Toutes les procédures expérimentales ont été approuvées par le Comité institutionnel de protection et d’utilisation des animaux de l’Université de Ferrare et par le ministère italien de la Santé (autorisation : D.M. 603/2022-PR) conformément aux lignes directrices énoncées dans la directive du Conseil des Communautés européennes du 24 novembre 1986 (86/609/CEE) relative à la protection des animaux utilisés à des fins expérimentales et à d’autres fins scientifiques. Ce protocole est spécifiquement ajusté pour d’autres analyses quantitatives par réaction en chaîne par polymérase (qPCR) de petits acides ribonucléiques non codants (ARNsnc) dans le LCR et le plasma de rat obtenus sous contrôle EEG chez des animaux épileptiques. À sa discrétion, veuillez consulter la vidéo JoVE correspondante pour une meilleure compréhension et des améliorations de la chirurgie 19,20,21.
1. Préparation des animaux pour l’implantation chirurgicale d’électrodes ou de télémètres
REMARQUE : La technique de chirurgie stéréotaxique varie en fonction du système EEG utilisé. La section suivante sur la méthode fournit une description des étapes communes aux deux types de chirurgies.
- Utilisez des rats Sprague-Dawley (SD) (mâles, âgés de 7 à 8 semaines, pesant 250 à 290 g) maintenus conformément aux lois locales sur le soin et l’utilisation des animaux de laboratoire. Hébergez les animaux dans des conditions standard avec un accès gratuit à la nourriture et à l’eau potable.
- Procéder à la manipulation des rats pendant quelques jours avant la chirurgie et les procédures du protocole expérimental.
- Utiliser un appareil stéréotaxique pour l’implantation d’électrodes ou de télémètres. Suivez les normes contemporaines pour les chirurgies aseptiques. Utilisez des électrodes et des transmetteurs stériles et en bon état de fonctionnement.
- Rasez la tête de l’animal avec le rasoir électrique. Induire l’anesthésie chez l’animal avec le mélange de kétamine (45 mg/kg) et de xylazine (7,5 mg/kg) administré par voie intrapéritonéale (i.p.), puis ajouter l’anesthésie à l’isoflurane (1,4 % dans l’air ; 1,2 mL/min) administrée à travers un masque facial et fixer la tête de l’animal dans l’appareil stéréotaxique.
- Assurez-vous d’une profondeur d’anesthésie adéquate en testant le réflexe de retrait de la pédale après le pincement des coussinets plantaires sur les pattes arrière des deux animaux et maintenez l’anesthésie à l’isoflurane jusqu’à la fin de la chirurgie. Vérifiez régulièrement la profondeur de l’anesthésie pendant toute la durée de l’intervention.
- Appliquez une quantité suffisante de pommade ophtalmique sur les yeux des deux animaux pour prévenir les lésions cornéennes dues à la perte du réflexe de clignement des yeux causée par l’anesthésie.
- Nettoyez soigneusement le cuir chevelu de l’animal avec un désinfectant liquide et faites une incision longitudinale de 2 cm de long à l’aide d’un scalpel stérilisé. Ouvrez le cuir chevelu et appliquez des clips chirurgicaux sur les lambeaux de peau pour le maintenir ouvert.
- Délicatement, détachez le périoste pour exposer le bregma et la zone du crâne à travers laquelle l’électrode enregistreuse sera insérée.
2. Implantation chirurgicale d’électrodes attachées
NOTA : Avant d’établir la procédure de ponction du LCR de ce protocole (voir l’étape 9 pour plus de détails), des prélèvements répétés du LCR à l’aide d’une canule guide chez quelques rats non anesthésiés se déplaçant librement ont été effectués. Des animaux canulés implantés avec des électrodes attachées ont été utilisés afin d’évaluer l’impact des implants à double tête sur l’enregistrement EEG à long terme couplé à de multiples prélèvements de LCR. Dans ces expériences spécifiques, des rats ont été implantés avec une canule guide factice placée dans la citerne magna, dont l’extrémité y a été insérée de 7 mm de manière stéréotaxique, selon des protocoles précédemment publiés22. Les approches de chirurgie à double implant étaient similaires à celles adoptées par certains travailleurs dans le passé pour l’implantation de canules guides de microdialyse et d’électrodes attachantes23,24.
