelle de points. Dans la deuxième parcelle, les doublets (c.-à-d. les touffes cellulaires) ont été définis comme ayant une surface accrue mais une hauteur similaire par rapport aux cellules individuelles et ont été exclus de l’analyse plus poussée. Par conséquent, seules les cellules proportionnées entre fsc-zone et FSC-Hauteur (cellules simples) ont été inclus à l’intérieur de la porte de forme inclinée. Ensuite, le colorant de viabilité Zombie-UV qui tache les protéines cytoplasmiques à l’intérieur des cellules mortes, a été utilisé pour exclure les cellules mortes de l’analyse ultérieure. Comme prévu, les cellules M0 non infectées viables étaient négatives pour l’expression Mtb-GFP visualisée dans le canal FITC.
Ensuite, nous avons appliqué la même stratégie de gating aux macrophages M1 et M2 non infectés ainsi qu’aux macrophages M1 et M2 non infectés à 4 heures après l’infection (figure 2B,C). Deux sous-populations ont été détectées dans la porte FCS/SSC des macrophages polarisés M1 non infectés; une population ayant une plus petite taille (FCS) et une granularité plus élevée (SSC) et l’autre population avec une plus grande taille et une granularité inférieure (figure 2B), tandis que la porte principale des cellules M2 non infectées semblait plus homogène (Figure 2C). Les cellules dérivées des monocytes M1 et M2 ont affiché un déplacement vertical vers une granularité plus élevée et une taille cellulaire réduite lors de l’infection à vtt, ce qui peut refléter une complexité accrue à l’intérieur des cellules causée par l’absorption de bactéries mtb intracellulaires(figure 2B,C). En outre, la tache de viabilité a indiqué une mort cellulaire accrue (17-22%) chez les cellules M1 et M2 infectées par la tonte à un MOI de 5, comparativement aux cellules M0 non infectées (99 %) (Figure 2A-C) ou cellules M1 et M2 non infectées (données non montrées). Les données représentatives ont montré que l’expression Mtb-GFP (c.-à-d. infectiosité de la tb) était sensiblement plus élevée chez les cellules M2 (77 % de cellules gfp-positives) que dans les cellules M1 (19 % de cellules gfp-positives) après 4 heures d’infection(figure 2B,C). Après 24 heures d’infection, l’expression de Mtb-GFP était 43% et 85% dans les cellules M1 et M2 respectivement, suggérant que les cellules M1 ont eu une augmentation relativement plus élevée de GFP-expression de 4-24 heures après infection de Mtb comparée aux cellules M2, 126% contre 10.4% augmentation de GFP-expression dans les cellules M1 et M2 de 4-24 heures, respectivement.
Pour caractériser l’efficacité de la polarisation M1/M2 dans les cellules non infectées dérivées des monocytes, des parcelles de points ont été utilisées pour identifier les cellules M1 doublement positives pour le CD64 et le CD86 (CD64+CD86+) et les cellules M2 qui étaient doublement positives pour le CD163 et le CD200R (CD163+CD200R+; Figure 3A,B). La sélection des marqueurs M1/M2 a été principalement faite sur la base des résultats de nostravaux précédents 25 mais aussi d’autresétudes 26,27,28,29. Les quadrants des cellules tachées ont été fixés à l’aide de barrières correspondantes pour les cellules M1/M2 non tachées (figure 3A). Aucun de ces marqueurs n’est exclusivement exprimé par les cellules M1 ou M2, mais la proportion de cellules positives ainsi que l’intensité de l’expression de surface est différente. Cela était particulièrement évident à partir de la tache M1 où environ 95% des cellules M1 et 79% des cellules M2 étaient CD64+CD86+, mais l’intensité de coloration était sensiblement plus élevé dans le sous-ensemble M1 (Figure 3A). Alors que 27% des cellules M1 étaient positives pour le CD200R à marqueur M2, seulement 1% étaient positives pour le CD163, fournissant 0,5% de CD163+CD200R+ cellules M1 contre 63% de CD163+CD200R+ cellules M2 (Figure 3A). Après 4 heures d’infection par la tonte, une augmentation de la fréquence des cellules CD200R+ a été observée dans les cellules polarisées M1 positives au Mtb-GFP (16 %), tandis que l’expression du CD163 a été réduite dans les cellules M2 (figure 3B). La carte thermique démontre une forte intensité d’expression GFP dans les cellules CD163+CD200R+ M2, mais aussi dans le sous-ensemble CD64+CD86+ M2 par rapport aux sous-ensembles de cellules M1 correspondants (Figure 3B). Dans l’ensemble, le changement d’expression des marqueurs M1 et M2 respectifs est également visualisé dans les histogrammes de la figure 3C. En outre, les bactéries Mtb-GFP ont également été visualisées dans les cellules CD64+ M1 et dans les cellules CD163+ M2 par microscopie confoccale, qui a soutenu une absorption intracellulaire accrue et/ou la croissance de la tome à l’intérieur de M2 par rapport aux cellules M1(figure 3D).
