Déparaffinisation et réhydratation de coupes de tissus : une procédure en deux étapes pour éliminer la cire de paraffine des lames de tissus FFPE suivie d’une réhydratation tissulaire

Pertinence professionnelle pour l'industrie

Le traitement des tissus inclus en paraffine permet l'archivage à long terme d'échantillons cliniques tout en préservant l'intégrité moléculaire nécessaire à des analyses ultérieures. La déparaffinisation et la réhydratation constituent des étapes préparatoires essentielles qui restaurent l'accès aux tissus pour l'évaluation des biomarqueurs et les études mécanistiques. Ce protocole facilite la validation des cibles et le développement d'analyses en découverte de médicaments en oncologie, en assurant une préparation reproductible des échantillons provenant de collections archivées.

Applications stratégiques en recherche et développement en biopharmaceutique

Début de la découverte et validation de la cible

• Valeur scientifique : Permet l'interrogation de cibles thérapeutiques dans des modèles de tissus humains pertinents sur le plan clinique.
• Valeur opérationnelle : Offre un accès à des cohortes archivées en FFPE pour l'analyse rétrospective de l'expression des cibles.
• Valeur prédictive : Permet la corrélation des biomarqueurs avec les résultats cliniques afin de réduire les risques liés à la sélection des cibles.

Développement de tests et criblage

• Prêt-à-l’emploi pour tests : Génère des sections de tissu réhydratées compatibles avec les protocoles d'immunohistochimie et d'hybridation in situ.
• Données quantitatives : Préserve l'antigénicité et l'intégrité des acides nucléiques pour des signaux mesurables en aval.
• Reproductibilité : Des durées d'incubation normalisées dans les solvants assurent une préparation de tissu cohérente entre les lots.

Recherche translationnelle et préclinique

• Pertinence pour les maladies : Utilise des coupes FFPE de tumeurs gastro-intestinales pour modéliser la biologie du cancer humain.
• Continuité translationnelle : Établit un lien entre les découvertes et la validation sur échantillons cliniques.
• Réduction des risques mécanistiques : Confirme la présence de la cible dans les tissus humains avant d'investir dans des systèmes modèles.

Intégration du pipeline et du flux de travail

Cette procédure s'inscrit dans le continuum de découverte en permettant l'analyse de tissus humains archivés avant l'identification du composé actif et la validation préclinique.

• Biologie de la découverte : Permet la vérification d'hypothèses sur l'activation de voies dans des échantillons tumoraux humains primaires.
• Depistage : Prépare les tissus pour des plateformes de dépistage de biomarqueurs nécessitant une morphologie intacte et une préservation des antigènes.
• Analytique : Produit des sections adaptées aux analyses d'imagerie quantitative et aux lectures en pathologie numérique.
• Recherche translationnelle : Assure la continuité entre la découverte de cibles et la corrélation avec des échantillons cliniques.
• Réutilisation en entreprise : Établit un protocole de préparation réutilisable pour plusieurs points finaux analytiques à travers différents projets.

Impact opérationnel et organisationnel

• Valeur scientifique : Renforce la confiance dans la pertinence de la cible grâce à l'analyse directe de tissus humains.
• Valeur opérationnelle : Permet un traitement standardisé des blocs FFPE pour une histologie à haut débit.
• Valeur stratégique : Réduit la dépendance aux modèles substituts en exploitant des échantillons cliniquement annotés.
• Impact sur le portefeuille : Éclaire les décisions d'avancement ou d'abandon en se basant sur l'expression de la cible dans des tissus provenant de patients.

Considérations relatives à la mise en œuvre

• Nécessite du personnel formé à l'histologie pour manipuler des coupes tissulaires fragiles.
• Dépend de l'accès à des solutions de xylène et d'éthanol, ainsi qu'à une ventilation adéquate et à une élimination appropriée des déchets.
• Exige des protocoles standardisés de durées pour éviter une sur- ou sous-traitement.
• Doit tenir compte de la variabilité de l'épaisseur des tissus lors de l'optimisation des durées d'incubation.
• Est limité par la dégradation des acides nucléiques et des protéines dans les blocs FFPE anciens, nécessitant une évaluation de contrôle qualité.

F.A.Q. sur la bio-industrie pharmaceutique