- Utilisez un bras du cadre stéréotaxique, montez le porte-électrode dessus et placez l’électrode à la verticale dans le support. Déplacez la pointe de l’électrode exactement au-dessus du bregma. Notez les coordonnées antéropostérieures et médiolatérales du bregma et traduisez-les aux coordonnées souhaitées.
- Abaissez l’électrode jusqu’à ce que sa pointe touche presque le crâne. Marquez l’endroit du perçage et percez le crâne sur l’endroit marqué. Veillez à ne pas endommager le cerveau et les méninges.
- Faites quatre trous ou plus pour les vis d’ancrage et vissez-les dans le crâne. Faites attention à la taille de l’électrode lorsque vous faites les trous pour les vis d’ancrage. La taille de l’électrode ne doit pas interférer avec les vis d’ancrage positionnées.
- Abaissez lentement le bras stéréotaxique portant l’électrode sur l’axe dorso-ventral, entrez dans le tissu cérébral et arrêtez-vous à la position souhaitée. Fixez le fil de terre de l’électrode autour de l’une des vis vissées dans le crâne.
- Placez le ciment méthacrylique sur l’électrode et les vis couvrant environ la moitié de la hauteur du piédestal de l’électrode. Laissez la moitié supérieure de l’électrode, qui correspond à l’extrémité du fil d’attache, nue.
- Libérez l’électrode du support et soulevez le bras stéréotaxique. Libérez l’animal de l’appareil stéréotaxique et donnez-lui des soins postopératoires.
- Placez l’animal dans une cage de récupération séparée et observez-le toutes les 10 minutes jusqu’à ce qu’il soit éveillé et ambulatoire. Ne remettez l’animal dans sa cage d’hébergement standard et dans une autre compagnie d’animaux non anesthésiés qu’après s’être complètement rétabli.
3. Implantation chirurgicale des télémètres
REMARQUE : N’utilisez que des télémètres stériles. Si les télémètres sont réutilisés, nettoyez-les et stérilisez-les avant la chirurgie selon les instructions du fabricant. Dans ce protocole, un télémètre de science des données International (DSI) pour l’enregistrement EEG a été utilisé.
- Allumez l’émetteur de télémétrie à l’aide d’un aimant et testez le signal avec une radio de fréquence AM. Vérifiez s’il y a un signal fort et clair avant la chirurgie. Si nécessaire, jetez les télémètres qui fonctionnent mal.
- Préparez les fils du télémètre en les raccourcissant à des longueurs optimales pour les rats adultes. Décollez le revêtement en silicone sur deux fils (négatif et positif), exposant environ 5 mm du fil d’acier hélicoïdal. Créez une poignée bouclée d’environ 2 mm de longueur et 1 mm de largeur à l’extrémité des laisses.
- Rasez le flanc de l’animal sous et derrière l’épaule gauche. Désinfecter la zone de chirurgie avec un désinfectant à base de peroxydes stabilisés et d’activité d’ammonium quaternaire. Laissez agir le désinfectant pendant 15 min.
- Faites une incision latérale d’environ 2 cm juste derrière l’épaule de l’animal et faites une poche sous-cutanée d’environ 5 cm3 d’espace pour la mise en place de l’émetteur. Placez l’émetteur parallèlement à l’axe long du corps, avec les fils dirigés vers la direction rostrale.
- Fixez l’émetteur à la paroi interne de la poche sous-cutanée avec une suture en coton 3-0. À l’aide de ciseaux à bout émoussé, créez le tunnel sous-cutané (d’environ 2,5 cm de longueur) à travers le flanc et le cou de l’animal, reliant ainsi la poche de l’émetteur à l’incision médiane pratiquée sur le cuir chevelu de l’animal à l’étape 1.6.
- Prenez les deux fils de télémètres avec une pince et tirez-les vers le haut à travers le tunnel, de sorte qu’ils dépassent de la sortie de l’incision du cuir chevelu. Maintenez les fils hors de l’incision du cuir chevelu avec des pinces à plaie.
