איזומריזם מבני

איזומרים הם תרכובות עם אותה נוסחה מולקולרית אך בעלי סידור מבנה שונה. לכל איזומר יש תכובות פיזיקליות וכימיות מובהקות. בתרכובות קוארדינטיביות, סוג אחד של איזומריות שנצפה הוא איזומריות מבנית.

באיזומריות מבנית, הקישוריות של האטומים לאטום המתכת המרכזי שונה, למרות שיש להם אותה נוסחה מולקולרית. ניתן להמשיך לסווג את האיזומרים לאיזומרים של ספרת קואורדינציה לעומת איזומרים של קישור. איזומרים של ספרת קואורדינציה מתקיימים כשהליגנדה הקוארדינטיבית למתכת המרכזית בספרת הקוארדינציה מחליפה מקום עם יון מנוגד בסריג.

לכן, בעוד שמספר הקואורדינציה של יון המתכת נשאר קבוע, ההרכב של ספרת הקואורדינציה והתרכובת משתנה. בקומפלקס הקוארדינטיבי של קובלט, האיזומרים של ספרת הקואורדינציה יכולים להתקיים עם ליגנדת ברום או כלור. כיוון שהרכב התרכובת שונה, לכל אחד מהאיזומרים הללו יש תכונות כימיות שונות.

כשפנטאמינברומוקובלט כלוריד מומס במים, הוא יוצר יוני כלור בעוד שבפנטאמינברומוקובלט ברומיז יוצר יוני ברום בתמיסה. לעומת זאת, איזומריות קישור נוצרת כשליגנדה יכול להיות קוארדינטיבית עם אטום המתכת המרכזי בשני כיוונים שונים. לכן, ליגנדות מונודנטטיות עם יותר מאטום תורם פוטנציאלי אחד יכולות ליצור איזומריות קישור.

שם הליגנדה משתנה על פי האטום התורם הקוארדינטיבי עם יון המתכת. ליון החנקית יש שני זוגות אלקטרונים בודדים, אחד באטום החנקן והשני באטום החמצן. כל אחד מהם יכול ליצור קשר קואורדינציה קוולנטי עם יון המתכת המרכזי.

כשיון החנקן מתואם באמצעות זוג האלקטרונים הבודדים באטום החנקן, הוא מכונה ליגנדת ניטרו. כשאטום החמצן משמש כתורם, הוא מכונה ליגנדת ניטריטו. לקומפלקסי קואורדינציה של מתכת קובלט עם יוני חנקן יש שני איזומרי קישור אפשריים, פנטה אמינניטרוקובלט צהוב ופנטה אמינניטריטוקובלט כתום.