Isolement de l’ADN microbien dans les selles : étude de l’effet de l’enrichissement de l’environnement sur la diversité du microbiome dans un modèle de tumeur murine

- L’enrichissement de l’environnement, ou EE, fait référence aux modifications des paramètres du logement pour obtenir des effets bénéfiques sur diverses maladies telles que le cancer. Chez une souris porteuse d’une tumeur, l’EE active le système immunitaire et réduit l’inflammation, ce qui améliore finalement le microbiote intestinal et améliore le taux de survie. Pour étudier les changements dans le microbiote intestinal, ajoutez la quantité souhaitée de tampon de lyse des selles dans un tube contenant les selles de souris.

Centrifugez l’échantillon et transférez le surnageant dans un nouveau tube de microcentrifugation. Ajouter un tampon de lyse au chlorure de guanidinium qui dénature la DNase et la RNase. Ensuite, ajoutez de l’éthanol et transférez l’échantillon dans une colonne de spin de silice.

L’éthanol aide l’ADN à se lier à la silice. Centrifugez l’échantillon. Maintenant, transférez la colonne dans un nouveau tube de microcentrifugation et ajoutez un tampon d’élution à la colonne pour éluer l’ADN.

Centrifugez l’échantillon et jetez la colonne. Transférez l’échantillon dans un tube PCR et exécutez une PCR pour amplifier l’ADN. Chargez l’ADN sur du gel d’agarose et effectu