- Utilisez le cadre stéréotaxique pour identifier les coordonnées souhaitées pour la dérivation positive (rouge) et percez le trou dans le crâne pour la pointe de dérivation positive (similaire à l’étape 2.1.). Faites un autre trou pour ancrer la vis vers le haut au rostre et vissez-la dans le crâne.
- Insérez l’extrémité de la sonde positive sous la scutellaire et la dure-mère et posez-la sur la surface du cerveau. Accrochez la pointe bouclée du fil négatif (blanc) sur la vis. Mettez une petite quantité de ciment méthacrylique autour de la sortie du plomb positif et du plomb négatif pour les immobiliser sur le crâne.
- Fixez les sondes à la paroi interne de la peau du crâne avec une suture en coton 3-0. Assurez-vous que les sondes fixes et la suture de fixation n’interféreront pas avec le site de retrait du LCR (c’est-à-dire une surface dépressible avec l’apparence d’un losange entre la protubérance occipitale et la colonne vertébrale de l’atlas).
- Fermez l’incision du cuir chevelu et l’incision du flanc à l’aide d’une suture en coton 3-0. Appliquez des désinfectants sur les plaies. Ce n’est qu’une fois celles-ci sèches qu’il faut appliquer une crème antibiotique sur les plaies suturées.
4. Soins postopératoires
- Surveillez les animaux pendant environ 1 h après l’opération jusqu’à ce qu’ils se tiennent debout et se déplacent dans la cage. Gardez-les sur un coussin chauffant pour éviter l’hypothermie. Administrer aux animaux un antibiotique systémique pour prévenir l’infection et un analgésique systémique pour prévenir la douleur post-chirurgicale pendant 2 à 3 jours.
- Laissez les rats récupérer pendant au moins 7 jours après les interventions chirurgicales. Surveillez les animaux au moins une fois par jour pendant 3 jours pour détecter tout signe de douleur ou de détresse.
5. Induction de l’état de mal épileptique chez le rat
REMARQUE : Pour un protocole détaillé d’induction de l’état de mal épileptique (SE) nécessaire à la reproduction de l’épilepsie mésiale du lobe temporal (mTLE) chez le rat, se référer à Guarino et al.25.
- Après une semaine de récupération post-chirurgicale, répartissez les animaux au hasard dans des groupes : (i) les animaux témoins recevant le véhicule et (ii) les animaux épileptiques qui recevront de la pilocarpine. Utilisez un nombre proportionnellement plus élevé d’animaux pour le groupe épileptique, car tous les rats à qui l’on a administré de la pilocarpine ne survivront pas ou ne développeront pas d’ES.
- La veille de l’induction de l’ES, administrer aux animaux une dose unique de 127 mg/kg de chlorure de lithium dissous dans une solution saline à 0,9 % (3M) à raison de 1 mL/kg par gavage gastrique. Administrer le lithium de l’animal, qui augmente l’efficacité de la pilocarpine26, environ 14 h avant l’induction de l’ES afin de réduire la variabilité dans le temps jusqu’à l’apparition de l’ES.
- Environ 14 h après l’administration de lithium, administrer aux rats une seule injection de méthylscopolamine (1 mg/kg, par voie sous-cutanée).
- Exactement 30 minutes après l’administration de méthylscopolamine, administrer aux rats une seule injection de pilocarpine (50 mg/kg, i.p.) pour induire l’ES. Donner de la méthylscopolamine et du véhicule (solution de NaCl à 0,9 %) pour contrôler les rats.
- L’injection de pilocarpine induit un comportement typique chez l’animal : crises partielles précoces (mouvements des vibrisses et hochements de tête dans les 5 minutes suivant l’administration de pilocarpine) évoluant vers des convulsions généralisées récurrentes (SE) dans les 25 à 30 minutes. Pour les rats qui ne développent pas d’ES dans les 30 minutes, administrer une dose supplémentaire de pilocarpine (25 mg/kg, i.p.), et s’ils ne développent toujours pas d’ES, les exclure de l’étude (non-répondeurs à l’ES).
- Observez et notez le comportement épileptique chez le rat toutes les 5 minutes en commençant immédiatement après l’injection de pilocarpine. Utilisez l’échelle de Racine pour obtenirune note de 27.
- Interrompre l’ES 2h après le début par l’administration i.p. d’un cocktail de médicaments : diazépam (10 mg/kg), phénobarbital (25 mg/kg) et scopolamine (1 mg/kg).
