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Commencez par une tranche cérébelleuse obtenue à partir du cerveau d’un raton postnatal dans une plaque multi-puits contenant du milieu.
Retirez le milieu et incubez la tranche dans une solution de colorant fluorescent cytoplasmique pour marquer les cellules granulaires (GC).
Transférez la tranche sur une membrane d’insertion transwell et retirez tout excès de colorant.
Retirez l’insert et remplissez le puits de support. Ensuite, replacez l’insert et ajoutez un support pour couvrir le tissu.
Incuber pour permettre au tissu de se fixer à la membrane de l’insert.
Transférez la plaque dans un incubateur fixé à un macroscope confocal et placez un couvercle en verre sur la plaque.
Réglez les conditions de culture, incubez davantage le tissu, puis commencez l’imagerie.
Lors de l’éclairage laser, les GC marqués deviennent fluorescents.
Capturez des images en accéléré pour visualiser la migration radiale des GC à travers la couche moléculaire du cervelet.
À l’aide d’un logiciel d’imagerie, analysez la distance migratoire des GC.
Après avoir tranché l’échantillon, utilisez une pipette à bulbe blanc tronqué pour les transférer avec un peu de HBSS dans une plaque à six puits. Chargez jusqu’à trois tranches dans chaque puits. Ensuite, après avoir vidé le support dans chaque puits chargé, ajoutez cinq millilitres de solution de chargement contenant 10 micromolaires de colorant fluorescent. Pour protéger les échantillons de la lumière, couvrez la plaque d’une feuille d’aluminium. Placez ensuite la plaque sur un mutateur réglé à 35 RPM. Laissez la plaque incuber pendant 10 minutes à température ambiante pour laisser le colorant étiqueter les cellules.
Maintenant, transférez les tranches comme précédemment dans la membrane d’un insert transwell qui a des pores de trois microns. Aspirez ensuite le milieu de chargement en ne laissant que les tranches. Maintenant, retirez l’insert et les tranches pour remplir le puits avec 1,9 millilitre de DMEM. Remettez ensuite l’insert et ajoutez encore 100 microlitres de DMEM pour couvrir les mouchoirs.
Incuber cette préparation pendant deux heures, après quoi les cellules granulaires seront visibles. Transférez la plaque sans le couvercle dans une chambre environnementale avec un flux de gaz constant sur un macroscope confocal. Ensuite, placez un couvercle en verre sur l’insert de la plaque du macroscope confocal. Pour les expériences en accéléré, laissez les cellules incuber dans la chambre pendant deux heures supplémentaires avant de continuer.
Pour visualiser la migration des cellules granulaires dans les tranches de tissu, éclairez la préparation avec une lumière de 488 nanomètres et utilisez un objectif sec 2X. Détecter les émissions de fluorescence de 500 à 530 nanomètres. À l’aide d’ImageJ, pour chaque image de la vidéo en accéléré, effectuez une projection de pile Z à l’aide du mode d’écart-type.
Ajustez le contraste et les niveaux de luminosité de chaque image afin que les cellules granulaires étiquetées soient faciles à voir. Maintenant, choisissez le plugin de suivi manuel dans le menu d’analyse des particules. Utilisez le plugin pour cliquer sur le point central de chaque corps de cellule étiqueté tout au long de la séquence d’images en accéléré. Exportez ensuite les données de suivi brutes vers une feuille de calcul pour une analyse plus approfondie.
Réorganisez les données de suivi brutes exportées d’ImageJ à l’aide d’un outil intelligent fait maison qui identifie chaque cellule et les positions associées. À l’aide du programme, calculez la distance totale parcourue et la vitesse moyenne de migration pour chaque cellule.