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Article de méthode

Enrichissement de vésicules extracellulaires dérivées d’astrocytes à partir de plasma humain

3.5K vues

DOI :

10.3791/64107

3 août 2022

Dans cet article

Résumé

Ce protocole décrit l’enrichissement des vésicules extracellulaires dérivées d’astrocytes (VEAD) à partir de plasma humain. Il est basé sur la séparation des VE par précipitation de polymère, suivie d’une immunocapture des VEDA basée sur l’ACSA-1. L’analyse des VEDA peut fournir des indices pour étudier les changements dans les voies inflammatoires de patients vivants, de manière non invasive par biopsie liquide.

Résumé

Les vésicules extracellulaires (VE) sont des nanoparticules biologiques sécrétées par toutes les cellules pour la communication cellulaire et l’élimination des déchets. Ils participent à un large éventail de fonctions en agissant et en transférant leurs cargaisons à d’autres cellules dans des conditions physiologiques et pathologiques. Compte tenu de leur présence dans les biofluides, les VE représentent une excellente ressource pour l’étude des processus pathologiques et peuvent être considérées comme une biopsie liquide pour la découverte de biomarqueurs. Un aspect intéressant de l’analyse des VE est qu’ils peuvent être sélectionnés en fonction des marqueurs de leur cellule d’origine, reflétant ainsi l’environnement d’un tissu spécifique dans leur cargaison. Cependant, l’un des principaux handicaps liés aux méthodes d’isolement des VE est le manque de consensus méthodologique et de protocoles standardisés. Les astrocytes sont des cellules gliales qui jouent un rôle essentiel dans le cerveau. Dans les maladies neurodégénératives, la réactivité des astrocytes peut entraîner une altération de la cargaison EV et une communication cellulaire aberrante, facilitant / améliorant la progression de la maladie. Ainsi, l’analyse des VE des astrocytes peut conduire à la découverte de biomarqueurs et de cibles potentielles de maladies. Ce protocole décrit une méthode en 2 étapes d’enrichissement des VE dérivées d’astrocytes (VED) à partir de plasma humain. Tout d’abord, les VE sont enrichis à partir de plasma défibriné par précipitation à base de polymères. S’ensuit l’enrichissement des VEDA par immunocapture basée sur ACSA-1 avec des microbilles magnétiques, où les VE remis en suspension sont chargés sur une colonne placée dans un champ magnétique. Les véhicules électriques ACSA-1+ marqués magnétiquement sont conservés dans la colonne, tandis que les autres véhicules électriques circulent. Une fois la colonne retirée de l’aimant, les ADEV sont élués et sont prêts à être stockés et analysés. Pour valider l’enrichissement des marqueurs astrocytaires, la protéine acide fibrillaire gliale (GFAP), ou d’autres marqueurs astrocytaires spécifiques d’origine intracellulaire, peuvent être mesurés dans l’éluat et comparés à l’écoulement. Ce protocole propose une méthode simple et rapide pour enrichir les ADEV à partir de plasma qui peut être utilisée comme plate-forme pour examiner les marqueurs pertinents pour les astrocytes.

Introduction

Les vésicules extracellulaires (VE) sont un groupe hétérogène de nanoparticules membraneuses sécrétées par tous les types de cellules, transportant des protéines, des lipides et des acides nucléiques1. Les microvésicules (100-1000 nm), les exosomes (30-100 nm) et les corps apoptotiques (1000-5000 nm) constituent les principaux types de VE, qui se distinguent par leur site d’origine 2,3. Les VE régulent des processus physiologiques importants, tels que la présentation de l’antigène et les réponses immunitaires4, le recyclage des r....

