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DOI: 10.3791/63456-v
Hidetaka Ohnuki1, David J. Venzon2, Alexei Lobanov3,4, Giovanna Tosato1
1Laboratory of Cellular Oncology, Center for Cancer Research, National Cancer Institute,National Institutes of Health, 2Biostatistics and Data Management Section, Center for Cancer Research, National Cancer Institute,National Institutes of Health, 3CCR Collaborative Bioinformatics Resource (CCBR), Center for Cancer Research, National Cancer Institute,National Institutes of Health, 4Advanced Biomedical Computational Science,Frederick National Laboratory for Cancer Research sponsored by the National Cancer Institute
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Le présent protocole décrit une méthode unicellulaire pour les analyses épigénomiques itératives utilisant une cellule unique réutilisable. La cellule unique réutilisable permet d’analyser plusieurs marques épigénétiques dans la même cellule unique et de valider statistiquement les résultats.
Cette méthode expérimentale permet le stockage à long terme des cellules individuelles réutilisables pour les tests épigénomiques. Il permet également l’analyse de nombreuses marques épigénétiques et facteurs de transcription dans une même cellule. Dans les méthodes actuelles d’analyse épigénome unicellulaire, les mêmes cellules individuelles ne peuvent pas être réanalysées.
Cependant, avec des cellules uniques réutilisables, les mêmes cellules individuelles peuvent être réanalysées plusieurs fois. Cette technique est utile pour le diagnostic et la conception de la thérapie épigénétique, en particulier lorsque les cellules des patients sont limitées en nombre. Cette méthode est la plus appropriée pour l’étude de l’épigénome, la régulation de l’expression génique et d’autres systèmes tant que des anticorps spécifiques pour les marques épigénétiques sont disponibles.
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