Les principales étapes de la méthode décrites pour obtenir une suspension unicellulaire de leucocytes utérins sont résumées à la figure 3. La figure 2B illustre la stratégie de base de contrôle du FACS utilisée pour l’identification de trois sous-ensembles d’ILC g1 chez les souris B6 : les cellules uILC1 (CD49a+Eomes-), trNK (CD49a+Eomes+) et cNK (CD49a-Eomes+). Une analyse plus approfondie de ces populations peut être effectuée pour étudier divers marqueurs de surface et intracellulaires des ILC g1. À titre d’exemple, la coexpression des récepteurs IFN-ɣ et auto-CMH peut être évaluée dans les cellules uILC1, trNK et cNK après stimulation avec un anticorps anti-NK1.1 (Figure 7).
Selon la question de recherche, le protocole (Figure 3) et le panel d’anticorps peuvent être adaptés. Il est important de noter qu’il est recommandé d’utiliser à la fois des anticorps anti-NK1.1 et anti-NKp46 dans un panel FACS pour le contrôle de l’ILC g1 (Figure 2B et Tableau 1). Il convient de noter que les ILC g1 obtenus à partir du sang, de la rate ou du foie ont une expression plus élevée de NKp46 à leur surface que leur homologue utérin (Figure 8). La coloration de surface pour NK1.1 donne une meilleure séparation et permet de fermer facilement les ILC g1 utérins (Figure 8). Bien que NKp46 soit exprimé par toutes les souches de souris, l’antigène NKR-P1C reconnu par l’anticorps anti-NK1.1 PK136 n’est exprimé que par certaines souches de souris, y compris C57BL/6 (c.-à-d. B6), FVB/N et NZB, mais pas dans AKR, BALB/c, CBA/J, C3H, DBA/1, DBA/2, NOD, SJL ou 129. De plus, si l’investigateur a l’intention d’étudier des récepteurs cruciaux des cellules NK tels que les récepteurs Ly49 du CMH, il est important d’être conscient des variations alléliques dans les souches de souris de laboratoire, qui récapitulent la grande variabilité des récepteurs de type immunoglobuline des cellules tueuses humaines (KIR). De plus, si les cellules doivent être stimulées avec NK1.1 pour un test fonctionnel, comme décrit dans Kim, S. et al.20, il pourrait être souhaitable de colorer les cellules avec anti-NKp46 plutôt qu’anti-NK1.1, car l’antigène NKR-P1C peut être occupé par l’anti-NK1.1 réticulant ou une régulation négative du récepteur peut suivre la stimulation. L’occupation des récepteurs ou la régulation négative peuvent empêcher la coloration avec le même anticorps utilisé pour stimuler.
Un problème courant avec la dissociation des tissus enzymatiques est l’altération des épitopes de surface sur les cellules par des enzymes utilisées pour un milieu de digestion. Par exemple, la coloration du récepteur CD94:NKG2A du CMH est mauvaise si Liberase TM est utilisée. Cependant, la digestion avec Liberase DH préserve la reconnaissance NKG2A par clone d’anticorps 16A11 (Figure 9). Il est recommandé de vérifier l’influence des enzymes sur tous les épitopes du panel FACS. À cette fin, utilisez la suspension de splenocytes de souris obtenue par dissociation mécanique (passage de toute la rate à travers une passoire de 70 μm). L’échantillon est ensuite divisé en deux parties ou plus suivies d’une incubation avec un milieu avec ou sans enzyme(s).
Comme mentionné précédemment, les cellules dérivées du sang sont présentes dans les échantillons de tissus dissociés. Si nécessaire, les contaminants sanguins peuvent être exclus en utilisant une méthode de coloration intravasculaire telle que développée dans le laboratoire Masopust21. La figure 10 montre qu’environ 6,5 % des ILC g1 présents dans les échantillons de tissu utérin au jour de gestation 8,5 sont d’origine sanguine. Les anticorps anti-CD45 utilisés pour la coloration intravasculaire peuvent être conjugués avec un fluorochrome utilisé pour un canal de décharge; cela exclura les contaminants sanguins sans utiliser de canal de fluorescence supplémentaire. Les problèmes les plus courants et leurs solutions sont présentés dans le tableau 2.