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Protocole

La recherche décrite dans ce protocole a été menée avec des échantillons de plasma humain provenant de donneurs adultes en bonne santé des deux sexes (tranche d’âge 65,9-81,3 ans, 45,5 % de femmes), de la cohorte de l’Initiative de Sant Pau sur la neurodégénérescence (SPIN), Barcelone, Espagne36. Les participants ont donné leur consentement éclairé. L’étude a été menée conformément aux directives éthiques internationales pour la recherche médicale contenues dans la déclaration d’Helsinki et la loi espagnole. Le Comité d’éthique de la recherche de Sant Pau (CEIC) a examiné et approuvé le protocole de collecte et de stockage des échantillons de p....

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Résultats

L’isolement des VEDA à partir de plasma prélevé sur des donneurs sains a été réalisé avec succès. Une méthode de précipitation à base de polymères a été utilisée pour obtenir la fraction totale de VE, suivie d’une immunocapture avec des microbilles magnétiques pour obtenir des VED.

L’analyse par transfert Western de la fraction totale de VE avant l’étape d’immunocapture a indiqué l’absence de calnexine (marqueur de contamination cellulaire) et la présence d’Alix et de la protéine transmembrana.......

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Discussion

Les VE ont suscité un fort intérêt dans la recherche biomédicale en raison de leur potentiel diagnostique et thérapeutique. Actuellement, l’un des principaux handicaps liés aux méthodes d’isolement des VE est l’absence de consensus méthodologique et de protocoles standardisés. Cette étude fournit un protocole détaillé pour l’enrichissement des VE astrocytaires à partir du plasma humain par précipitation à base de polymères et immunocapture BLAST.

Il e.......

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Déclarations de divulgation

Le Dr Belbin a déclaré avoir reçu des honoraires personnels d’ADx NeuroSciences en dehors des travaux soumis. Le Dr Alcolea a déclaré avoir reçu des honoraires personnels pour des services au sein d’un conseil consultatif et/ou des honoraires de conférencier de Fujirebio-Europe, Roche, Nurtricia, Krka Farmacéutica, Zambon S.A.U. et Esteve en dehors du travail soumis. Le Dr Lleó a été consultant ou membre de conseils consultatifs pour Fujirebio-Europe, Roche, Biogen, Grifols et Nutricia en dehors des travaux soumis. Le Dr Fortea a déclaré avoir reçu des honoraires personnels pour ses services au sein des conseils consultatifs, des comités de sélection ou des honoraires de conférencier d’AC Immune, de Novartis, de Lundbeck, de Roche, de Fujirebio et de Biogen en dehors du travail soumis. Les Drs Alcolea, Belbin, LLeó et Fortea déclarent détenir un brevet pour des marqueurs de synaptopathie dans les maladies neurodégénératives (sous licence ADx, EPI8382175.0). Aucune autre divulgation n’a été signalée. Tous les autres auteurs n’ont rien d’autre à divulguer.

