Dans ce travail, des expériences de cellules 2D et 3D ont été menées pour déterminer la CI50 pour les formes LMB002 « fermées en anneau » et « ouvertes en anneau » (voir Figure 1) à différents moments d’incubation. Ces valeurs ont été comparées à celles obtenues pour le peptide prototype, la gramicidine S (utilisé comme témoin positif). Un ensemble typique d’images de l’incubation dans une culture LLC cultivée en 2D après coloration est illustré à la figure 5. La cocoloration avec Hoechst 33342 (bleu) et l’iodure de propidium (rouge) résultant en différentes nuances de violet dans une plus grande fraction de cellules dans le cas d’un traitement sous forme « ouverte en anneau » par rapport à « fermée en anneau » indique une différence notable de cytotoxicité entre deux formes qui peut facilement être quantifiée. L’exemple démontré d’une expérience réussie est basé sur les données recueillies à l’aide du format de plaque à 96 puits, où les variantes peptidiques à différentes concentrations ont été ajoutées, comme le montre la figure 2. Des données similaires peuvent être acquises avec des plaques à 384 puits et à haute densité. Cependant, étant donné que les volumes par puits sont réduits, les erreurs techniques et systématiques et, par conséquent, la précision de la détermination IC50 diminueront avec l’augmentation de la densité du puits.

Figure 5 : Images représentatives de l’essai de cytotoxicité dans la LLC cultivée en monocouche. Les cellules ont été colorées avec Hoechst 33342 (bleu) et de l’iodure de propidium (rouge). Les temps indiqués : 10 min, 60 min, 24 h et 72 h sont des temps d’incubation avec des composés. Barres d’échelle = 50 μm. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
La photoconversion de LMB002 par irradiation à la lumière laser dans un tissu modèle - hachis de porc frais - a été déterminée à l’aide d’un échantillon composé de viande hachée mélangée à la forme LMB002 « fermée à anneau » (inactive) dissoute dans du PBS et en mesurant la conversion de cette forme inactive en forme LMB002 « à anneau » (activée) dans le sens de la propagation par rayonnement. L’échantillon a été placé dans une seringue et irradié d’un côté avec un faisceau plat de rayonnement laser pendant la durée d’exposition de ~10 min (habituellement utilisé dans les expériences in vivo ), comme le montre la figure 3. Après l’exposition, le cylindre d’échantillon a été divisé en parties en appuyant sur le piston de la seringue et en coupant les tranches de la même hauteur avec un scalpel. La concentration de LMB002 « ring-open » dans les extraits des tranches a été déterminée par HPLC RP.
La figure 6 illustre les courbes dose-effet obtenues par la figure 6A-D à partir de l’analyse des données. Pour identifier le pourcentage de cellules mortes avec co-coloration nucléaire de colorants Hoechst 33342 et PI, nous avons utilisé un outil de classification intégré qui définit des seuils numériques à des paramètres mesurés sélectionnés pour diviser tous les nombres de cellules en plusieurs catégories. Par exemple, lorsque le signal du canal rouge (iodure de propidium) dans le témoin était au seuil (environ 110-130 unités), les cellules pouvaient être classées comme PI-positives, considérées comme mortes, ou PI-négatives, considérées comme non affectées par les composés. Pour LMB002, on peut observer des dépendances sigmoïdales du pourcentage de cellules à iodure de propidium positif sur la concentration du composé. À partir de ces données, les valeurs IC50 peuvent être déterminées.

Figure 6 : Analyse de la cytotoxicité en culture 2D. Sigmoïde s’adapte comme on l’a obtenu dans la culture LLC pendant (A) 10 min, (B) 60 min, (C) 24 h et (D) 72 h-temps intervalles pris pour l’incubation avec des composés. Le raccord permet de déterminer avec précision les valeurs IC50 (non représentées). Les barres d’erreur sont SEM. Abréviations : LLC = carcinome pulmonaire de Lewis; PI = iodure de propidium. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Compte tenu des valeurs obtenues de CI50 , nous pouvons conclure que la toxicité des trois composés a augmenté avec le temps d’incubation. Notre expérience a révélé que la forme « à anneau » de LMB002 est environ une étape de dilution moins toxique que le peptide prototype, la gramicidine S. Alors que la forme « fermée à anneau » présente trois à quatre étapes de dilution une toxicité inférieure, qui augmente avec le temps d’incubation. La différence entre les deux étapes de dilution n’est pas affectée par l’augmentation du temps d’incubation et peut être utilisée numériquement comme fenêtre photothérapeutique6 déterminée expérimentalement pour la comparaison avec d’autres composés dans un criblage de bibliothèque potentiel. La valeur IC50 pour la gramicidine S a été définie comme point de référence pour corriger les erreurs expérimentales ou les sorties différentielles dans les répétitions biologiques.
Les expériences de cellules 3D ont produit le même type de données brutes - les images sphéroïdes résolues par une seule cellule. L’inclusion de calcéine comme troisième colorant colorant permet de quantifier la fraction de cellules métaboliquement actives (observée dans le canal vert). En utilisant des plaques de 384 puits, en augmentant le nombre de répétitions techniques, en excluant les points de temps de co-incubation redondants et en modifiant le pli de dilution, nous avons pu comparer directement plusieurs composés en un seul essai (en utilisant une seule plaque), comme illustré dans la carte des plaques de la figure 7.

