Quantification des épines dendritiques à l’aide de l’imagerie par microscopie confocale

Prenez des neurones pyramidaux qui sont transduits et immunomarqués en vert fluorescent.

Acquérez des images des neurones à l’aide d’un microscope confocal à balayage laser dont les paramètres sont ajustés pour assurer une qualité d’image optimale.

Ouvrez une image à l’aide d’un logiciel spécialisé et utilisez le filtre gaussien pour réduire le bruit de fond.

Effectuez un traçage semi-automatique des dendrites en estimant d’abord le diamètre des dendrites. Ensuite, sélectionnez le point de départ, le chemin d’accès et l’extrémité de la dendrite.

Pour la segmentation automatisée du spine, sélectionnez reconstruire le diamètre de la dendrite et définir le seuil de volume de dendrite pour représenter le volume de dendrite réel.

Spécifiez des valeurs pour le plus petit diamètre de tête de colonne vertébrale et la longueur maximale de la colonne vertébrale.

Ajustez le seuil des points représentant les épines, en veillant à ce qu’ils soient localisés sur les têtes réelles des épines.

Définissez des paramètres pour classer les épines en fonction de la longueur, du diamètre de la tête et de la forme.

Générez un modèle 3D de la dendrite avec des épines et exportez les données pour une analyse plus