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Les études sur les animaux ont été réalisées conformément aux protocoles approuvés par le Comité institutionnel de soin et d’utilisation des animaux (IACUC) du Centre des sciences de la santé de l’Université Texas Tech (TTUHSC) pour les expériences au TTUHSC et par l’Administration vétérinaire de la préfecture de Grèce occidentale conformément à la directive 2010/63 pour les expériences à l’Université de Patras. Respectez scrupuleusement les règlements sur l’élimination des déchets lors de l’élimination des déchets animaux.
1. Isolement du derme de souris
- Jour 1
REMARQUE : Le jour 1 ; Préparez le matériel et l’équipement suivants : chambre d’anesthésie, tondeuse à poils d’animaux, isoflurane, pinces fines, filtres pour seringues de 0,2 μm.- Préparez une solution de dispase à 2 mg/mL dans du DMEM avec 1 solution antibiotique-antimycosique et filtrez-la.
REMARQUE : L’utilisation du milieu ou du PBS peut être remplacée par HBSS, car il a été utilisé avec succès dans d’autres protocoles rapportés12. La solution antibiotique-antimycosique 1x peut être remplacée par l’ajout de pénicilline (100 UI/ml), de streptomycine (100 μg/mL) et d’amphotéricine (2,5 μg/mL).
- Anesthésier la souris en la plaçant dans une chambre d’anesthésie avec administration d’isoflurane (0,5-2% d’isoflurane, débit : 1 L/min). Une fois que la souris a cessé de bouger, transférez-la hors de la cage et continuez l’anesthésie en ajustant un cône nasal avec un flux d’isoflurane similaire. Pincez les orteils de l’animal pour confirmer des niveaux d’anesthésie suffisants et surveillez constamment la souris pour vous assurer que l’anesthésie profonde est préservée (pas de motilité). Coupez environ 9 cm2 de la fourrure dorsale et ventrale (dos et abdomen de la souris respectivement) longitudinalement le long de la ligne médiane, à l’aide d’une tondeuse à cheveux. Laissez la souris se remettre de l’anesthésie et retournez-la dans la cage.
REMARQUE : Une crème dépilatoire (épilation) peut être utilisée à la place. Assurez-vous que la fourrure est complètement enlevée dans les zones cutanées à isoler tout en préservant l’intégrité de la peau. Essayez de couper la zone de peau la plus étendue possible. Pour s’assurer que l’inflammation potentielle de l’épilation est résolue, l’isolement cellulaire doit avoir lieu le lendemain. Pour augmenter le nombre de cellules isolées, regroupez 2 à 4 souris par groupe.
- Jour 2
REMARQUE : Gardez le matériel et l’équipement suivants à portée de main : chambre d’euthanasie, enceinte de biosécurité, incubateur de CO2 , éthanol, ciseaux fins, pinces fines, pinces émoussées, plaque de culture tissulaire de 100 mm, dispase, DMEM, 1 solution antibiotique-antimycosique.- Euthanasiez la souris par administration de CO2 et placez-la en position couchée, en exposant la zone coupée. Vaporisez de l’éthanol à 70 % comme désinfectant.
REMARQUE : À partir de cette étape, toutes les étapes doivent être effectuées dans des conditions stériles (dans une enceinte de biosécurité).
- Placez une plaque de culture tissulaire stérile de 100 mm sur de la glace.
- Faites une coupe superficielle de 0,5 pouce au niveau de l’abdomen et coupez longitudinalement le long de la ligne médiane jusqu’au cou et au bas-ventre. Faites des entailles latérales pour pouvoir ouvrir la peau.
REMARQUE : La taille de l’incision et la zone cutanée isolée dépendent de la taille de la souris.
- À l’aide d’une pince émoussée, séparez soigneusement la peau des tissus environnants. Faites-le en faisant le tour de tout le torse de la souris, en coupant la peau latéralement autour du cou et du bas-ventre.
- Placez délicatement la peau dans la plaque de culture tissulaire de 100 mm, avec le côté derme vers le bas, en gardant la peau aussi étirée que possible. Couvrez les assiettes et gardez-les sur de la glace. Terminez l’isolement de toutes les souris du groupe.