Figure 1 : Coupe transversale d’un utérus de souris. (A) Coupe transversale de l’utérus de la souris (non enceinte) indiquant une variété de leucocytes maternels qui peuplent l’utérus. (B) Coupe transversale de l’utérus de la souris (jour de gestation 8.5). (C) Coupe transversale de l’utérus de la souris (jour de gestation 13,5). (D) Comparaison de la formation de placenta chez la souris par rapport à la formation de placenta humain à partir du stade de blastocyste. Images créées avec BioRender.com. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Sous-populations d’ILC1 g1 utérin. (A) Pourcentages de cNK utérin, ILC1 et trNK chez la souris au début de la vie et de la grossesse. W - semaines, gd - jour de gestation. Graphique modifié de Filipovic, I. et al.4. (B) Stratégie de contrôle pour analyser les sous-ensembles d’ILC du groupe utérin 1 par cytométrie en flux. Les lymphocytes ont été isolés des tissus utérins au jour de gestation 10,5. La digestion des tissus a été réalisée à l’aide d’un milieu de digestion contenant Liberase TM. Les cellules étaient fermées en fonction de leur capacité à diffuser la lumière. Les doublets ont été exclus à l’aide d’un diagramme FSC-A par rapport au FSC-H, et seules les cellules viables CD45+CD3-CD19 ont été analysées plus avant. Dans les cellules viables CD45+CD3-CD19-, la porte ILC du groupe 1 a été identifiée comme étant des cellules NK1.1+ NKp46+. Dans les ILC du groupe 1, trois sous-ensembles peuvent être identifiés : les cellules NK conventionnelles CD49a-Eomes+ (cNK), les cellules NK tissulaires CD49a+Eomes+ (trNK) et les cellules CD49a+Eomes-uILC1. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Guide visuel des principales étapes du protocole. (1) Disséquer l’utérus enceinte exempt de graisse mésométriale. (2) Enlever les fœtus; renvoyer l’utérus dans le tube de 5 mL et hacher le tissu. Passez à l’étape de digestion enzymatique : ajoutez 3 mL de mélange chaud de digestion enzymatique à chaque échantillon. Incuber les tubes de 5 mL pendant 30 min à 37 °C avec agitation. (3) (i) Après digestion, rincer le tout des tubes de 5 mL dans des tubes de 15 mL à l’aide de 10 mL de solution glacée de 5 mM d’EDTA PBS. ii) Centrifuger des tubes de 15 mL contenant des tissus digérés pendant 10 min à 400 x g. iii) Jeter le surnageant; agiter délicatement la pastille et la remettre en suspension dans 10 mL de solution chaude (37 °C) 5 mM EDTA PBS. (iv) Incuber les échantillons dans les tubes de 15 mL à 37 °C avec agitation, pendant 15 min. (4) À l’aide du piston d’une seringue stérile de 1 mL, forcer le tissu digéré à travers une passoire de 70 μm sur un tube de 50 mL correctement marqué et stérile, et tourner pendant 10 min à 400 x g. (5) Après la rotation, procéder à l’option A (représentée ici dans les diagrammes) ou B. Option A: jeter le surnageant du tube de 50 mL et, à l’aide d’un pipet boy, remettre en suspension chaque pastille dans 8 mL de Percoll isotonique à 40% (v / v) dans PBS. (6) i) L’option A s’est poursuivie : À l’aide d’un pipet boy à vitesse lente, superposer soigneusement les granulés remis en suspension dans une solution à 40 % de Percoll sur la solution à 5 mL de Percoll à 80 %. Pipette lentement et continuellement; maintenir le tube de 15 mL à un angle de 45°. (ii) Sans perturber la superposition, centrifuger les tubes de 15 mL à 850 x g pendant 20 min à température ambiante, avec une accélération moyenne et une rupture lente. (7) Après la rotation, tout en essayant d’aspirer une quantité minimale de solution de Percoll (jusqu’à 4-5 mL au total), prélèvez soigneusement l’anneau de leucocytes. (8) Effectuer des étapes de lyse des globules rouges. (9) Cellule de comptage à l’aide de bleu de trypan et d’une chambre de Neubauer. (10) Transférer 1 à 2 millions de cellules par puits dans une plaque de 96 puits à fond rond. (11) Procéder à la coloration du colorant de viabilité et des anticorps. (12) Enfin, transférer les échantillons dans des tubes FACS étiquetés. Conservez les tubes sur de la glace ou au réfrigérateur jusqu’à ce qu’ils soient traités avec l’analyse FACS dans les 24 heures. Images créées avec BioRender.com. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 4: Bouchon vaginal (A) et absence de bouchon (B) chez les femelles C57BL/6 à 0,5 jour après l’accouplement. Veuillez cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