Pour vérifier les résultats du gating manuel, nous avons appliqué la réduction de dimensionnalité utilisant l’approximation et la projection uniformes multiples (UMAP). L’analyse umap a montré que l’infection à vtt pendant 4 heures n’était pas suffisante pour affecter la polarisation des macrophages, contrairement à 24 heures d’infection, ce qui a entraîné des grappes clairement séparées de cellules M1 et M2 non infectées et infectées (figure 4A). Les macrophages M1 non infectés affichaient une expression plus élevée des macrophages CD64, CD86, TLR2, HLA-DR et CCR7 par rapport aux macrophages M2, tandis que les cellules M2 non infectées présentaient une forte régulation des marqueurs phénotypeS M2 CD163, CD200R, CD206 et CD80(figure 4B,C). En accord avec le gating manuel, l’infection à vtt après 24 heures a provoqué une nette baisse de la réglementation des CD163, CD200R et CD206 sur les cellules M2 et une déréglementation du CD86 et du HLA-DR sur les cellules M1 (figure 4B,C), ce qui suggère que le VTT peut moduler la polarisation des macrophages. L’analyse phénographique subséquente (figure 4D-F) a permis d’identifier 24 grappes différentes de différentes tailles qui ont été réparties de façon unique entre les cellules non infectées et infectées par le vtt M1 et M2, comme l’illustrent les graphiques umap (figure 4D), les diagrammes à secteurs (figure 4E) et les cartes thermiques (figure 4F). Au total, ces résultats montrent l’efficacité prometteuse de ce protocole pour générer phénotypiquement et fonctionnellement diverses cellules polarisées M1 et M2 in vitro qui sont encore modulées par infection de vtt.

Figure 1 : Illustration schématique de la différenciation in vitro et de la polarisation des cellules myéloïdes-dérivées humaines. (A) M0 (M2-like), M1 (classiquement activé) et M2 (alternativement activé) cellules sont représentées. Les monocytes obtenus auprès de donneurs de sang sains ont été polarisés avec différentes cytokines comme décrit dans le protocole et infectés par la souche de vtt étiquetée GFP, H37Rv, pendant 4 heures avant l’analyse avec cytométrie de flux de 10 couleurs. Les cellules polarisées par M1 contiennent généralement moins de bactéries que les cellules polarisées par M2. (B) Images microscopiques de cellules M0, M1 et M2 entièrement polarisées et non infectées dans les plaques de 6 puits au jour 7, et images représentatives de la différenciation cellulaire M1 des monocytes aux jours 0, 3 et 7. Le grossissement est de 20x (panneau supérieur) et 10x (panneau inférieur). Notez que les cellules M1 sont plus allongées et étirées par rapport aux cellules M0 et M2 plus arrondies (panneau supérieur). S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 2 : Stratégie de gating des cellules myéloïdes différenciées dérivées. Parcelles à points représentatives montrant (A) Les propriétés de dispersion vers l’avant (FSC) et de dispersion latérale (SSC) des macrophages M0 non infectés. La parcelle FSC-A/FSC-H montre le gating manuel des cellules simples proportionnées pour la zone et la hauteur. La porte cellulaire vivante excluait les cellules qui étaient positives pour zombie-UV (colorant de viabilité). Le vtt intracellulaire a été détecté par expression GFP dans les cellules vivantes observées dans le canal FITC. (B) Gating de M1 et (C) macrophages M2 montrant FCS / SSC parcelles de points à la fois dans les cellules non infectées et les cellules infectées par le vtt 4 h et 24 h après l’infection. S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 3 : Efficacité du protocole de polarisation in vitro M1/M2. Parcelles de points représentatives et gating de quadrant montrant les fréquences sous-ensemble des cellules polarisées M1 et M2 à l’aide de cellules non infectées CD64 et CD86 (M1) ou CD163 et CD200R (M2) dans (A) cellules non tachées et tachées non infectées et (B) cellules tachées infectées par le VTT 4 h après l’infection. Les parcelles de points dans (B) illustre l’intensité de fluorescence de gfp-expression (carte thermique) dans M1- et M2-polarisé macrophages obtenus à partir de différentes sous-portes. (C) Moyenne géométrique de l’intensité de fluorescence (IMF) est montrée dans les histogrammes d’un donneur représentatif après 4 h d’infection de VTT. Les valeurs de l’IMF dans les cellules M1 (bleu clair) et M2 non infectées (violet clair) sont présentées dans le panneau supérieur et les cellules M1 (bleu profond) et M2 (violet profond) infectées par le VTT sont présentées dans le panneau inférieur. (D) Des images confocales représentatives de cellules polarisées M1 et M2 non infectées et infectées par le VTT sont montrées. Les cellules M1 et M2 ont été tachées pour l’expression CD64 et CD163, respectivement, utilisant l’immunofluorescence. La coloration positive de surface est montrée dans les bactéries intracellulaires rouges et GFP-exprimant est montrée en vert. Les noyaux tachés de DAPI sont représentés en couleur bleue. Échelle – 10 μm. Le grossissement des images vers la droite est de 350x. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.