- Une fois la peau extraite de toutes les souris, incubez les plaques pendant 10 min à température ambiante pour aplatir l’explant.
- Ajouter 6 mL de solution de Dispase dans la plaque, en s’assurant que la peau est complètement immergée et incuber pendant la nuit en agitant légèrement à 4 °C.
REMARQUE : Au lieu de Dispase, la digestion de la trypsine peut également être effectuée12, suivie d’un traitement Liberase au lieu de la Collagénase de type II (ci-dessous).
2. Isolement cellulaire du derme
- Jour 3
REMARQUE : Gardez le matériel et l’équipement suivants à portée de main : centrifugeuse, incubateur de CO2 , enceinte de biosécurité, ciseaux, DMEM, 1 solution antibiotique-antimycosique, collagénase de type II, PBS, tube conique de 50 ml, plaques de culture tissulaire de 100 mm et 60 mm, solution d’ADN I, collagène de type I, filtres à cellules de 70 μm et 40 μm, filtres de seringue de 0,2 μm, milieu LEC.- Préparez 500 mL de 1x PBS (1,37 M NaCl, 27 mM KCl, 100 mM Na2HPO4, 18 mM KH2PO4, pH 7,4) et autoclave pendant 20 min à 15 psi ou filtrez-stériliser. Vous pouvez également utiliser du PBS stérile disponible dans le commerce.
- Préparez 10 ml de solution de collagénase de type II à 2 mg/mL dans du DMEM avec 1 solution antibiotique-antimycosique et stérilisez-la.
REMARQUE : Effectuez les étapes suivantes sous une hotte stérile pour réduire les risques de contamination de l’échantillon.
- À l’aide d’une pipette, retirez le liquide du plat.
- Utilisez des pinces pour séparer le derme (bas de la peau) de l’épiderme (haut) et retirez tout tissu adipeux évident. Transférez le derme dans une plaque de culture tissulaire propre.
- Ajoutez 1 ml de DMEM avec 1 solution antibiotique-antimycosique dans la plaque de culture tissulaire propre et inclinez-la de manière à ce que le liquide s’accumule d’un côté de la plaque.
- Coupez le derme en2 morceaux de 1 à 2 mm et transférez-les dans un nouveau tube conique de 50 ml.
REMARQUE : Idéalement, cette étape doit être terminée dans un délai de 4 à 5 minutes, car un traitement plus long ne devrait pas permettre d’obtenir un rendement plus élevé ou une survie cellulaire.
- Ajouter 10 ml de la solution de collagénase de type II.
- Ajouter 50 μL (25 unités/mL de solution) de solution d’ADN I (réduit l’agglutination cellulaire) et digérer la solution pour le derme pendant 2 h à 37 °C en agitant continuellement (utiliser un incubateur rotatif/agitateur à 30-50 tr/min).
REMARQUE : Vérifiez périodiquement pour identifier si la majeure partie du derme a été digérée. Si ce n’est pas le cas, augmentez le temps de digestion (1 h supplémentaire maximum) et la vitesse d’agitation, si possible.
- Enduire des plaques de culture tissulaire de 60 mm avec 2 ml de collagène de type I à 10 μg/mL dans de l’acide acétique 0,02 M pendant >20 min à 37 °C. Laver 2 fois avec du PBS stérile.
- Filtrer la suspension cellulaire à l’aide d’une crépine de 70 μm et centrifuger à 250 × g pendant 5 min. Jetez le surnageant.
- Mettre en suspension dans 10 mL de DMEM avec 1 solution antibiotique-antimycosique.
- Filtrer la suspension cellulaire à l’aide d’une crépine de 40 μm et centrifuger à 250 × g pendant 5 min. Jetez le surnageant.
- Mettre en suspension dans 1 mL de milieu LEC complet (milieu de base de croissance cellulaire endothéliale avec supplément).
- Plaquez les cellules dans la plaque de culture tissulaire de 60 mm recouverte de collagène dans un milieu LEC complet. Ce sera le jour 0 de la culture cellulaire.
- Remplacez le support tous les 2 jours en lavant deux fois les cellules avec 1x PBS et en ajoutant un nouveau support LEC.
- Répétez l’étape 2.1.15 jusqu’à ce que les cellules soient confluentes à 80-90 %.
