Encyclopédie des expériences JoVE
Neurosciences
0 vues • 3:38 min • May 29th, 2025
Commencez par une carte du débit sanguin cérébral, ou CBF générée par imagerie par résonance magnétique-marquage du spin artériel, une méthode non invasive pour mesurer le flux sanguin dans le tissu cérébral.
Obtenez une image structurelle du cerveau et, à l’aide d’outils informatiques, segmentez les régions cérébrales en régions fonctionnelles.
Générez des vues triplanaires, montrant des images en coupe transversale du cerveau dans trois plans, chaque région segmentée étant affichée dans des couleurs distinctes pour représenter les zones fonctionnelles.
Intégrez les données CBF aux régions segmentées pour cartographier les valeurs de flux sanguin à des zones cérébrales spécifiques.
Les couleurs vives indiquent un flux sanguin élevé, tandis que les nuances chaudes représentent de faibles niveaux.
Utilisez des algorithmes pour traiter les données CBF et créez un atlas pour comparer les niveaux de flux sanguin dans les régions du cerveau.
La ligne rouge fluctuante met en évidence le FBC moyen dans toutes les régions, quantifiant le flux sanguin.
Les couleurs de l’atlas correspondent à la barre de couleur et représentent la probabilité des niveaux de flux sanguin dans des régions spécifiques du cerveau - le rouge indique une probabilité élevée, tandis que le bleu indique une probabilité faible.
Pour commencer, obtenez des données sur les patients dans l’initiative de technologie informatique de neuroimagerie, ou au format NIFTI. Dans un répertoire de travail personnalisé, accédez au répertoire hébergeant les données dans le répertoire de travail actuel de MATLAB et, à l’aide de la fonction de lecture NIFTI, chargez la récupération par inversion atténuée par fluide, ou FLAIR, dans l’espace de travail. Avec cette fonction de taille, vérifiez les dimensions de la séquence FLAIR. Ensuite, appelez la commande FLAIR slice pour afficher la séquence FLAIR du cerveau.
À l’aide de la barre de défilement inférieure, parcourez les différentes séquences. Ensuite, chargez et évaluez de la même manière le débit sanguin cérébral ou les séquences CBF. Dans l’espace de travail, appelez la fonction de segment FLAIR et exécutez le programme de segmentation d’images 3D U-Net pré-entraîné pour générer automatiquement des vues triplanaires de la segmentation des régions fonctionnelles cérébrales.
Chaque couleur représente une région fonctionnelle distincte. Pour une inspection en temps réel de différentes régions fonctionnelles cérébrales, cliquez et faites glisser le centre du réticule pour un examen 3D arbitraire de l’anatomie cérébrale reconstruite. Appuyez et faites glisser le bouton gauche de la souris sur n’importe quelle région des images pour modifier en temps réel les niveaux de luminosité et de contraste. Relâchez le bouton de la souris pour confirmer et finaliser les réglages.
Appelez la fonction triplanaire CBF pour générer la vue graphique triplanaire de l’interface utilisateur, affichant la distribution spatiale CBF entre les régions fonctionnelles. Déplacez le réticule pour permettre l’examen des distributions de CBF dans les régions d’intérêt. Ensuite, cliquez sur le bouton Data Tips dans le coin supérieur droit de l’interface pour afficher les valeurs CBF à n’importe quelle position.
Appuyez et faites glisser le bouton gauche de la souris sur n’importe quelle région des images pour modifier en temps réel les niveaux de luminosité et de contraste. Relâchez le bouton de la souris pour confirmer et finaliser les réglages. Exécutez la fonction Atlas CBF pour convertir la distribution spatiale CBF en Atlas CBF. Cliquez sur le bouton Zoom avant/arrière en haut à droite de l’interface.