Remerciements

Les auteurs tiennent à remercier Soraya Torres, Shaimaa El Bounasri El Bennadi et Oriol Sanchez Lopez pour la manipulation et la préparation des échantillons. Nous tenons également à souligner la collaboration de José Amable Bernabé, de l’ICTS « NANBIOSIS », unité 6 (Unité de CIBER en Bioingénierie, Biomatériaux et Nanomédecine) de l’Institut de Science des Matériaux de Barcelone, Marti de Cabo Jaume de l’Unité de Microscopie Electronique de l’Universitat Autonoma de Barcelone, Dr. Marta Soler Castany et Lia Ros Blanco de la Plateforme de Cytométrie en Flux de l’Institut de Recherche Biomédicale de Sant Pau (IIB-Sant Pau), ainsi que ....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Anticorps primaire anti-Alix pour le Western blotEMD MilliporeABC40
µ ; Séparateur MACSMiltenyi Biotec130-042-602Le µ ; Le séparateur MACS est utilisé en combinaison avec µ ; Colonnes et microbilles MACS.
Anticorps primaire anti-calnexine pour le Western blotGenetexGTX109669
Anticorps primaire anti-CD9 pour le Western blotCell Signaling13174
Blocker BSA (10 %) 200 mLThermo Fisher37525
Bransonic 1510E-MT Bain à ultrasonsBranson
COBAS 6000 autoanalyzerRoche DiagnosticsAnalyseur pour la détermination immunoturbidimétrique de l’ApoB ; autoanalyseur commercial
cOmplete Protease Inhibitor Cocktail (sans EDTA)Roche11873580001
Micrograph numérique 1.8  ;logiciel de micrographie
: PBS de Dulbecco, sans Mg++, sans Ca++, 500 mLThermo Fisher14190144
EveryBlot, Blocking BufferBioRad12010020
Exoquick (solution de précipitation d’exosomes, 5 mL) + Thrombin  ;System BioscienceEXOQ5TM-1ExoQuick 20 mL peut également être acheté (EXOQ20A-1)
Gatan 895 USC 4000  ;caméra
GeneGnome XRQ système d’imagerie par chimiluminescenceSyngene
Antigène humain CD81 (CD81) Kit ELISACusabioCSB-EL004960HU
Mort cellulaire programmée humaine Protéine interagissant à 6 (PDCD6IP) Kit ELISACusabioCSB-EL017673HU
Immun-Blot Membrane PVDFBioRad1620177
Microscope électronique à transmission JEOL 2011JEOL LTDEquipé de  ; une caméra CCD Gatan 895 USC 4000 (Gatan 626, Gatan, Pleasanton, États-Unis)
Lavande EDTA BD Vacutainer K2E tubesBecton dickinson367525
Leica EM GP  ;Congélateur plongeant professionnelLeica Microsystem
Microtubes à faible reliure 1,5 mLDeltalab4092.3NS
MACS µ ; Colonnes avec pistons  ;Miltenyi Biotec130-110-905µ ; Les colonnes avec pistons sont spécialement conçues pour l’isolement des exosomes des fluides corporels
MACS MultistandMiltenyi Biotec130-042-303
Lecteur de plaques MAGPIXLuminex Corporation80-073Unité de multiplexage xMAP de Luminex (logiciel Luminex xPonent v 4.3)
MicroBead Kit100 &mu ; L Anti-GLAST (ACSA-1)-Biotine, humain, souris, rat &ndash ; petite taille ; 100 &mu ; L Microbilles anti-biotineMiltenyi Biotec130-095- 825
MILLIPLEX MAP Kit Panneau de cytokines/chimiokines/facteurs de croissance Un panneau de billes magnétiquesEMD MilliporeHCYTA-60K-25
M-PER Réactif d’extraction de protéines de mammifères 25 mLThermo Fisher78503Pour certaines applications comme le Western blot, des tampons de lyse plus agressifs peuvent être utilisés (par exemple RIPA)
MultiSkan SkyHigh Spectrophotomètre à microplaquesThermofisherA51119500C
NanoSight NS300Malvern PanalyticalNTA ; 3.4 version
Pierce Halt Protéase et inhibiteur de phosphatase CocktailThermo Fisher78441
Seringue en polypropylène (G29)PeroxFarmaSeringue 1mL ; 0.33x12mm-G29x1/2"
Secondaire anti-lapin anticorpsThermo Fisher10794347
Simoa GFAP Discovery KitQuanterix102336
Simoa, instrument SR-XQuanterixSR-X Système de détection de biomarqueurs ultra-sensibles ; technologie de détection de biomarqueurs commerciale
Test de protéines spécifiques Apolipoprotéine B - APOB (100 det) COBAS C/CIRoche Diagnostics3032574122
SuperSignal West FemtoThermo Fisher34095Substrat HRP ultra-sensible à chimiluminescence améliorée (ECL)  ;
Système de transfert turbo Trans-BlotBioRad1704150
, , ,

Références

  1. Pathan, M., et al. Vesiclepedia 2019: a compendium of RNA, proteins, lipids and metabolites in extracellular vesicles. Nucleic Acids Research. 47, 516-519 (2019).
  2. Raposo, G., Stoorvogel, W. Extracellular vesicles: Exo....

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Réimpressions et autorisations

Mots-clés

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