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Certains pathogènes bactériens à Gram négatif entrent en contact avec les cellules hôtes et utilisent des systèmes de sécrétion pour injecter des protéines effectrices, facilitant ainsi l’invasion cellulaire.
Pour administrer des protéines effectrices dans des cellules de mammifères in vitro, pipetez des cellules de mammifères dans une cuvette réfrigérée. Ajouter les protéines effectrices bactériennes marquées au peptide de liaison à la streptavidine et mélanger.
Effectuer l’électroporation. Pendant la course, de courtes impulsions électriques perturbent la bicouche lipidique de la membrane de la cellule hôte pour former des pores transitoires, facilitant l’entrée cellulaire des protéines effectrices. Placez les cellules sur une plaque de verre contenant un support, permettant aux cellules de récupérer et d’adhérer à la plaque. Les pores se referment, piégeant les protéines à l’intérieur.
Après la récupération cellulaire, fixez et perméabilisez les cellules pour permettre aux anticorps d’accéder aux cibles intracellulaires. Incuber avec une solution bloquante contenant des protéines pour éviter la liaison d’anticorps non spécifiques. Ajoutez des anticorps primaires qui se lient spécifiquement à l’étiquette peptidique de liaison à la streptavidine sur les protéines effectrices intracellulaires.
Introduire des anticorps secondaires marqués au fluorophore qui se lient aux anticorps primaires liés aux protéines effectrices pour la visualisation. Ajoutez de l’agglutinine de germe de blé conjuguée à des fluorophores et du DAPI pour colorer les glycoprotéines membranaires cellulaires et l’ADN, respectivement.
À l’aide d’un microscope confocal, visualisez les signaux de fluorescence des protéines effectrices, des membranes cellulaires et de l’ADN.
Les cellules électroporées avec succès présentent des signaux fluorescents intracellulaires significatifs provenant de protéines effectrices, suggérant leur localisation intracellulaire.
Pour commencer cette procédure, transférez 400 microlitres de suspension cellulaire dans une cuvette pré-refroidie, puis ajoutez 20 microgrammes de protéines sélectionnées pour atteindre une concentration finale de 50 microgrammes par millilitre. Agitez doucement la cuvette, environ 10 fois pour mélanger et éviter d’endommager les cellules. Après cela, séchez l’extérieur de la cuvette avec une serviette en papier pour éviter les arcs électriques dans l’électroporateur.
Placez l’échantillon dans l’électroporateur et réglez-le sur 0,3 kilovolts pendant 1,5 à 1,7 milliseconde. Immédiatement après l’électroporation, agitez doucement la cuvette, environ 10 fois, pour bien mélanger l’échantillon avant de procéder à la fixation et à la coloration par immunofluorescence ou à la purification par affinité.
Après quatre heures de récupération de l’électroporation, lavez les cellules avec du PBS stérile. Ensuite, fixez les cellules dans du méthanol à 100 % pendant deux minutes à température ambiante. Par la suite, lavez les cellules avec du PBS stérile trois fois de plus. Perméabiliser les cellules avec 0,4 % de Triton X-100 dans du PBS pendant 15 minutes. Ajustez la durée de perméabilisation et l’intensité de Triton X-100 en fonction de l’épitope et de l’emplacement de la protéine cible. Ensuite, bloquez les cellules avec 5 % de BSA dans du PBS pendant une heure à température ambiante.
Ensuite, lavez-les trois fois avec du PBS. Ensuite, incubez-les avec l’anticorps primaire dans la solution de liaison aux anticorps pendant la nuit, à 4 degrés Celsius avec un léger balancement.
Le lendemain, lavez les cellules quatre fois de plus avec du PBS. Ensuite, incubez-les avec l’anticorps secondaire conjugué par fluorescence approprié dans la solution de liaison aux anticorps. Ajoutez d’autres colorants au besoin, tels que 5 micromolaires d’agglutinine de germe de blé, ou WGA, conjugués à Alexa 647 ou DAPI pendant une heure à température ambiante et à l’abri de la lumière. Ensuite, lavez les cellules avec du PBS cinq fois et conservez-les à 4 degrés Celsius, à l’abri de la lumière jusqu’à ce qu’elles soient prêtes à être imagées.