Figure 7 : Carte des plaques pour l’expérience de culture 3D avec deux composés. Les codes de couleur pour les composés et le contrôle sont indiqués. Les nombres dans les puits sont des concentrations en μM. 10 min, 24 h et 72 h sont des temps d’incubation. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
La figure 8 montre les images de répliques techniques sélectionnées de sphéroïdes LLC cultivés à une densité de 1 sphéroïde/puits en présence de composés testés et de sphéroïdes témoins capturés après coloration.

Figure 8 : Images représentatives du test de cytotoxicité en culture 3D. Les images montrent des sphéroïdes LLC âgés de 48 h colorés avec Hoechst 33342 (bleu), calcéine AM (vert) et iodure de propidium (rouge) après 10 min, 24 h et 72 h de co-incubation avec les photoformes LMB002 et la gramicidine S. Barres d’échelle = 100 μm. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
À l’aide du logiciel de l’instrument, les courbes dose-effet, comme celles de l’expérience 2D, ont été obtenues à partir des piles d’images empilées en z (Figure 9A). De plus, les sphéroïdes compacts et non déformés dans les cultures 3D pourraient être caractérisés par le diamètre du sphéroïde entier (Figure 9B). Il a également été noté que le diamètre global du sphéroïde varie avec la concentration du composé.

Figure 9 : Évaluation de la cytotoxicité avec des cultures 3D. (A) Courbes d’ajustement de cytotoxicité dépendantes de la concentration et (B) tracés de diamètre de sphéroïde dépendants de la concentration obtenus dans les cultures 3D de LLC co-incubées avec la gramicidine S pendant 10 min, 24 h et 72 h et capturées avant coloration. Les barres d’erreur sont SEM. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
L’expérience de l’étape 2 permet de déterminer les concentrations de LMB002 dans les deux photoformes en utilisant la chromatographie liquide haute performance détectée par UV. L’efficacité de la photoconversion dans les tissus modèles a été facilement évaluée et quantifiée à l’aide de cette configuration (Figure 3). Les données ont été obtenues à partir de l’analyse quantitative des chromatogrammes des extraits d’échantillons. Dans ces expériences d’essai, les chromatogrammes LMB002 ont été détectés spectroscopiquement à 270 nm et 570 nm. À 270 nm, de nombreux signaux supplémentaires ont été observés et attribués aux composés co-extraits du tissu modèle (vérifiés à partir de l’extrait témoin sans le composé). Les deux photoformes étaient suffisamment différentes en termes de temps de rétention et d’absorbance. Cependant, le signal « d’ouverture en anneau » LMB002 était séparé de ces signaux de fond (voir un chromatogramme représentatif à la figure 10A). Par conséquent, ce signal peut être intégré sans problème. À 570 nm, les chromatogrammes ne contenaient que le signal de forme LMB002 « fermé en anneau » (Figure 10B). Ici, nous avons effectué la détermination de la concentration à l’aide de la CLHP RP. Néanmoins, une précision encore plus élevée et des limites de détection inférieures pourraient être obtenues en utilisant la LC/MS comme méthode analytique.

Figure 10 : Chromatogrammes représentatifs de LMB002 extraits de tissus modèles. (A) Échantillon à 2 mm de la surface irradiée, enregistré à 270 nm (la forme LMB002 « ring-open » est intégrée); (B) échantillon à 38 mm de la surface irradiée, enregistré à 570 nm (le pic de LMB002 « ring-closed » est intégré). Les valeurs de temps de rétention (indiquées) ont également confirmé l’identité du composé. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les données obtenues après intégration des signaux correspondants de tous les échantillons prélevés ont été utilisées pour construire les graphiques concentration-profondeur, comme le montre la figure 11. Sur la base de ces graphiques, l’efficacité de la photoconversion à différentes profondeurs du tissu modèle a été facilement évaluée. Il confirme que notre source de lumière rouge induit la photoconversion LMB002 « fermée en anneau » à une profondeur allant jusqu’à 1 c, dans le substitut tissulaire, viande hachée (à environ 103 mW/cm2).

Figure 11 : Évaluation de l’efficacité de la photoconversion. Concentration (A, mg/kg) des formes LMB002 « anneau fermé » (points bleus non activés) et « anneau ouvert » (activés, points orange) à différentes distances de la surface irradiée du tissu modèle (L, mm). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les résultats de l’expérience in vivo - étape 3 de notre méthodologie réalisée selon le calendrier présenté à la figure 4 - ont été représentés par des graphiques montrant la croissance tumorale en fonction du temps (Figure 12) et des courbes de survie de Kaplan-Meier (Figure 13).

Figure 12 : Dynamique de la croissance tumorale chez l’animal. Animaux traités avec LMB002 par rapport aux animaux traités dans le véhicule (modèle d’allogreffe LLC sous-cutanée chez la souris C57BL/6NCrl, dose composée 7 mg/kg, IV, 2 h 40 min d’incubation, puis irradiation à 650 nm, 100 mW/cm2, 20 min). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.

Figure 13 : Courbes de mortalité animale. Animaux traités avec LMB002 par rapport aux animaux traités dans le véhicule (modèle d’allogreffe LLC sous-cutanée chez la souris C57BL/6NCrl, dose composée 7 mg/kg, IV, 2 h 40 min d’incubation, puis irradiation à 650 nm, 100 mW/cm2, 20 min). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.