10.4: כריכה שיתופית של רגולטורי תמלול

מווסתי שעתוק נקשרים לרצפים ספציפיים של CIS רגולטוריים בדנ”א כדי לווסת את שעתוק הגנים. רצפים אלה קצרים מאוד, בדרך כלל פחות מעשרה זוגות נוקלאוטידים. האורך הקצר פירושו שיש סבירות גבוהה שאותו רצף בדיוק יתרחש באופן אקראי ברחבי הגנום. מכיוון שרגולטורים יכולים גם להיקשר לקבוצות של רצפים דומים, זה מגדיל עוד יותר את הסיכויים לקשירה אקראית. וסתי שעתוק יוצרים דימרים הנקשרים לרצף ארוך פי שניים מזה שמונומר נקשר, מגדילים את הרצפים ומפחיתים את הסיכויים לקשירה אקראית. דימרים של וסת תמלול יכולים להיות הומודימרים או הטרודימרים. כפתרון, רגולטורים שיתופיים אלה קיימים כמונומרים או כדימרים בעלי קשרים חלשים. עם זאת, כאשר מונומרים אלה נקשרים לרצף מורחב של ויסות CIS על הדנ”א, הם יוצרים דימרים יציבים.

קואופרטיביות היא תופעה שבה קשירה של חלבון מונומרי גורמת לשינויים מבניים בדנ”א ומגדילה את הזיקה של אתרי הבקרה למונומרים אחרים. זה מאפשר למונומרים להיקשר כדימרים על רצף cis-regulatory . תופעה זו גם מסייעת לרגולטורים לגשת לאתרים הממוקמים על גבי דנ”א הקשור באופן הדוק לחלבוני היסטון בנוקלאוזום, שאחרת לא היו נגישים. הקשירה הראשונה מתרחשת בדרך כלל בדנ”א בקצה הנוקלאוזום, שם הוא אינו קשור היטב. קשירה באתר זה מובילה לכך שהדנ”א מתרחק מההיסטונים, ובכך מוביל לפריקת הנוקלאוזום. פריקה זו מגדילה את הגישה לאתרי הרגולציה האחרים. באיקריוטים, קשירת גורם השעתוק תלויה בעיקר בקואופרטיביות. למרות שקואופרטיביות יכולה להתרחש במקרים מסוימים, רוב הכריכה של רגולטורי שעתוק בפרוקריוטים אינה שיתופית. במקרים כאלה, הרגולטורים קיימים כדימרים יציבים המוחזקים יחד על ידי מספר אינטראקציות לא קוולנטיות.

ניתן לקבוע אם וסת לא ידוע נקשר בשיתוף פעולה או שלא בשיתוף פעולה על ידי שרטוט מספר אתרי הקישור הכבושים בדנ”א כנגד ריכוז החלבון. אם העקומה היא עקומה בצורת S, היא מציינת שהרגולטור נקשר בשיתוף פעולה לאתרי הקשירה. אם העקומה עולה בהתמדה לפני שהיא יורדת כשהיא מתקרבת לכל אתרי הקשירה הכבושים, הדבר מצביע על כך שהקשירה אינה שיתופית.