Salut-C: une méthode d'étude de l'architecture tridimensionnelle des génomes.

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6 mai 2010

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6 mai 2010

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Nynke L. van Berkum^*¹ , Erez Lieberman-Aiden^*²^,³^,⁴^,⁵ , Louise Williams^*² , Maxim Imakaev⁶ , Andreas Gnirke² , Leonid A. Mirny³^,⁶ , Job Dekker¹ , Eric S. Lander²^,⁷^,⁸

¹Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, ²Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, ³Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, ⁴Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University , ⁵Department of Applied Mathematics, Harvard University , ⁶Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, ⁷Department of Systems Biology, Harvard Medical School, ⁸Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology

^* These authors contributed equally

La méthode Salut-C permet l'identification sans parti pris, l'ensemble du génome des interactions chromatine (1). Salut-C couples ligature de proximité et le séquençage massivement parallèle. Les données obtenues peuvent être utilisées pour étudier l'architecture génomique à plusieurs échelles: premiers résultats identifié des caractéristiques telles que les territoires chromosomiques, la ségrégation de la chromatine ouverte et fermée, et la structure de la chromatine à l'échelle mégabase.