REMARQUE : Si la purification est effectuée avant que les cellules ne soient confluentes à 80-90%, moins de cellules endothéliales lymphatiques seront isolées. Ce processus prend environ 7 à 10 jours.
3. Revêtement de billes magnétiques avec anticorps LYVE-1
REMARQUE : Un jour avant l’étape de purification, préparez les matériaux et équipements suivants : réfrigérateur à 4 °C, rotor, séparateur magnétique, PBS, billes magnétiques IgG anti-lapin, tubes de microcentrifugation, filtres de seringue de 0,2 μm, solution de revêtement de billes magnétiques, anticorps LYVE-1.
- Préparez la solution de revêtement à billes magnétiques : 20 mL de PBS avec 0,1 % de BSA et 2 mM d’EDTA et stérilisez-la par filtre. Conservez-le à 4 °C.
REMARQUE : Plus de quelques jours de stockage n’est pas recommandé ; Vérifiez la présence de précipités ou de contamination avant utilisation.
- Pipeter 500 μL de billes magnétiques IgG anti-lapin dans un tube de microcentrifugation et ajouter 1 mL de solution de revêtement de billes magnétiques glacée.
- Utilisez un séparateur magnétique pour laver les billes.
- Répétez les lavages 2 fois avec 1 mL de la solution glacée de revêtement à billes magnétiques.
- Remettre les billes en suspension dans 500 μL de solution de revêtement de billes magnétiques et faire des aliquotes de 150 μL dans des tubes de microcentrifugation.
- Ajouter 15 μg de l’anticorps LYVE-1 dans chaque tube (15 μL à partir d’une concentration d’anticorps de 1 mg/mL).
- Incuber toute la nuit à 4 °C en agitant continuellement.
4. Purification des cellules endothéliales lymphatiques
REMARQUE : Préparez le matériel et l’équipement suivants : incubateur de CO2 , agitateur, minuterie, parafilm, DMEM, 1x solution antibiotique-antimycosique, BSA, PBS, solution d’enrobage de billes magnétiques, trypsine-EDTA, plaques de culture tissulaire de 100 mm ou 60 mm, filtres de seringue de 0,2 μm, collagène de type I, acide acétique, milieu LEC.
- Préparez 50 ml de DMEM avec 1 solution antibiotique-antimycosique et 0,1 % de BSA et stérilisez-le par filtre.
- Enduire des plaques de culture tissulaire de 60 mm avec 10 μg/mL de collagène de type I dans de l’acide acétique 0,02 m pendant >20 min à 37 °C. Laver 2 fois avec du PBS stérile.
- Lavez les billes pré-enduites avec 1 ml de solution d’enrobage de billes magnétiques, à l’aide d’un séparateur magnétique.
- Remettre les billes en suspension dans 150 μL de DMEM avec 0,1 % de BSA.
REMARQUE : Les billes peuvent désormais être stockées à 4 °C jusqu’à 1 mois.
- Lavez les cellules 2 fois avec du PBS.
- Ajouter 3 mL de DMEM avec 0,1 % de BSA (pour une plaque de culture tissulaire de 60 mm) et 50 μL de billes conjuguées aux anticorps dans les cellules.
REMARQUE : Si les cellules de deux souris ou plus sont regroupées, utilisez une plaque de culture tissulaire de 100 mm et ajoutez 6 ml de DMEM avec 0,1 % de BSA.
- Fermez le plat avec du parafilm.
- Placez le plat sur un shaker en agitant à 10 tr/min à RT et incubez pendant exactement 10 min.
REMARQUE : Une incubation plus longue entraînera une liaison non spécifique. Pour vous assurer que les billes interagissent avec toute la surface de la plaque, faites pivoter manuellement la plaque toutes les quelques minutes pendant qu’elle continue de trembler.
- Jetez le milieu et lavez les cellules une fois avec du PBS. Inspectez rapidement les cellules pour vérifier la présence de colonies de LEC sur la plaque.
- Trypsiniser les cellules : utiliser 1 mL de trypsine-EDTA et incuber 3 min à 37 °C. Inspectez les cellules pour vous assurer que le détachement des cellules est réussi.