Figure 5: Dissection pour extraire l’utérus d’une souris enceinte. (A) La mère est fixée avec des aiguilles sur une planche souple pour essuyer le corps avec de l’éthanol à 70%. Deux incisions verticales sont pratiquées, comme l’indiquent les lignes pointillées bleues. (B) La peau est soulevée pour exposer les organes internes. Les boucles intestinales sont doucement déplacées vers le haut pour visualiser l’utérus. (C) L’utérus est échantillonné en coupant en trois points: à côté des ovaires et au niveau du col de l’utérus, comme l’indiquent respectivement les deux lignes pointillées bleues et la flèche bleue. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 6: Préparation d’une suspension unicellulaire. (A) Retrait mécanique des embryons de leur site d’implantation. B) Superposition de gradient percoll; la couche supérieure contient la suspension monocellulaire dans 40% de Percoll et la couche inférieure dans 80% de Percoll. (C) Formation de l’anneau lymphocytaire après centrifugation du gradient de percoll. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 7 : Analyse représentative du TESTA du test fonctionnel avec les ILC du groupe 1. Détection intracellulaire de l’IFN-ɣ et du CD107a de surface dans les ILC du groupe 1 exprimant des récepteurs NK pour l’auto-CMH (Ly49C, Ly49I et NKG2A) par rapport à ceux qui ne le font pas, après réticulation de NK1.1 avec des anticorps liés aux plaques. Les cellules ont été isolées des tissus utérins au jour de gestation 9,5. La digestion des tissus a été réalisée à l’aide d’un milieu de digestion contenant de la libérase DH. Les valeurs brutes des quatre quadrants (coins) ainsi que le pourcentage relatif de répondeurs parmi les cellules exprimant des récepteurs pour soi et les répondeurs qui n’ont pas d’auto-récepteurs (chiffres gras) sont montrés. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 8 : Coloration des lymphocytes spléniques et utérins avec des anticorps anti-NKp46 et anti-NK1.1. (A) Les suspensions cellulaires obtenues à partir de la rate de souris et de l’utérus (B) au jour de gestation 10,5 ont été séparées en deux; une partie a été colorée avec NKp46-APC (rouge) et l’autre avec NK1.1-APC (bleu). Notez que la coloration NKp46 des lymphocytes utérins ne sépare pas les cellules NKp46+ et NKp46- aussi proprement que les lymphocytes spléniques. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 9 : Diminution de l’IFM NKG2A (clone d’anticorps : 16A11) par incubation avec milieu de digestion. La suspension cellulaire des splenocytes de souris C56BL/6 a été divisée en trois parties. Une partie a été incubée dans un milieu de digestion Liberase DH (HBSS contenant 0,13 WU/mL Liberase DH et 30 μg/mL de DNAse), et une autre partie a été incubée avec un milieu de digestion Liberase TM (HBSS contenant 0,52 WU/mL Liberase TM et 30 μg/mL de DNAse). La troisième partie a été traitée avec du HBSS pur pendant 30 min à 37 °C. L’expression du marqueur NKG2A sur les ILC g1 a été évaluée par cytométrie en flux. Graphique tiré de Shreeve N. Le rôle de l’inhibition utérine des cellules NK pendant la grossesse (thèse); Superviseur : Colucci F, 2020. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 10 : Coloration intravitale avec des anticorps anti-CD45 pour l’exclusion des ILC g1 d’origine sanguine. Une souris mère C57BL/6 au jour de gestation 8,5 a été éliminée 3 min après injection intraveineuse avec 3 μg de CD45-AF647. L’utérus, le sang total et le thymus ont été récoltés et traités pour l’analyse FACS. L’axe X montre le signal de la coloration intraveineuse avec CD45-AF647, et l’axe Y montre le signal de CD45-BUV395 coloré in vitro. Les pourcentages de sous-populations sont indiqués en quadrants. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
| Anticorps / Colorant | Clone | Fluorochrome | Laser |
| 1 (Canal de vidage) | Zombie Violet Fixable Viability colorant | | | Violet |
| CD19 | 1D3 | BV421 |
| CD3 | 145-2C11 | BV421 |
| 2 | CD45 | 30-F11 | Le | Bleu |
| 3 | NK1.1 | PK136 | BV605 | Violet |
| 4 | NKp46 | 29A1.4 | APC | Rouge |
| 5 | CD49a | Ha31/8 | BUV395 | Ultraviolet |
| 6 | EOMES | Dan11mag | PE | Vert |
Tableau 1 : Un exemple de panneau FACS pour cytomètre conventionnel à 5 lasers.
