Isolement de réducteurs de fer oxydant l’ammonium à partir d’une culture d’enrichissement dérivée d’un sol de zone humide

Commencer par une culture d’enrichissement dérivée du sol d’un milieu humide contenant des communautés bactériennes.

La culture présente une activité Feammox, l’oxydation de l’ammonium couplée à la réduction du fer ferrique, indiquant l’enrichissement d’une bactérie capable de ce processus métabolique.

Diluer la culture en série à l’aide de milieux.

Étalez les échantillons dilués sur des plaques de gélose d’essai complétées par du fer ferrique et de l’ammonium.

Utilisez des plaques de contrôle qui manquent de fer ferrique ou d’ammonium, ou qui contiennent du fer ferrique avec du carbone organique au lieu de l’ammonium, pour exclure la réduction du fer par des voies non Feammox.

Incuber toutes les plaques dans un sac à gants anaérobie contenant un mélange d’azote et de dioxyde de carbone.

Les bactéries qui oxydent l’ammonium tout en réduisant le fer ferrique en fer ferreux ne forment des colonies grises que sur la plaque d’essai.

Cela confirme la présence de la bactérie Feammox dans la culture d’enrichissement.

D’autres bactéries qui utilisent des sous-produits de Feammox sur la plaque d’essai ou du carbone organique sur la plaque de contrôle ne forment pas de colonies grises.

Isolez les colonies grises et sous-cultivez-les pour une analyse plus approfondie.