Figure 4 : Réduction de la dimensionnalité avec approximation et projection multiples uniformes (UMAP) et analyse phénographique des cellules M1 et M2 non infectées et infectées par le vtt. (A) UMAP, créé en concatenating 11000 cellules vivantes à partir de cultures cellulaires M1 et M2 non infectées et infectées par le VTT à partir de deux donneurs de sang représentatifs, 4 h (graphiques gauches) ou 24 h (graphiques de droite) après l’infection. La carte thermique pour l’expression GFP (panneau inférieur) indique les cellules non infectées et infectées par le vtt. (B-C) IMF des marqueurs exprimés dans les cellules M1 et M2 non infectées et infectées par le VTT 24 h après l’infection, montrées comme (B) heatmap ou (C) parcelles de barre. (D-F) L’analyse phénographique a permis d’identifier 24 grappes qui sont réparties différemment entre les cultures M1 et M2 non infectées et infectées par le vtt. Les grappes 8 à 13 sont uniques dans les cellules M1 non infectées, les grappes 1 à 7 sont uniques dans les cellules M1 infectées par le vtt, les grappes 20 à 24 sont uniques dans les cellules M2 non infectées et les grappes 14 à 19 sont uniques dans les cellules M2 infectées par le VTT. L’IMF de chaque marqueur de chaque groupe phénographique est affichée dans (F). Les données sont présentées sous forme de cellules M1 (bleu clair) et M2 non infectées (violet clair) et M1 (bleu profond) et M2 (violet foncé). S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Tableau 1 : Liste des anticorps utilisés pour la cytométrie d’écoulement.
| laser | filtre | Fluorochrome | phénotype | fonction | clone | Catalogue no. | compagnie |
| 639 | 670/30 | AF647 (af647) | TLR2 (en) | Récepteur de reconnaissance des pathogènes | TL2.1 (en) | 309714 | BioLegend (BioLegend) |
| 639 | 780/60 | APC-Cy7 (en) | CD206 (EN) | Récepteur Mannose | 15-2 | 321120 | BioLegend (BioLegend) |
| 405 | 610/20 | BV605 (BV605) | CD163 (EN) | Récepteur charognard | IGS/61 | 333616 | BioLegend (BioLegend) |
| 405 | 670/30 | BV650 (BV650) | CD80 (en) | Molécule co-stimulante | 2D10 (2D10) | 305227 | BioLegend (BioLegend) |
| 405 | 710/50 | BV711 (en) | CCR7 (en) | Récepteur de chimiokine | G043H7 | 353228 | BioLegend (BioLegend) |
| 405 | 780/60 | BV785 (BV785) | CD86 (en) | Molécule co-stimulante | IT2.2 (en) | 305442 | BioLegend (BioLegend) |
| 488 | 530/30 | GFP (GFP) | VTT | Bactéries intracellulaires | | | |
| 561 | 586/15 | Pe | CD200R | Récepteur inhibiteur | OX-108 (OX-108) | 329306 | BioLegend (BioLegend) |
| 561 | 620/14 | PE/ÉBLOUISSEMENT 594 | CD64 (en) | Fc gamma receptor-I d’IgG | 10.1 | 305032 | BioLegend (BioLegend) |
| 561 | 661/20 | PE-Cy5 (PC5) | HLA-DR | Molécule de classe II du MHC | L243 (L243) | 307608 | BioLegend (BioLegend) |
| 355 | 450/50 | BUV395 (BUV395) | Colorant de viabilité | Marqueur de cellules vivantes/mortes | Zombie UV | 423108 | Invitrogen (Invitrogen) |