- Donnez à nouveau ce cocktail aux rats après 4 h. Enfin, après encore 4 h, donnez aux rats le dernier mélange de médicaments (diazépam 10 mg/kg plus scopolamine 1 mg/kg) afin d’arrêter complètement l’activité convulsive.
- Injecter i.p. aux animaux avec une solution saline (1 mL de solution de NaCl à 0,9 %, pH ajusté à 7,0) et les nourrir avec une solution de saccharose à 10 % pendant 2 à 3 jours après l’ES pour favoriser la récupération de la perte de poids corporel qui suit l’ES.
- Assigner au hasard les animaux survivants post-SE à différents groupes expérimentaux selon les exigences du protocole expérimental spécifique. Utiliser les critères d’inclusion/exclusion suivants pour d’autres expériences chez des rats épileptiques : développement d’une SE convulsive dans l’heure suivant l’administration de pilocarpine, prise de poids au cours de la première semaine après l’ES et positionnement correct de l’électrode dans la zone cérébrale d’intérêt pour les enregistrements EEG25.
6. Vidéo-EEG captif chez le rat épileptique et analyses de l’activité convulsive
NOTA : Cette section décrit la procédure expérimentale d’enregistrement des signaux EEG chez des rats logés et se déplaçant librement dans des conditions normales. La cage ne doit pas contenir d’objets où l’animal ou le câble d’enregistrement peuvent se coincer. En fonction de la question scientifique à aborder, plusieurs paramètres peuvent être analysés. Dans le cas de la recherche sur l’épilepsie, les traces EEG sont examinées pour reconnaître les crises électriques et motrices. Les paramètres les plus couramment utilisés pour identifier une crise sont l’amplitude, la fréquence et la durée de l’activité électrique paroxystique.
- Placez l’animal dans une cage propre dans la salle d’enregistrement pour permettre l’accoutumance et réduire le stress induit par le nouvel environnement. Placez la cage de l’animal dans une cage de Faraday pour éviter la contamination du signal EGG par le champ électromagnétique environnemental.
- Connectez une extrémité du câble d’enregistrement à l’appareil d’enregistrement. Utilisez un voltmètre pour mesurer le potentiel électrique et différencier les électrodes de masse des électrodes de référence.
- Connectez l’autre extrémité du câble d’enregistrement à l’électrode fixée sur la tête du rat. Pour ce faire, tenez le couvercle en ciment sur la tête de l’animal lors de l’insertion de la fiche du câble dans le connecteur de l’électrode et évitez d’appliquer une pression sur la tête du rat.
- Contrebalancez le poids du câble d’enregistrement pour permettre la libre circulation de l’animal tout en évitant le risque de torsion du câble. Pour ce faire, utilisez un bras d’équilibrage ou des collecteurs. Même si le câble d’enregistrement est contrebalancé, placez la nourriture à l’intérieur de la cage plutôt que dans un support d’alimentation, dans lequel les animaux doivent se lever pour atteindre la nourriture.
- Avant de commencer l’enregistrement, vérifiez tous les paramètres utilisés pour acquérir et traiter les données de l’EEG.
REMARQUE : Ce protocole ne fournit pas d’introduction à l’appareil requis pour effectuer l’enregistrement EEG, cependant, des taux de filtrage et d’échantillonnage adéquats doivent être appliqués pour éviter les artefacts et le bruit dans les signaux EEG.- Pour une expérience de routine, réglez la fréquence d’échantillonnage à 500 Hz et le gain d’amplification à 5000x. Filtrez le signal à l’aide d’un filtre de 0,005 Hz en plus d’un filtre coupe-bande pour éliminer l’activité électrique environnante dans la bande de 50 Hz (spécifique aux pays européens).
- Démarrez les enregistrements vidéo et EEG et assurez-vous que les traces correspondent à un signal EEG attendu en vérifiant la puissance dans des bandes de fréquences spécifiques au fil du temps. Enregistrez une période de référence avant de commencer les interventions chez les animaux.
