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Les anticorps neutralisants, ou NAbs, sont sécrétés par les cellules pour les protéger contre les virus envahisseurs.
Pour étudier les interactions des NAbs avec les virus, utilisez des particules de type viral modifiées, ou VLP. Ces structures de taille nanométrique contiennent un assemblage de protéines dérivées du virus sans matériel génétique viral, ce qui les rend non infectieuses. Les VLP sont entourées d’une bicouche lipidique intégrée de glycoprotéines d’enveloppe antigéniques, qui présentent un épitope neutralisant, une région spécialisée à laquelle les NAbs se lient.
Ajoutez les VLP dans un tube contenant des anticorps neutralisants liés à des billes magnétiques conjuguées aux protéines. Incuber sous agitation pour éviter que les billes ne se déposent. Au cours de l’incubation, la région épitopique des VLP reconnaît le paratope complémentaire sur la région Fab des NAbs, ce qui entraîne des complexes antigène-anticorps. Ceci, à son tour, aide les billes magnétiques à capturer les VLP.
Placez le tube dans un rack de séparation équipé d’un aimant puissant. Sous l’influence d’un champ magnétique, les billes complexées avec des VLP se déplacent vers l’aimant sans perturber l’interaction antigène-anticorps. Cette étape capture les VLP liées, tandis que celles dépourvues d’antigènes spécifiques restent dans le surnageant.
Jetez le surnageant et lavez la pastille avec un tampon de lavage pour éliminer les VLP non liés. Remettez en suspension les complexes de billes VLP dans un tampon d’élution, ce qui provoque le détachement des VLP des billes et leur apparition dans le surnageant.
Aspirez les VLP isolés affichant l’antigène dans un tube frais et stockez-les sous réfrigération pour une analyse plus approfondie.
Commencez par remettre les billes magnétiques en suspension en pipetant de haut en bas ou en mélangeant sur un rotateur à 50 tr/min pendant au moins 5 minutes.
Pendant ce temps, préparez la solution d’anticorps contenant les bNAbs. Utilisez 10 microgrammes de chaque bNAb et 200 microlitres de tampon de liaison et de lavage des anticorps par réaction. Pour chaque réaction, transférez 50 microlitres de la solution de billes magnétiques dans un tube réactionnel de 1,5 millilitre, puis placez les tubes sur le support de séparation magnétique.
Attendez que les billes se rassemblent sur la paroi du tube pour vous assurer que toutes les billes sont collectées, puis retirez le surnageant. Retirez l’aimant et suspendez les billes dans 200 microlitres de la solution bNAb préalablement préparée.
Incuber pendant 30 minutes à 3 heures, tout en mélangeant sur un rotateur à 50 tr/min à température ambiante. Après l’incubation, placez les tubes de réaction dans le support de séparation magnétique, attendez et retirez le surnageant.
Retirez les tubes de l’aimant et lavez les billes en les remettant en suspension dans 200 microlitres de tampon de liaison et de lavage des anticorps. Répétez le lavage avec un tampon de liaison d’anticorps et de lavage, en retirant autant de tampon de lavage que possible une fois terminé.
Ajoutez les échantillons aux bNAbs liés par des billes. Si le volume d’échantillon ajouté est inférieur à 1 millilitre, ajoutez du PBS pour ajuster le volume de l’échantillon à 1 millilitre, puis remettez les billes en suspension en pipetant doucement. Incuber les échantillons et les billes pendant 2,5 heures sur un rotateur à température ambiante, en veillant à ce que les billes restent en suspension et que la solution soit bien mélangée pendant l’incubation.
Placez les tubes sur l’aimant et retirez le surnageant. Ensuite, lavez les billes magnétiques en les suspendant dans 200 microlitres de tampon de lavage. Suspendez les billes dans 100 millilitres de tampon de lavage et transférez la suspension dans un tube de réaction propre et résistant à la chaleur. Placez le tube sur la grille de séparation magnétique et retirez complètement le surnageant.
Pour préparer des échantillons SDS-PAGE dénaturés, suspendez les billes dans 20 à 80 microlitres de tampon Laemmli et incubez à 95 degrés Celsius pendant 5 minutes. Procédez directement avec SDS-PAGE, en plaçant les tubes sur un support magnétique pour séparer les billes de la solution. Vous pouvez également stocker les échantillons à -20 degrés Celsius.