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JoVE Journal Chemistry
Steady-state, Pre-steady-state, and Single-turnover Kinetic Measurement for DNA Glycosylase Activity

L'état d'équilibre des mesures cinétiques, pré-état stationnaire, et un seul chiffre d'affaires de l'activité de ADNglycosylase

Full Text
19,958 Views
14:27 min
August 19, 2013

DOI: 10.3791/50695-v

Akira Sassa1, William A. Beard1, David D. Shock1, Samuel H. Wilson1

1Laboratory of Structural Biology,NIEHS, National Institutes of Health

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

des plages de temps pour l'activité glycosylase de 8-oxoguanine ADN glycosylase sont biphasique présentant une salve de formation de produit et une phase de régime permanent linéaire. Utilisant des techniques de trempe de trésorerie, l'éclatement et les taux de régime permanent peut être mesurée, qui correspondent à l'excision de 8 oxoguanine et la libération de la glycosylase de l'ADN du produit, respectivement.

L’objectif général de l’expérience suivante est de déterminer les taux d’excision et de libération de produit pour l’excision et la libération de produit pour l’OXO Guine glycosylate d’ADN humain à l’aide de techniques cinétiques rapides. Ceci est réalisé en mesurant d’abord une évolution temporelle à l’état stationnaire avec une faible concentration enzymatique pour déterminer si une phase rapide se produit lors du premier renouvellement. Si le premier renouvellement est rapide, l’évolution temporelle à l’état d’équilibre n’extrapole pas à zéro, mais reflète plutôt la concentration enzymatique active comme deuxième étape.

Le taux de formation du produit pendant l’état pré-stationnaire peut être mesuré par des techniques de mélange et de trempe rapides avec une concentration enzymatique plus élevée pour observer une quantité importante de produit lors du premier retournement. Ensuite, l’étape chimique peut également être surveillée dans des conditions de renouvellement unique où le substrat est saturé d’enzymes. Afin d’isoler les événements au site actif de l’enzyme sans cycle catalytique, les résultats montrent que la libération du produit de l’enzyme est limitée en termes de vitesse pendant l’état stationnaire, sur la base de l’observation que le cours temporel n’extrapole pas à un produit nul à temps zéro.

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Chimie Numéro 78 biochimie génétique biologie moléculaire microbiologie biologie structurale biologie chimique Eucaryotes acides aminés peptides et protéines acides nucléiques les nucléotides et nucléotides des enzymes et coenzymes Life Sciences (général) enzymologie rapide trempe-flow le titrage du site actif l'état d'équilibre un seul chiffre d'affaires hors d'équilibre cinétique la réparation par excision de base l'ADN glycosylase 8-oxo-7 8-dihydroguanine 8 oxoG le séquençage

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