Quantification des unités formant des colonies de bactéries associées à l’intestin chez la drosophile

Commencez avec une microplaque contenant des homogénats préparés à partir de mouches drosophiles . Ces mouches abritaient une population contrôlée d’une bactérie spécifique dans leur intestin.

Les homogénats contiennent des tissus de mouches lysés et libérés par des bactéries intestinales.

Aspirez les bactéries en suspension et diluez-les en série sur plusieurs microplaques.

Repérez les petits volumes de chaque dilution sur des plaques de gélose, en veillant à ce que les gouttelettes restent séparées.

Incuber pour permettre aux bactéries de proliférer en colonies visibles.

Capturez des images des plaques pour quantifier les unités formant colonies (UFC), qui représentent le nombre de cellules bactériennes viables capables de former des colonies individuelles.

À l’aide d’un logiciel d’analyse d’images, alignez chaque image à l’aide d’une ligne de référence, définissez une limite et appliquez une grille uniforme pour la segmenter en zones de comptage, chacune correspondant à un seul point.

Ajustez le seuil de luminosité pour distinguer les colonies individuelles de l’arrière-plan, puis exécutez l’analyse pour compter les colonies à chaque endroit et quantifier les UFC.

Placez trois plaques d