- Vérifiez périodiquement les traces des animaux et de l’EEG. Il n’est pas rare qu’un câble d’enregistrement se détache du connecteur de l’électrode dans la tête du rat. Si cela se produit, reconnectez à nouveau l’électrode de la tête de rat à un câble d’enregistrement et vérifiez si le signal EEG est clair.
- Analysez le signal EEG manuellement ou automatiquement à l’aide d’un logiciel disponible dans le commerce. En cas d’analyse manuelle, passez au crible l’enregistrement EEG pour identifier les activités semblables à des crises. Si un logiciel doit être utilisé, configurez les paramètres clés d’un événement de crise, tels que l’amplitude, la fréquence et la durée de l’activité électrique.
NOTA : Une seule crise peut être caractérisée par une activité électrique d’une amplitude 3 fois supérieure à la ligne de base, d’une fréquence égale ou supérieure à 5 Hz et d’une durée d’au moins 5 s22.
- Quelle que soit la méthode utilisée, confirmez les crises convulsives potentielles en vérifiant l’enregistrement vidéo synchronisé recueilli simultanément avec l’EEG.
7. Vidéo-EEG de télémétrie chez le rat épileptique et analyse de l’activité convulsive
NOTA : Cette section décrit la procédure expérimentale d’enregistrement des signaux EEG de radiotélémétrie chez des rats logés et se déplaçant librement dans des conditions normales. Le protocole est basé sur un système de télémétrie disponible dans le commerce. Cependant, plusieurs systèmes de télémétrie diffèrent légèrement dans leurs spécifications fonctionnelles et techniques. Le système doit être choisi en fonction des besoins du laboratoire et des objectifs de recherche.
- Placez la cage de l’animal au-dessus du récepteur de signal. Connectez le récepteur de signal au système d’acquisition de données et celui-ci à un ordinateur avec le logiciel d’acquisition.
- Allumez l’implant de télémétrie par radiofréquence en plaçant un aimant à proximité du télémètre inséré dans le flanc du rat. Testez le signal à l’aide d’un appareil radio. Utilisez un appareil radio universel pour tester les télémètres et entendez un bip clair indiquant que le télémètre est activé, tandis qu’un grésillement indique un télémètre inactivé.
REMARQUE : La durée de vie de la batterie de l’émetteur radiofréquence doit être prise en compte avant de définir la durée des enregistrements.
- Configurez le logiciel d’acquisition et synchronisez le signal de télémétrie et le système vidéo pour acquérir simultanément des données EEG et vidéo. Attribuez un récepteur de signal à chaque émetteur implanté et définissez les valeurs d’étalonnage de l’émetteur. Réglez la fréquence d’échantillonnage à 1000 Hz, la détection de bruit entre -500 mV et +500 mV et l’intervalle d’intégration à 100 ms. N’utilisez pas de filtres passe-bas et passe-haut.
- Démarrez les données de télémétrie et les enregistrements vidéo. Effectuez un enregistrement de base à long terme avant d’acquérir l’activité de type épileptique. Analysez le signal EEG comme décrit aux étapes 6.8 et 6.9.
8. Procédure de prélèvement sanguin de la veine caudale
NOTE. Le système de prélèvement sanguin sous vide se compose d’une aiguille papillon (23 G x 3/4 x 12 (0,8 mm x 19 mm x 305 mm). La technique de prélèvement sanguin peut être facilement effectuée par un seul opérateur et la procédure prend environ 5 minutes.
- Enrober l’aiguille papillon et sa tubulure avec de l’EDTA K2à 1 % dans de l’eau distillée peu de temps avant les prélèvements, c’est-à-dire aspirer et expulser la solution d’EDTA K2du système à l’aide de la seringue de 1 mL. Coupez le tube juste derrière l’aiguille afin de recueillir le sang goutte à goutte, sans aspiration (Figure 1A).
- Placez le rat dans une chambre d’induction et anesthésiez-le avec de l’isoflurane (1,4 % dans l’air ; 1,2 mL/min). Passez au cadre stéréotaxique et maintenez l’anesthésie à l’aide d’un masque facial. Placez le coussin chauffant sous l’animal, en gardant une partie de sa queue en contact direct avec le coussin.
- Déplacez doucement le dos de l’animal sur le côté de manière à ce que la veine caudale latérale soit maintenue en haut.
