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Le genre Trichoderma (Ordre : Hypocreales, Famille : Hypocreaceae) est composé de champignons saprophytes omniprésents qui sont des parasites d’autres espèces fongiques et sont capables de produire une gamme d’enzymes commercialement utiles1. Ces espèces fongiques sont utilisées pour la production de protéines hétérologues2, la production de cellulose3, d’éthanol, de bière, de vin et de papier4, dans l’industrie textile5, l’industrie alimentaire6 et dans l’agriculture comme agents de lutte biologique 7,8. Outre l’intérêt industriel pour ces espèces fongiques, le nombre croissant d’infections chez l’homme a donné à certaines espèces de Trichoderma le statut d’agents pathogènes opportunistes9.
Trichoderma spp. se développe rapidement en culture, avec des colonies initialement blanches et cotonneuses qui virent au jaune verdâtre au vert foncé10. Ils sont adaptés pour vivre dans une large gamme de conditions de pH et de température, et les espèces opportunistes sont capables de survivre à des pH et des températures physiologiques et, ainsi, de coloniser différents tissus humains 11,12,13. Il est important de noter que l’augmentation du taux d’infection de Trichoderma spp. peut être associée à des facteurs de virulence, qui ne sont pas bien étudiés. De plus, les études axées sur la compréhension de la réponse immunitaire contre les espèces opportunistes de Trichoderma sont encore rares.
Lors d’une infection, avec les neutrophiles, les macrophages représentent la ligne de défense responsable de la phagocytose et, ainsi, empêchent la croissance et la colonisation des agents pathogènes dans différents tissus. À l’aide de récepteurs de reconnaissance de formes, tels que les récepteurs de type Toll et les récepteurs de lectine de type C, les macrophages phagocytent les champignons et les transforment en phagolysosomes, favorisant ainsi une explosion respiratoire, la libération de cytokines pro-inflammatoires et la destruction des micro-organismes phagocytés14. Le mécanisme de la phagocytose, cependant, peut être affecté et évité par différentes stratégies microbiennes, telles que la taille et la forme des cellules fongiques ; la présence de capsules qui entravent la phagocytose ; diminution du nombre de récepteurs induisant la phagocytose ; le remodelage de la structure des fibres d’actine dans le cytoplasme ; entravant la formation de pseudopodes ; et le phagosome ou le phagolysosome s’échappent après le processus de phagocytose14.
De nombreux agents pathogènes, y compris Cryptococcus neoformans, utilisent les macrophages comme niche pour survivre dans l’hôte, disséminer et induire l’infection15. Le test de phagocytose et de clairance est utilisé pour évaluer la réponse immunitaire contre les agents pathogènes et pour identifier les stratégies microbiennes employées pour échapper au système immunitaire inné 15,16,17. Ce type de technique peut également être utilisé pour examiner la cinétique différentielle de la phagocytose, de l’acidification retardée des phagosomes et de l’éclatement oxydatif qui entraînent une réduction de la destruction fongique18.
Différentes méthodes peuvent être utilisées pour évaluer la phagocytose, la survie fongique et l’évasion du processus de maturation des phagosomes. Il s’agit notamment de la microscopie à fluorescence, qui est utilisée pour observer la phagocytose, la localisation cellulaire et les molécules produites lors de la phagocytose19 ; la cytométrie en flux, qui fournit des données quantitatives sur la phagocytose et permet d’évaluer les différents marqueurs impliqués dans le processus20,21 ; microscopie intravitale, qui est utilisée pour évaluer la capture microbienne et la maturation des phagosomes22 ; phagocytose médiée par les anticorps, qui est utilisée pour évaluer la spécificité du processus de phagocytose d’un agent pathogène23 ; et autres 24,25,26,27.
Le protocole présenté ici utilise une méthode courante, peu coûteuse et directe utilisant un microscope optique et un test de croissance sur plaque pour évaluer la phagocytose et la destruction des conidies fongiques. Ce protocole fournira aux lecteurs des instructions étape par étape pour effectuer le test de phagocytose et de clairance à l’aide de macrophages humains dérivés de mononucléaires du sang périphérique exposés à T. stromaticum. Les PBMC ont été utilisés parce que les conidies de Trichoderma sont appliquées comme biocontrôle contre les phytopathogènes et comme biofertilisant pour les cultures végétales dans le monde entier et ont causé plusieurs infections humaines, appelées tricholodermose. En outre, il n’existe que deux travaux antérieurs portant sur l’interaction entre les conidies Trichoderma et le système immunitaire humain, dans lesquels nous avons examiné les neutrophiles28 et l’autophagie dans les macrophages29. Cet article montre d’abord comment la phagocytose des conidies de T. stromaticum par des macrophages dérivés de PBMC peut être étudiée, puis comment la viabilité des conidies englouties peut être évaluée à l’aide de techniques simples basées sur la microscopie. Ce protocole pourrait faciliter davantage les recherches sur la réponse immunitaire associée aux macrophages ou les mécanismes liés à la modulation du système immunitaire.