- Neutraliser la solution avec 2 mL de milieu LEC complet et transférer la solution dans un tube stérile en polypropylène de 5 mL.
- À l’aide d’un séparateur magnétique, laver les cellules 4 x 3 mL de DMEM avec 0,1 % de BSA pour éliminer les cellules non liées.
- Remettez en suspension les cellules restantes liées aux billes dans un milieu LEC complet et la plaque sur les plaques de culture tissulaire de 60 mm préalablement recouvertes de collagène.
- Incuber les cellules à 37 °C et changer de média tous les deux jours après deux lavages PBS à chaque fois.
- Cultivez les cellules jusqu’à ce qu’elles atteignent la confluence (cela prend normalement 7 à 10 jours).
- À ce stade, vérifiez la confluence des cellules au microscope et procédez à la préparation des cellules pour la cytométrie en flux. Si un pourcentage élevé de F4/80+ est identifié, répétez l’étape de purification avec LYVE-1 (Étape 4 : Purification des cellules endothéliales lymphatiques) à nouveau ou, idéalement, un autre marqueur lymphatique (c’est-à-dire la podoplanine14).
REMARQUE : L’expression élevée de la protéine ciblée par l’anticorps sur la population cellulaire purifiée par billes magnétiques a été démontrée15,16. Cependant, pour LYVE-1, il est important d’effectuer un contrôle par cytométrie en flux pour l’identification du pourcentage d’autres cellules LYVE-1+, principalement des macrophages. LYVE-1 n’est exprimé que dans des sous-ensembles de macrophages associés à des tumeurs et des plaies, tandis que dans une peau saine, l’expression de LYVE-1 est plus restreinte aux cellules endothéliales lymphatiques17. Ainsi, le dépistage F4/80 n’est pas obligatoire, mais dépend plutôt du contexte expérimental. Les souris utilisées pour la démonstration ne portaient pas de tumeurs ou de blessures, mais seulement une inflammation potentielle due à l’épilation, mais nous avons inclus la coloration F4/80 comme référence du pourcentage de macrophages LYVE-1+.
5. Cytométrie en flux
REMARQUE : Préparez le matériel et l’équipement suivants : centrifugeuse, incubateur de CO2 , minuterie, hémocytomètre, solution EDTA, 1x solution antibiotique-antimycosique, BSA, PBS, trypsine-EDTA, tubes en polypropylène, filtres à seringue de 0,2 μm, éthanol à 70 %, anticorps conjugués F4/80 FITC.
- Préparez du PBS contenant 0,1 % de BSA et stérilisez-le par filtre.
- Préparer une solution de 1 mM d’EDTA dans le PBS.
- Trypsiniser les cellules : incuber les cellules avec 1 mL de solution d’EDTA 1 mM pendant 5 min à 37 °C.
REMARQUE : L’incubation avec une solution d’EDTA est une méthode plus douce de détachement cellulaire, qui préserve mieux les protéines transmembranaires et est préférée, mais elle nécessite des périodes d’incubation plus longues. Alternativement, la solution trypsine-EDTA peut être utilisée pour une incubation de 1 minute à 37 °C, mais cela peut affecter l’affinité des anticorps pour les applications de cytométrie en flux.
- Neutraliser la solution avec 2 mL de milieu LEC complet et transférer la solution dans un tube stérile en polypropylène de 5 mL.
- Centrifuger les échantillons à 250 × g pendant 5 min.
- Laver avec du PBS.
- Répétez la centrifugation et le lavage PBS.
- Remettez en suspension les cellules dans un PBS contenant 0,1 % de BSA et comptez-les à l’aide d’un hémocytomètre ou d’une autre méthode. Aliquote ~1 × 106 cellules dans des tubes en polypropylène d’un volume final de 100 μl. À partir de cette étape, effectuez toutes les étapes à 4 °C.
REMARQUE : Les cellules peuvent être fixées avant la coloration ou colorées vivantes. La fixation peut être sous-optimale pour la cytométrie en flux, car certains anticorps peuvent ne pas détecter les antigènes après la fixation ; Par conséquent, nous vous recommandons d’exécuter la cytométrie en flux immédiatement après l’étape précédente et de sauter l’étape de fixation. Si cela n’est pas possible, une fixation préalable à l’expérience de cytométrie en flux permettra un retard dans l’étape de cytométrie en flux. Si la fixation doit être effectuée, la performance des anticorps dans le contexte des cellules fixes doit être évaluée à l’avance.
