ईएससी के भेदभाव संरचना में सेल प्रकार विशिष्ट परिवर्तन और chromatin की संरचना के साथ मेल खाता है. उन परिवर्तनों का पता लगाने तंत्र है कि stemcellness और सेल भेदभाव को परिभाषित करने में बहुमूल्य अंतर्दृष्टि प्रदान करता है. Chromatin immunoprecipitation (चिप) एक मूल्यवान आणविक स्टेम सेल भेदभाव अंतर्निहित तंत्र को काटना विधि का प्रतिनिधित्व करता है.