| Problème | Cause possible | Suggestion |
| L’anneau cellulaire n’est pas visible à l’interface de deux solutions percoll | Mauvaise stratification de la solution de percoll ou mélange de deux couches lors de la manipulation de l’échantillon | Prenez des précautions supplémentaires pour ne pas casser le coussin de 80% par percoll lors de la superposition. Faites attention lors de la manipulation de l’échantillon : ne pas déranger l’interface percoll |
| Faible nombre de leucocytes (par exemple, lors de l’utilisation d’un utérus non enceinte) | L’interface peut être vue même lorsque le numéro de cellule à l’interface est très bas. Même si l’anneau n’est pas visible, collectez le liquide entre 40% et 80% de solutions percoll, car il pourrait encore y avoir suffisamment de cellules pour un traitement ultérieur. |
| Lyse incomplète des globules rouges | Les cellules n’ont pas été remises en suspension correctement dans le tampon de lysage | Pipetter les cellules de haut en bas pour briser les amas et remettre complètement en suspension les cellules dans un tampon de lysage |
| La solution de lysage est froide | Équilibrer la solution de lysage à la température ambiante avant utilisation |
| Prolongez le temps d’incubation avec la solution de lysage jusqu’à 15min |
| L’étape de lyse des globules rouges peut être répétée |
| Faible rendement cellulaire | Mauvaise digestion enzymatique | Vérifiez si les enzymes ne sont pas périmées et ont été stockées conformément à leurs manuels |
| Perte de cellules pendant les étapes de lavage | Inspectez la pastille de cellule après chaque étape de lavage : la pastille opaque au fond du puits après l’essorage. L’utilisation de plaques à fond en V au lieu de plaques à fond en U, d’une centrifugeuse à rotor oscillant, d’un temps de centrifugation plus long peut réduire la perte de cellules |
| L’échantillon de tissu contient un faible nombre de lymphocytes (par exemple, lors de l’utilisation d’un utérus non enceinte) | Regrouper plusieurs utérus pour obtenir suffisamment d’événements pour l’analyse. Envisagez d’utiliser l’option B du protocole pour l’isolation cellulaire |
| Grande variabilité du nombre absolu de leucocytes obtenus à partir de souris du même groupe | Collecte incohérente de cellules à l’interface de solutions à 40 % et 80 % de percoll | Assurez-vous de collecter la fraction de cellule entière sur l’interface percoll. Envisagez d’utiliser l’option B du protocole pour l’isolation cellulaire |
| Incapacité de détecter les sous-populations/marqueurs lymphocytaires attendus ou une IMF anormalement faible pour certains marqueurs de surface cellulaire | La digestion enzymatique affecte l’expression superficielle de certains épitopes ou leur dégradation | Optimiser la digestion enzymatique en modifiant : l’enzyme (par exemple en différents types de libérase ou de collagénase) et/ou la durée d’incubation et/ou la concentration enzymatique |
| Bruit de fond élevé dans le cytomètre en flux | Forte proportion de débris cellulaires ou de contamination par les globules rouges | Ajustez le paramètre de seuil FSC. Envisagez d’utiliser l’option A du protocole pour l’isolation cellulaire |
Tableau 2 : Guide de dépannage.