- Trempez la queue dans de l’eau tiède (42 °C) pendant 2 min pour dilater la nervure latérale. Essuyez la queue avec de l’éthanol à 70 % pour rendre la veine plus visible. Mettez une lumière chaude sur la queue à l’aide d’une ampoule à incandescence ordinaire.
- Insérez l’aiguille papillon 21G dans la veine caudale latérale avec une profondeur de 5 mm et un angle de 20°. Prélever du sang dans un tube de prélèvement sous vide de 500 μL contenant 5 mg d’EDTA K2comme anticoagulant (Figure 1B,C).
- Retirez l’aiguille et arrêtez l’écoulement du sang en exerçant une pression sur le site de ponction. Ramenez le rat dans sa cage d’origine.
- Retournez doucement le tube 10x pour mélanger l’anticoagulant dans le sang. Faites des trous d’environ 1,5 cm de profondeur dans la glace pour accueillir les tubes de collecte. Mettez doucement et verticalement l’échantillon sur de la glace.
- Centrifuger l’échantillon de sang dans une centrifugeuse réfrigérée (4 °C) à 1300 x g pendant 10 min pour séparer le plasma. Effectuez cette procédure dans un délai de 1 h maximum.
- Prélevez environ 200 μL de plasma, en évitant la couche de globules rouges et blancs. Placer le plasma prélevé dans le microtube stérile de 0,2 ml. Si nécessaire, conserver à 4 °C jusqu’à 1 h après centrifugation.
- Mettez de côté 5 μL de l’échantillon pour le contrôle de la qualité. Conserver l’échantillon à -80 °C jusqu’à l’analyse.
REMARQUE : N’utilisez pas l’aspirateur, même si certains chercheurs le recommandent28, et ne traitez pas la queue pendant les procédures décrites à l’étape 8.5 pour obtenir plus de sang, car cela diminue la qualité de l’échantillon pour les prochaines analyses de quantification de l’ARNsnc (veuillez consulter les résultats représentatifs pour plus de détails). Gardez à l’esprit que chez le rat, la quantité maximale de sang qui peut être prélevée en une seule fois est de <10 % de son volume sanguin total (c’est-à-dire environ 1,6 à 1,9 ml chez un rat de 250 à 300 g) et de <15 % du volume sanguin total (environ 2,64 ml) en 1 mois29. Dans ce protocole, un maximum de 500 μL de sang prélevé en une seule occasion jusqu’à cinq fois chez un seul animal est utilisé30,31.
9. Procédure de recouvrement du LCR
NOTE. La technique peut être facilement réalisée par un seul opérateur, et la procédure nécessite environ 2 à 4 minutes. Les matériaux utilisés pour la collecte du LCR sont des aiguilles papillon sous vide à usage unique et peu coûteuses et des tubes d’extraction. Dans ce protocole, un dispositif de perfusion à ailes de papillon relié à une seringue stérile est utilisé afin de créer le vide (Figure 2A).
- Préparez l’aiguille papillon 23G en coupant son manchon de protection en plastique de manière à ce que l’extrémité de l’aiguille nue soit exposée de 7 mm pour éviter qu’elle ne pénètre à plus de 7 mm de profondeur dans la citerne magna lors du retrait (Figure 2B).
- Connectez l’aiguille papillon munie d’un tube en polymère à une seringue de 1 ml.
- Placez le rat dans une chambre d’induction et anesthésiez-le avec de l’isoflurane (1,4 % dans l’air ; 1,2 mL/min). Basculez le flux d’isoflurane vers le cadre stéréotaxique et maintenez l’anesthésie administrée à travers un masque facial. Retirez la fourrure sur l’arrière-plan, la tête et le cou du rat avec un rasoir.
- Fixez la tête du rat avec des barres auriculaires. Abaissez la tête de l’animal d’environ 45° verticalement, en descendant le long de la barre nasale du cadre stéréotaxique (figure 2C). Inspectez l’arrière de la tête de l’animal et trouvez une surface légèrement déprimée ayant l’aspect d’un losange, entre la protubérance occipitale et l’épine de l’atlas.
- Frottez cette surface avec de l’éthanol à 70% afin de la rendre plus visible et désinfectez-la.
