Isolement ciblé de colonies bactériennes à l’aide de la dégradation d’hydrogel à motifs légers

Prenez une lamelle avec une couche d’hydrogel photodégradable qui contient des colonies bactériennes piégées, génétiquement modifiées pour émettre de la fluorescence.

Placez la lamelle dans un support.

Ajouter du milieu pour éviter la déshydratation de l’échantillon.

Sous un microscope à fond clair, concentrez-vous sur une seule colonie d’intérêt.

À l’aide d’un logiciel approprié, concevez un motif lumineux pour l’extraction des cellules à la périphérie de la colonie afin de briser les liaisons structurelles de l’hydrogel et de minimiser l’exposition aux UV des cellules.

Ajustez l’intensité de la lumière UV et la durée d’exposition.

Initier l’exposition à la lumière UV pour rompre les liaisons structurelles dans l’hydrogel aux zones exposées qui facilitent la libération de la colonie cible.

À l’aide d’un filtre à fluorescence, identifiez la colonie.

Placez un embout de tube à l’endroit, avec l’autre extrémité reliée à une seringue.

Passez en mode fond clair et, à l’aide de la seringue, aspirez la colonie libérée.

Transférez la colonie dans un tube pour une analyse plus approfondie.

Placez l’échantillon dans un support PDMS et ajoutez le milieu défini sur l’échantillon pour éviter la déshydrat