- Effectuer la fixation (étape facultative ; si les cellules ne sont pas à fixer, procéder à l’immunomarquage) : remettre les cellules en suspension dans de l’éthanol glacé à 70% et mélanger doucement pendant 10 min sur de la glace.
REMARQUE : La fixation à l’éthanol peut perméabiliser les cellules et entraîner la libération de GFP ; Cependant, la fixation à base de paraformaldéhyde peut détruire les colorants utilisés pour la cytométrie en flux et, idéalement, peut être évitée.
- Incuber 15 min à température ambiante.
- Laver les cellules 2x par centrifugation à 250 × g pendant 5 min dans 1x PBS.
- Passez à l’étape suivante ou mettez les cellules en suspension dans 0,5 à 1 mL de 1x PBS et conservez-les à 4 °C.
6. Immunocoloration
REMARQUE : Manipulez les cellules avec précaution et évitez le pipetage prolongé, si possible, afin de maintenir l’intégrité de la membrane cellulaire et de minimiser la mort cellulaire, en veillant à ce que les cellules ne forment pas d’amas. À partir des cellules endothéliales isolées, préparez les groupes suivants : cellules non colorées et cellules colorées avec un autre marqueur de cellules endothéliales (c.-à-d. VEGFR3, podoplanine), F4/80, et les deux. Inclure les cellules endothéliales lymphatiques et les macrophages de souris disponibles dans le commerce, le cas échéant, en tant que témoins positifs. À des fins de démonstration, et en raison de la fluorescence endogène tdTomato (PE+), nous avons utilisé la coloration F4/80 conjuguée FITC.
- Diluer l’anticorps primaire dans le PBS avec 0,1 % de BSA selon la dilution recommandée ou optimisée. Ajouter 0,5 μg (1 μL de solution d’anticorps) de l’anticorps conjugué F4/80 FITC aux 100 μL de suspension cellulaire.
- Remettre les cellules en suspension après l’ajout de l’anticorps conjugué fluorescent dilué. Mélangez en effleurant le tube de polypropylène pour vous assurer qu’il n’y a pas d’amas et que toutes les cellules sont correctement revêtues.
- Incuber 1 h à température ambiante (cellules fixes) ou 30 min sur glace (cellules vivantes) dans l’obscurité.
- Laver les cellules 2 fois en les centrifugeant à 250 × g pendant 5 min à 4 °C (pour les cellules vivantes) ou à température ambiante (pour les cellules fixes), en utilisant du PBS avec 0,1 % de BSA dans l’obscurité.
- Pour les anticorps non conjugués par fluorescence
- Diluer l’anticorps secondaire conjugué au fluorochrome dans le tampon d’incubation. Pour les anticorps Alexa Flour, utilisez une dilution de 1:500.
- Ajouter l’anticorps secondaire à 100 μL de solution de suspension cellulaire.
- Incuber pendant 30 min à température ambiante (cellules fixes) ou sur glace (cellules vivantes).
- Laver deux fois par centrifugation à 250 × g pendant 5 min à 4 °C (pour les cellules vivantes) ou à température ambiante (pour les cellules fixes) dans le tampon d’incubation.
- Remettre les cellules en suspension dans 0,5 mL de 1x PBS et les analyser à l’aide d’un cytomètre en flux.
- Suivez ces étapes de stratégie de contrôle pour identifier la population de macrophages dans les cellules exprimant LYVE-1 :
- Tenez compte de la diffusion vers l’avant et sur les côtés pour distinguer la population cellulaire.
- Envisagez une diffusion vers l’avant pour la taille, l’aire et la hauteur des cellules afin de distinguer les cellules individuelles (singlets).
- Prendre en compte l’expression de F4/80 (FITC) et l’expression de RFP (PE) pour identifier les macrophages (F4/80+) dans les cellules murines isolées exprimant tdTomato (PE) (en raison de la présence d’un rapporteur tdTomato fluorescent chez les souris spécifiques, décrites ci-dessous).