- Insérez l’aiguille papillon verticalement au centre de la surface déprimée en forme de losange dans la citerne magna pour la collecte du LCR jusqu’à ce que le mouvement soit bloqué en coupant à la taille de la protection du manchon en plastique de l’aiguille (Figure 2D). Tirez doucement le piston de la seringue de 1 mL vers l’arrière afin de laisser le LCR s’écouler lentement à travers l’aiguille.
- Recueillir environ 100 μL de LCR dans un tube en polymère (figure 2D). Évitez d’entrer dans le sang ou toute autre contamination visible. Pincez le tube en polymère très près de l’aiguille papillon et coupez le tube à ce stade.
- Prélever l’échantillon clair (non contaminé) dans la seringue. Jetez l’échantillon contaminé si une contamination visible pénètre dans le tube collecteur.
- Expulser l’échantillon dans le microtube stérile de 0,2 ml et le conserver sur de la glace jusqu’à 1 h.
- Désinfectez le site de retrait du LCR sur la tête de l’animal. Retirez le rat du cadre stéréotaxique et remettez-le dans sa cage.
- Mettez de côté 2 μL de l’échantillon pour le contrôle de la qualité. Conservez le reste de l’échantillon à -80 °C pour une analyse plus approfondie.
REMARQUE : Chez le rat, si plusieurs prélèvements de LCR sont effectués à plusieurs reprises, le volume recommandé à retirer à chaque prélèvement est de 100 μL32. Dans ce protocole, un maximum de 100 μL de LCR en une seule occasion avec un retrait maximal de 5 fois en 15 jours chez un seul animal a été effectué.
10. Analyse spectrophotométrique de la qualité de l’échantillon
REMARQUE : Après un prélèvement approprié des échantillons de LCR et de plasma, les échantillons sont prêts pour les analyses spectrophotométriques et ne nécessitent aucune manipulation spécifique. Mesurer l’absorbance de l’hémoglobine par spectrophotométrie UV à 414 nm pour évaluer le risque d’hémolyse dans les échantillons. Utiliser une valeur limite d’absorbance de 0,25 dans les échantillons de rats. Le choix de cette limite peut dépendre de l’analyse ultérieure de la qPCR et de ses exigences spécifiques pour la quantification des ARNsnc.
- Allumez le spectrophotomètre UV. Sélectionnez la méthode de mesure de l’absorbance à une seule longueur d’onde de 414 nm pour le PLASMA ou le LCR. Cliquez sur Suivant.
- Rincez la cuvette de 1 mm à l’eau purifiée. Mettez 5 μL d’éthanol à 70 % sur le point de mesure de la cuvette. Séchez avec un essuie-tout et frottez avec du papier de soie non pelucheux. Vérifiez s’il est parfaitement transparent.
- Mettez 1,5 μL d’eau purifiée dans la cuvette de 1 mm et fermez-la. Insérez la cuvette dans la chambre de mesure du spectrophotomètre et mesurez l’absorbance de l’échantillon blanc en cliquant sur le bouton Vide . Vérifiez que la valeur d’absorbance à 414 nm est de 0,000.
- Séchez la cuvette avec une serviette en papier et nettoyez-la avec du papier de soie non pelucheux. Vérifiez s’il est parfaitement transparent.
- Mettez 1,5 μL de l’échantillon dans la cuvette de 1 mm et fermez-la. Insérez la cuvette dans la chambre de mesure du spectrophotomètre. Mesurez l’échantillon en cliquant sur le bouton Échantillon . Vérifier l’absorbance de l’échantillon à 414 nm et l’annoter.
- Procéder à la quantification de l’absorbance de l’hémoglobine dans tous les échantillons disponibles. Mesurez l’échantillon à blanc avant tout échantillon de plasma ou de LCR, en cliquant alternativement sur les boutons Blanc et Échantillon .
- Conserver les échantillons avec A414 nm < 0,25 à -80 °C et jeter les échantillons si A414 nm > 0,25.
- Rincez séquentiellement la cuvette de 1 mm avec de l’eau purifiée et de l’éthanol à 70 %. Séchez la cuvette.
- Fermez la cuvette vide dans la chambre de mesure pour éviter qu’elle ne s’époussète. Éteignez le spectrophotomètre.